Rev-ErbA альфа - Rev-ErbA alpha
Rev-ErbA альфа также известен как NR1D1 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа D, член 1), представляет собой белок что у людей кодируется NR1D1 ген.[5]
Rev-erbα является членом Rev-ErbA семья ядерные рецепторы и является транскрипционный репрессор.[6] У млекопитающих Rev-erbα высоко экспрессируется в печени, скелетных мышцах, жировой ткани и мозге, участвуя в разработка и циркадный регуляция этих тканей.[7][8]
Структура генов и белков
Rev-erbα транскрибируется с противоположной цепи рецептор щитовидной железы α (c-erbAα) на хромосоме 17 с перекрытием 269 нуклеотидов между двумя транскриптами.[6] Другое млекопитающее изоформа рецептора, Rev-erbβ кодируется другим геном на хромосоме 3. Кроме того, существует один гомолог, не относящийся к млекопитающим, ген E75, регулируемый экдизоном, который присутствует в Дрозофила и C. elegans. Сам ген Rev-erbα имеет несколько стенограммы. Два промотора регулируют экспрессию гена Rev-erbα у человека и крысы, генерируя два мРНК изоформы. Полноразмерная изоформа кодирует белок из 614 аминокислот, а вторая изоформа генерируется из внутреннего промотора и дает белок, который короче на 106 аминокислот. Обе изоформы мРНК Rev-erbα содержат E-боксы, а также ответные элементы Rev-erbα, что означает, что они могут регулироваться циркадным образом посредством BMAL и белки Rev-erba. Фактически, оба транскрипта проявляют ритмическую экспрессию в фибробластах, синхронизированных с сывороткой.
Белок Rev-erbα структурно уникален от других ядерных рецепторов тем, что в нем отсутствует спираль 12 (H12) в его лиганд-связывающем домене, который обычно отвечает за формирование лиганд-связывающего кармана в других ядерных рецепторах. Вместо отсутствующего H12, Rev-erbα отображает гидрофобный интерфейс, который связывает корепрессор N-CoR, что делает его мощным репрессором транскрипции.[9] Все члены семьи Рев-Эрб связывают гем, которые могут действовать как лиганд, регулируя их транскрипционную активность.[10]
Физиологическая функция
Rev-erbα регулирует транскрипцию гена путем прямого связывания с элементами ответа-мишени (RevRE) и включает A / T-богатый фланг, за которым следует AGGTCA. Rev-erbα опосредует репрессию, рекрутируя корепрессор N-CoR, который затем активирует гистоновая деацетилаза (HDAC) 3. Ряд генов-мишеней был идентифицирован для Rev-erbα, включая липопротеины. ApoA1 и ApoCIII, гидратаза дегидрогеназа, циркадный фактор BMAL, и антифибринолитический фактор PAI-1.[11] Многие из этих генов координированно регулируются Rev-erbα и орфанным рецептором, связанным с RAR. RORα, которые имеют одинаковые ответные элементы, но оказывают противоположное влияние на транскрипцию генов. Перекрестные помехи между Rev-erbα и RORα, вероятно, действуют для точной настройки их целевых физиологических сетей, таких как циркадные ритмы, метаболический гомеостаз и т. Д.[12] и воспаление.[13]
МРНК Rev-erbα индуцируется во время адипогенеза и высоко экспрессируется в жировая ткань.[14] Одно исследование показало, что избыточная экспрессия Rev-erbα может усиливать адипогенез у культивируемых мышей. адипоциты, но механизм этого эффекта еще предстоит выяснить.[15] Совсем недавно исследование показало, что делеция Rev-erbα у мышей изменяет метаболизм глюкозы и липидов и приводит к ожирению.[16]
Экспрессия Rev-erbα также регулируется на посттрансляционном уровне: он фосфорилируется на аминоконце киназой гликогенсинтазы (GSK 3β ), что способствует стабильности его белка. Было показано, что литий, который ингибирует GSK3β, может дестабилизировать белок Rev-erbα и влиять на его функцию в циркадных часах.[17] Это может частично объяснить терапевтическое действие лития на циркадные заболевания, такие как биполярное расстройство.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126368 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020889 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Лазар М.А., Джонс К.Э., Чин В.В. (март 1990 г.). «Выделение кДНК, кодирующей человеческий Rev-ErbA альфа: транскрипция из некодирующей цепи ДНК гена рецептора тироидного гормона приводит к получению родственного белка, который не связывает тироидный гормон». ДНК и клеточная биология. 9 (2): 77–83. Дои:10.1089 / dna.1990.9.77. PMID 1971514.
- ^ а б Лазар М.А., Ходин Р.А., Кардона Г., Чин В.В. (август 1990 г.). «Экспрессия гена из геномного локуса c-erbA альфа / Rev-ErbA альфа. Возможная регуляция альтернативного сплайсинга посредством транскрипции противоположной цепи». Журнал биологической химии. 265 (22): 12859–63. PMID 2165488.
- ^ Прейтнер Н., Дамиола Ф., Лопес-Молина Л., Закани Дж., Дубул Д., Альбрехт Ю., Шиблер Ю. (июль 2002 г.). «Орфанный ядерный рецептор REV-ERBalpha контролирует циркадную транскрипцию в положительной части циркадного осциллятора млекопитающих». Клетка. 110 (2): 251–60. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00825-5. PMID 12150932. S2CID 15224136.
- ^ Triqueneaux G, Thenot S, Kakizawa T., Antoch MP, Safi R, Takahashi JS, Delaunay F, Laudet V (декабрь 2004 г.). «Ген орфанного рецептора Rev-erbalpha является мишенью для кардиостимулятора циркадных часов». Журнал молекулярной эндокринологии. 33 (3): 585–608. Дои:10.1677 / jme.1.01554. ЧВК 3770723. PMID 15591021.
- ^ Woo EJ, Jeong DG, Lim MY, Jun Kim S, Kim KJ, Yoon SM, Park BC, Ryu SE (октябрь 2007 г.). «Структурное понимание конститутивной репрессивной функции ядерного рецептора Rev-erbbeta». Журнал молекулярной биологии. 373 (3): 735–44. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.08.037. PMID 17870090.
- ^ Рагурам С., Стейрук К.Р., Хуанг П., Роджерс П.М., Нози А.К., МакКлюр Д. Б., Баррис Л. Л., Хорасанизаде С., Беррис Т. П., Растинежад Ф. (декабрь 2007 г.). «Идентификация гема как лиганда орфанных ядерных рецепторов REV-ERBalpha и REV-ERBbeta». Структурная и молекулярная биология природы. 14 (12): 1207–13. Дои:10.1038 / nsmb1344. ЧВК 2743565. PMID 18037887.
- ^ Ван Дж, Инь Л., Лазар М.А. (ноябрь 2006 г.). «Орфанный ядерный рецептор Rev-erb альфа регулирует циркадную экспрессию ингибитора активатора плазминогена типа 1». Журнал биологической химии. 281 (45): 33842–8. Дои:10.1074 / jbc.M607873200. PMID 16968709.
- ^ Делези Дж., Шале E (декабрь 2011 г.). «Взаимодействие между метаболизмом и циркадными часами: взаимные нарушения». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1243: 30–46. Дои:10.1111 / j.1749-6632.2011.06246.x. PMID 22211891. S2CID 43621902.
- ^ Форман Б.М., Чен Дж., Блумберг Б., Кливер С.А., Хеншоу Р., Онг Е.С., Эванс Р.М. (сентябрь 1994 г.). «Перекрестный разговор между ROR альфа 1 и семейством орфанных ядерных рецепторов Rev-erb». Молекулярная эндокринология. 8 (9): 1253–61. Дои:10.1210 / me.8.9.1253. PMID 7838158.
- ^ Fontaine C, Dubois G, Duguay Y, Helledie T, Vu-Dac N, Gervois P, Soncin F, Mandrup S, Fruchart JC, Fruchart-Najib J, Staels B (сентябрь 2003 г.). «Орфанный ядерный рецептор Rev-Erbalpha представляет собой гамма-ген-мишень рецептора, активируемого пролифератором пероксисом (PPAR), и способствует индуцированной PPAR-гамма дифференцировке адипоцитов». Журнал биологической химии. 278 (39): 37672–80. Дои:10.1074 / jbc.M304664200. PMID 12821652.
- ^ Чавла А., Лазар М.А. (август 1993 г.). «Индукция Rev-ErbA альфа, орфанного рецептора, кодируемого на противоположной цепи гена рецептора альфа-тироидного гормона, во время дифференцировки адипоцитов». Журнал биологической химии. 268 (22): 16265–9. PMID 8344913.
- ^ Делези Дж., Дюмон С., Дарденте Х., Ударт Х., Гречес-Кассиау А., Клозен П., Тебул М., Делоне Ф., Петет П., Шале E (август 2012 г.). «Ядерный рецептор REV-ERBα необходим для ежедневного баланса углеводного и липидного обмена». Журнал FASEB. 26 (8): 3321–35. Дои:10.1096 / fj.12-208751. PMID 22562834. S2CID 31204290.
- ^ Инь Л., Ван Дж., Кляйн П.С., Лазар М.А. (февраль 2006 г.). «Ядерный рецептор Rev-erbalpha - критический литий-чувствительный компонент циркадных часов». Наука. 311 (5763): 1002–5. Дои:10.1126 / science.1121613. PMID 16484495. S2CID 11240826.
дальнейшее чтение
- Лауде В., Бег А., Анри-Дютуа С., Джубель А., Мартин П., Штехелин Д., Сауле С. (март 1991 г.). «Геномная организация гена рецептора гормона щитовидной железы человека альфа (c-erbA-1)». Исследования нуклеиновых кислот. 19 (5): 1105–12. Дои:10.1093 / nar / 19.5.1105. ЧВК 333788. PMID 1850510.
- Миядзима Н., Хориучи Р., Сибуя Ю., Фукусигэ С., Мацубара К., Тоошима К., Ямамото Т. (апрель 1989 г.). «Два гомолога erbA, кодирующие белки с разной способностью связывания Т3, транскрибируются с противоположных цепей ДНК одного и того же генетического локуса». Клетка. 57 (1): 31–9. Дои:10.1016/0092-8674(89)90169-4. PMID 2539258. S2CID 19135678.
- Адельман Г., Бег А., Стелин Д., Лауде В. (апрель 1996 г.). «Функциональный реагирующий на альфа Rev-erb элемент, расположенный в промоторе человеческого альфа-рев-erb, опосредует репрессивную активность». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (8): 3553–8. Дои:10.1073 / пнас.93.8.3553. ЧВК 39648. PMID 8622974.
- Доунс М., Берк Л.Дж., Бейли П.Дж., Маскат Г.Е. (ноябрь 1996 г.). «Два домена взаимодействия рецепторов в корепрессоре, N-CoR / RIP13, необходимы для эффективного взаимодействия с Rev-erbA альфа и RVR: физическая ассоциация зависит от области E сиротских рецепторов». Исследования нуклеиновых кислот. 24 (22): 4379–86. Дои:10.1093 / nar / 24.22.4379. ЧВК 146280. PMID 8948627.
- Берк Л.Дж., Даунс М., Лауде В., Маскат Г.Е. (февраль 1998 г.). «Идентификация и характеристика новой области взаимодействия корепрессора в RVR и Rev-erbA альфа». Молекулярная эндокринология. 12 (2): 248–62. Дои:10.1210 / мэ.12.2.248. PMID 9482666.
- Чжао К., Хорасанизаде С., Миёши Ю., Лазар М.А., Растинежад Ф. (май 1998 г.). «Структурные элементы комплекса орфанных ядерных рецепторов-ДНК». Молекулярная клетка. 1 (6): 849–61. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80084-2. PMID 9660968.
- Сирк М.Л., Чжао К., Растинежад Ф. (октябрь 2001 г.). «Деформируемость ДНК как признак распознавания в элементе реверберации». Биохимия. 40 (43): 12833–43. Дои:10.1021 / bi011086r. PMID 11669620.
- Косте Х., Родригес Дж.С. (июль 2002 г.). «Рецептор орфанного ядерного гормона Rev-erbalpha регулирует промотор аполипопротеина CIII человека». Журнал биологической химии. 277 (30): 27120–9. Дои:10.1074 / jbc.M203421200. PMID 12021280.
- Делерив П., Чин В.В., Суен С.С. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация Reverb (альфа) как нового гена-мишени ROR (альфа)». Журнал биологической химии. 277 (38): 35013–8. Дои:10.1074 / jbc.M202979200. PMID 12114512.
- Raspè E, Mautino G, Duval C, Fontaine C, Duez H, Barbier O, Monte D, Fruchart J, Fruchart JC, Staels B (декабрь 2002 г.). «Транскрипционная регуляция экспрессии человеческого гена Rev-erbalpha с помощью орфанного ядерного рецептора, орфанного рецептора альфа, родственного ретиноевой кислоте». Журнал биологической химии. 277 (51): 49275–81. Дои:10.1074 / jbc.M206215200. PMID 12377782.
- Raspé E, Duez H, Mansén A, Fontaine C, Fiévet C, Fruchart JC, Vennström B, Staels B (декабрь 2002 г.). «Идентификация Rev-erbalpha как физиологического репрессора транскрипции гена апоС-III». Журнал липидных исследований. 43 (12): 2172–9. Дои:10.1194 / мл. M200386-JLR200. PMID 12454280.
- Шопен-Деланнуа С., Тено С., Делоне Ф., Бузин Е, Бег А., Дютерк-Кокийо М., Лауде В. (апрель 2003 г.). «Специфический и необычный сигнал ядерной локализации в ДНК-связывающем домене орфанных рецепторов Rev-erb». Журнал молекулярной эндокринологии. 30 (2): 197–211. Дои:10.1677 / jme.0.0300197. PMID 12683943.
- Fontaine C, Dubois G, Duguay Y, Helledie T, Vu-Dac N, Gervois P, Soncin F, Mandrup S, Fruchart JC, Fruchart-Najib J, Staels B (сентябрь 2003 г.). «Орфанный ядерный рецептор Rev-Erbalpha представляет собой гамма-ген-мишень рецептора, активируемого пролифератором пероксисом (PPAR), и способствует индуцированной PPAR-гамма дифференцировке адипоцитов». Журнал биологической химии. 278 (39): 37672–80. Дои:10.1074 / jbc.M304664200. PMID 12821652.
- Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P, Kan Z, Loerch PM, Armor CD, Santos R, Schadt EE, Stoughton R, Shoemaker DD (декабрь 2003 г.). «Полногеномный обзор альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с помощью микрочипов соединения экзонов». Наука. 302 (5653): 2141–4. CiteSeerX 10.1.1.1017.9438. Дои:10.1126 / science.1090100. PMID 14684825. S2CID 10007258.
- Мигита Х., Морсер Дж., Каваи К. (март 2004 г.). «Rev-erbalpha активирует NF-kappaB-чувствительные гены в гладкомышечных клетках сосудов». Письма FEBS. 561 (1–3): 69–74. Дои:10.1016 / S0014-5793 (04) 00118-8. PMID 15013753. S2CID 84456190.
- Cheng H, Khanna H, Oh EC, Hicks D, Mitton KP, Swaroop A (август 2004 г.). «Фоторецептор-специфический ядерный рецептор NR2E3 функционирует как активатор транскрипции в палочковидных фоторецепторах». Молекулярная генетика человека. 13 (15): 1563–75. Дои:10,1093 / hmg / ddh173. PMID 15190009.
- Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
внешняя ссылка
- NR1D1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
PDB галерея | |
|---|---|
|
