RUNX3 - Википедия - RUNX3

RUNX3
Идентификаторы
Псевдонимы	RUNX3, AML2, CBFA3, PEBP2aC, фактор транскрипции 3, родственный runt, фактор транскрипции 3 семейства RUNX
Внешние идентификаторы	OMIM: 600210 MGI: 102672 ГомолоГен: 37914 Генные карты: RUNX3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	24,965,121 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	135,177,990 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание АТФ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядерный хроматин; • ядро клетки; • ядрышко; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • нуклеоплазма; • цитозоль; • комплекс фактора связывания ядра;
Биологический процесс	• развитие нейронов периферической нервной системы; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • дифференцировка хондроцитов; • окостенение; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция клеточного цикла; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • фосфорилирование белков; • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток; • регулирование дифференцировки клеток; • реакция на трансформирующий фактор роста бета; • кроветворение; • отрицательная регуляция дифференцировки CD4-положительных, альфа-бета Т-клеток; • положительная регуляция дифференцировки CD8-позитивных альфа-бета Т-клеток; • дифференциация нейронов;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	864
	12399
	ENSG00000020633
	ENSMUSG00000070691
	Q13761
	Q64131
	NM_001031680; NM_004350; NM_001320672
	NM_019732; NM_001369050
	NP_001026850; NP_001307601; NP_004341
	NP_062706; NP_001355979
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Связанный с Runt фактор транскрипции 3 это белок что у людей кодируется RUNX3 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует члена семейства транскрипционных факторов, содержащего домен runt. Гетеродимер этого белка и бета-субъединица образуют комплекс, который связывается с основной последовательностью ДНК 5'-YGYGGT-3 ', обнаруженной в ряде энхансеров и промоторов,^[6] и может активировать или подавлять транскрипцию. Он также взаимодействует с другими факторами транскрипции. Он действует как опухолевый супрессор, и при раке ген часто удаляется или транскрипционно заглушается. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена RUNX3 может регулироваться MITF.^[8]

Нокаутирующая мышь

Слизистая оболочка желудка мыши Runx3 null демонстрирует гиперплазию из-за стимулированной пролиферации и подавления апоптоз в эпителиальных клетках, и клетки устойчивы к стимуляции TGF-бета.^[9]

Противоречие RUNX3

В 2011 году было высказано серьезное сомнение в отношении способности Runx3 подавлять опухоли, что было основано на более ранней публикации Ли и его сотрудников.^[10]На основании оригинального исследования Ли и соавторов (2002), в большинстве более поздних публикаций, цитирующих Ли и соавторов (2002), предполагается, что RUNX3 экспрессируется в нормальном эпителии кишечника и, следовательно, может действовать как супрессор опухоли при конкретном исследованном эпителиальном раке. В большей части этой литературы статус метилирования промотора RUNX3 при различных раковых заболеваниях используется в качестве заместителя для его экспрессии. Однако известно, что довольно много генов метилировано в геномах опухолевых клеток, и большинство этих генов не экспрессируются в нормальной ткани, являющейся источником этих видов рака. Другие использовали плохо охарактеризованные (или полностью признанные недействительными) антитела для обнаружения белка RUNX3, или использовали ОТ-ПЦР или проверенные антитела и не смогли обнаружить RUNX3 в эпителии кишечника, но все же не подвергли сомнению первоначальное открытие Ли и его сотрудников (2002). . Эти факты недавно обсуждались в книге Юло Майвяли.^[11]

Взаимодействия

RUNX3 был показан взаимодействовать с TLE1.^[12]

Смотрите также

дальнейшее чтение

Вогиаци П., Де Фалько Дж., Клаудио П. П., Джордано А. (апрель 2006 г.). «Как ген RUNX3 человека вызывает апоптоз при раке желудка? Последние данные, размышления и реакции». Биология и терапия рака. 5 (4): 371–4. Дои:10.4161 / cbt.5.4.2748. PMID 16627973.
Вейменга К., Спек Н. А., Дракополи, Северная Каролина, Хофкер М. Х., Лю П., Коллинз Ф. С. (апрель 1995 г.). «Идентификация нового гена Cbfa3, содержащего домен мышиного корня, и локализация человеческого гомолога CBFA3 в хромосоме 1p35-pter». Геномика. 26 (3): 611–4. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80185-О. PMID 7607690.
Bae SC, Takahashi E, Zhang YW, Ogawa E., Shigesada K, Namba Y, Satake M, Ito Y (июль 1995 г.). «Клонирование, картирование и экспрессия PEBP2 alpha C, третьего гена, кодирующего Runt-домен млекопитающих». Ген. 159 (2): 245–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (95) 00060-Дж. PMID 7622058.
Bae SC, Yamaguchi-Iwai Y, Ogawa E, Maruyama M, Inuzuka M, Kagoshima H, Shigesada K, Satake M, Ito Y (март 1993 г.). «Выделение кДНК PEBP2 альфа B, представляющей мышиный гомолог гена острого миелоидного лейкоза человека AML1». Онкоген. 8 (3): 809–14. PMID 8437866.
Леванон Д., Гольдштейн Р. Э., Бернштейн Ю., Тан Х, Гольденберг Д., Стифани С., Паруш З., Гронер Ю. (сентябрь 1998 г.). «Репрессия транскрипции с помощью AML1 и LEF-1 опосредуется корепрессорами TLE / Groucho». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (20): 11590–5. Bibcode:1998PNAS ... 9511590L. Дои:10.1073 / пнас.95.20.11590. ЧВК 21685. PMID 9751710.
Bangsow C, Rubins N, Glusman G, Bernstein Y, Negreanu V, Goldenberg D, Lotem J, Ben-Asher E, Lancet D, Levanon D, Groner Y (ноябрь 2001 г.). «Ген RUNX3 - последовательность, структура и регулируемая экспрессия». Ген. 279 (2): 221–32. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00760-0. PMID 11733147.
Ваки Т., Тамура Дж., Сато М., Терашима М., Нисизука С., Мотояма Т. (апрель 2003 г.). «Статус метилирования промотора генов DAP-киназы и RUNX3 в неопластическом и неопухолевом желудочном эпителии». Наука о раке. 94 (4): 360–4. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2003.tb01447.x. PMID 12824905. S2CID 22030810.
Пуиг-Крегер А., Санчес-Эльснер Т., Руис Н., Андреу Э. Дж., Проспер Ф., Йенсен У.Б., Гил Дж., Эриксон П., Драбкин Х., Гронер Ю., Корби А.Л. (ноябрь 2003 г.). «Факторы RUNX / AML и C / EBP регулируют экспрессию интегрина CD11a в миелоидных клетках через перекрывающиеся регуляторные элементы». Кровь. 102 (9): 3252–61. Дои:10.1182 / кровь-2003-02-0618. HDL:10171/18733. PMID 12855590.
Като Н., Тамура Дж., Фукасе М., Сибуя Х., Мотояма Т. (август 2003 г.). «Гиперметилирование промотора гена RUNX3 в опухоли желточного мешка яичка у младенцев». Американский журнал патологии. 163 (2): 387–91. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63668-1. ЧВК 1868235. PMID 12875960.
Ян Н, Чжан Л., Чжан И, Казазян Х. Х. (август 2003 г.). «Важная роль RUNX3 в транскрипции и ретротранспозиции L1 человека». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (16): 4929–40. Дои:10.1093 / нар / gkg663. ЧВК 169909. PMID 12907736.
Ли КЛ, Ким Х.Р., Ким В.Дж., Чой Дж.К., Ли Й.Х., Ким Х.М., Ли Л.С., Ким Х., Чанг Дж., Ито И, Юл Ли К., Бэ СК (январь 2004 г.). «Транскрипционное молчание гена RUNX3 гиперметилированием CpG связано с раком легких». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 314 (1): 223–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.079. PMID 14715269.
Сяо WH, Лю WW (февраль 2004 г.). «Гемизиготная делеция и гиперметилирование гена RUNX3 при гепатоцеллюлярной карциноме». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 10 (3): 376–80. Дои:10.3748 / wjg.v10.i3.376. ЧВК 4724901. PMID 14760761.
Осимо Й, Оуэ Н, Митани Й, Накаяма Х, Китадай Й, Йошида К., Ито Й, Чаяма К., Ясуи В. (2004). «Частая потеря экспрессии RUNX3 из-за гиперметилирования промотора при карциноме желудка». Патобиология. 71 (3): 137–43. Дои:10.1159/000076468. PMID 15051926. S2CID 25618007.
Jin YH, Jeon EJ, Li QL, Lee YH, Choi JK, Kim WJ, Lee KY, Bae SC (июль 2004 г.). «Трансформирующий фактор роста-бета стимулирует p300-зависимое ацетилирование RUNX3, что ингибирует опосредованное убиквитинирование деградацию». Журнал биологической химии. 279 (28): 29409–17. Дои:10.1074 / jbc.M313120200. PMID 15138260.
Ku JL, Kang SB, Shin YK, Kang HC, Hong SH, Kim IJ, Shin JH, Han IO, Park JG (сентябрь 2004 г.). «Гиперметилирование промотора подавляет экспрессию гена RUNX3 в клеточных линиях колоректального рака». Онкоген. 23 (40): 6736–42. Дои:10.1038 / sj.onc.1207731. PMID 15273736.
Сакакура С., Хагивара А., Миягава К., Накашима С., Йошикава Т., Кин С., Накасе И., Ито К., Ямагиши Н., Ядзуми С., Чиба Т., Ито Ю. (январь 2005 г.). «Частое подавление факторов транскрипции домена runt RUNX1, RUNX3 и их кофактора CBFB при раке желудка». Международный журнал рака. 113 (2): 221–8. Дои:10.1002 / ijc.20551. PMID 15386419.