MTA2 - MTA2

Эта статья о белках. Информацию об исламском телеканале см. MTA 2.
MTA2
Идентификаторы
ПсевдонимыMTA2, MTA1L1, ВЗОМТ, связанный с метастазами 1 член семьи 2
Внешние идентификаторыOMIM: 603947 MGI: 1346340 ГомолоГен: 3480 Генные карты: MTA2
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение MTA2
Геномное расположение MTA2
Группа11q12.3Начните62,593,214 бп[1]
Конец62,601,865 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE MTA2 203443 в формате fs.png

PBB GE MTA2 203444 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

9219

23942

Ансамбль

ENSG00000149480

ENSMUSG00000071646

UniProt

O94776

Q9R190

RefSeq (мРНК)

NM_004739
NM_001330292

NM_011842

RefSeq (белок)

NP_001317221
NP_004730

NP_035972

Расположение (UCSC)Chr 11: 62,59 - 62,6 МбChr 19: 8.94 - 8.95 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Связанный с метастазами белок MTA2 это белок что у людей кодируется MTA2 ген.[5][6]

MTA2 - второй член семейства генов MTA.[5][7][8] Белок MTA2 локализуется в ядре и является компонентом ремоделирования нуклеосом и комплекса деацетилирования (NuRD ).[8] Похож на члена семьи-основателя MTA1, MTA2 действует как фактор ремоделирования хроматина и регулирует экспрессию генов.[9][10] MTA2 сверхэкспрессируется при раке человека, и его нерегулируемый уровень хорошо коррелирует с инвазивностью рака и агрессивными фенотипами.[11]

Открытие

MTA2 был первоначально распознан как ген MTA1-like 1, названный MTA1-L1, в результате крупномасштабного секвенирования случайно выбранных клонов человека. кДНК библиотеки в 1999 году.[5] Ключи к разгадке роли MTA2 в экспрессии генов пришли из ассоциации полипептидов MTA2 в комплексе NuRD в протеомном исследовании.[7] За этим последовало целевое клонирование мышиного Mta2 в 2001 году.[12]

Генные и сплайсированные варианты

MTA2 локализован на хромосоме 11q12-q13.1 у человека и на хромосоме 19B у мышей. Ген MTA2 человека длиной 8,6 т.п.н. содержит 20 экзонов и семь транскриптов, включая три транскрипта, кодирующих белок, но предсказано, что он кодирует два полипептида из 688 аминокислот и 495 аминокислот.[13] Остальные четыре транскрипта MTA2 представляют собой некодирующие транскрипты РНК в диапазоне от 532 до 627 пар оснований. Мышиный Mta2 состоит из кодирующего белок транскрипта размером 3,1 т.п.н. для кодирования белка из 668 аминокислот и пяти транскриптов некодирующих РНК в диапазоне от 620 до 839 пар оснований.

Структура

Аминокислотная последовательность MTA2 имеет 68,2% гомологии с MTA1 Последовательность. MTA2 домены включают, BAH (Бромосмежные гомологии), ELM2 (гомология egl-27 и MTA1), a SANT домен (SWI, ADA2, N-CoR, TFIIIB-B) и GATA-подобный цинковый палец.[14][15][16] MTA2 ацетилируется по лизину 152 в домене BAH.[17]

Функция

Этот ген кодирует белок, который был идентифицирован как компонент NuRD, комплекс деацетилазы, ремоделирующий нуклеосомы, идентифицированный в ядре клеток человека. Он показывает очень широкий паттерн экспрессии и сильно экспрессируется во многих тканях. Он может представлять одного члена небольшого семейства генов, которые кодируют разные, но родственные белки, прямо или косвенно участвующие в регуляции транскрипции. Их косвенное влияние на регуляцию транскрипции может включать: ремоделирование хроматина.[6]

MTA2 подавляет рецептор эстрогена -трансактивационные функции и участвует в выработке гормонов независимо от клеток рака груди.[11] MTA2 участвует в циркадном ритме через комплекс CLOCK-BMAL1. MTA2 подавляет экспрессию генов-мишеней благодаря своей способности взаимодействовать с комплексами ремоделирования хроматина и модулирует пути, участвующие в клеточных функциях, включая инвазию, апоптоз, переход от эпителия к мезенхиме и рост нормальных и раковых клеток.[9][11]

Регулирование

Экспрессия MTA2 стимулируется Фактор транскрипции Sp1 [12][18] и подавлен Kaiso.[19] Рост-регуляторная активность MTA2 модулируется через его ацетилирование гистонацетилазой. p300 [12]. Экспрессия MTA2 ингибируется Ро GDIa в клетках рака груди[20] и человеком β-дефенсины в раковых клетках толстой кишки.[21] МикроРНК-146a и miR-34a также регулируют уровни мРНК MTA2 посредством посттранскрипционного механизма.[22][23][24]

Цели

MTA2 деацетилирует рецептор эстрогена альфа и p53 и подавляет их трансактивационные функции.[25][26] MTA2 подавляет экспрессию E-кадгерина в клетках немелкоклеточного рака легкого.[27] но стимулирует выражение Ил-11 в клетках рака желудка.[28] Мишени комплекса ремоделирования хроматина, содержащего MTA2 ЧАСЫ -BMAL1 сложный.[29]

Взаимодействия

MTA2 был показан взаимодействовать с участием:

Заметки

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000149480 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071646 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c Futamura M, Nishimori H, Shiratsuchi T, Saji S, Nakamura Y, Tokino T (1999). «Молекулярное клонирование, картирование и характеристика нового гена человека, MTA1-L1, демонстрирующего гомологию с геном, связанным с метастазами, MTA1». Журнал генетики человека. 44 (1): 52–6. Дои:10.1007 / с100380050107. PMID  9929979.
  6. ^ а б «Ген Entrez: метастаз MTA2, связанный с 1 семьей, член 2».
  7. ^ а б Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК  316920. PMID  10444591.
  8. ^ а б Ли Д.К., Кумар Р. (2015). Раскрытие сложности и функций корегуляторов MTA при раке человека. Достижения в исследованиях рака. 127. С. 1–47. Дои:10.1016 / bs.acr.2015.04.005. ISBN  9780128029206. PMID  26093897.
  9. ^ а б Сен Н., Гуй Б., Кумар Р. (декабрь 2014 г.). «Физиологические функции белков семейства MTA». Отзывы о метастазах рака. 33 (4): 869–77. Дои:10.1007 / s10555-014-9514-4. ЧВК  4245464. PMID  25344801.
  10. ^ Кумар Р. (декабрь 2014 г.). «Функции и клиническое значение белков MTA при раке человека. Предисловие». Отзывы о метастазах рака. 33 (4): 835. Дои:10.1007 / s10555-014-9509-1. ЧВК  4245326. PMID  25348751.
  11. ^ а б c Ковингтон KR, Fuqua SA (декабрь 2014 г.). «Роль MTA2 в раке человека». Отзывы о метастазах рака. 33 (4): 921–8. Дои:10.1007 / s10555-014-9518-0. ЧВК  4425804. PMID  25394532.
  12. ^ а б Ся Л., Чжан И (май 2001 г.). «Факторы транскрипции семейств Sp1 и ETS регулируют экспрессию гена Mta2 мыши». Ген. 268 (1–2): 77–85. Дои:10.1016 / s0378-1119 (01) 00429-2. PMID  11368903.
  13. ^ Кумар Р., Ван РА (май 2016 г.). «Структура, экспрессия и функции генов MTA». Ген. 582 (2): 112–21. Дои:10.1016 / j.gene.2016.02.012. ЧВК  4785049. PMID  26869315.
  14. ^ Миллард С.Дж., Уотсон П.Дж., Селардо И., Гордиенко Ю., Коули С.М., Робинсон К.В., Файролл Л., Швабе Дж. В. (июль 2013 г.). «HDAC класса I имеют общий механизм регуляции инозитолфосфатами». Молекулярная клетка. 51 (1): 57–67. Дои:10.1016 / j.molcel.2013.05.020. ЧВК  3710971. PMID  23791785.
  15. ^ Алкарни С.С., Мурти А., Чжан В., Пржевлока М.Р., Силва А.П., Уотсон А.А., Лейон С., Пей XY, Смитс А.Х., Клоет С.Л., Ван Х., Шеперд Н.Э., Стокс П.Х., Блобель Г.А., Вермёлен М., Гловер Д.М., Маккей Дж. , Лауэ ЭД (август 2014 г.). «Понимание архитектуры комплекса NuRD: структура подкомплекса RbAp48-MTA1». Журнал биологической химии. 289 (32): 21844–55. Дои:10.1074 / jbc.M114.558940. ЧВК  4139204. PMID  24920672.
  16. ^ Миллард CJ, Fairall L, Schwabe JW (декабрь 2014 г.). «На пути к пониманию структуры и функции MTA1». Отзывы о метастазах рака. 33 (4): 857–67. Дои:10.1007 / s10555-014-9513-5. ЧВК  4244562. PMID  25352341.
  17. ^ Чжоу Дж., Чжан С., Тан В., Ченг Р., Гонг Х., Чжу К. (февраль 2014 г.). «P300 связывает и ацетилирует MTA2, способствуя росту клеток колоректального рака». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 444 (3): 387–90. Дои:10.1016 / j.bbrc.2014.01.062. PMID  24468085.
  18. ^ Чжоу Ц., Цзи Дж., Цай Ц., Ши М., Чен Х, Ю И, Лю Б., Чжу З., Чжан Дж. (8 сентября 2013 г.). «MTA2 способствует инвазии клеток рака желудка и транскрипционно регулируется Sp1». Молекулярный рак. 12 (1): 102. Дои:10.1186/1476-4598-12-102. ЧВК  3851872. PMID  24010737.
  19. ^ Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (Сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через метил-CpG-связывающий белок Kaiso». Молекулярная клетка. 12 (3): 723–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID  14527417.
  20. ^ Barone I, Brusco L, Gu G, Selever J, Beyer A, Covington KR, Tsimelzon A, Wang T, Hilsenbeck SG, Chamness GC, Andò S, Fuqua SA (апрель 2011 г.). «Потеря Rho GDIα и устойчивость к тамоксифену из-за воздействия на рецептор эстрогена α». Журнал Национального института рака. 103 (7): 538–52. Дои:10.1093 / jnci / djr058. ЧВК  3071355. PMID  21447808.
  21. ^ Ураки С., Сугимото К., Сираки К., Тамеда М., Инагаки Ю., Огура С., Касаи К., Нодзири К., Йонеда М., Ямамото Н., Такей Ю., Нобори Т., Ито М. (сентябрь 2014 г.). «Человеческий β-дефенсин-3 ингибирует миграцию раковых клеток толстой кишки посредством подавления экспрессии члена 2 семейства, ассоциированного с метастазами». Международный журнал онкологии. 45 (3): 1059–64. Дои:10.3892 / ijo.2014.2507. PMID  24969834.
  22. ^ Ли И, Ванденбум Т.Г., Ван З., Конг Д., Али С., Филип П.А., Саркар Ф.Х. (февраль 2010 г.). «miR-146a подавляет инвазию клеток рака поджелудочной железы». Исследования рака. 70 (4): 1486–95. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2792. ЧВК  2978025. PMID  20124483.
  23. ^ Каллер М., Лифферс С.Т., Оэльеклаус С., Кульманн К., Рё С., Хоффманн Р., Варшайд Б., Хермекинг Н. (август 2011 г.). «Полногеномная характеристика индуцированных miR-34a изменений в экспрессии белка и мРНК с помощью комбинированного импульсного анализа SILAC и микроматрицы». Молекулярная и клеточная протеомика. 10 (8): M111.010462. Дои:10.1074 / mcp.M111.010462. ЧВК  3149097. PMID  21566225.
  24. ^ Чжан И, Ван XF (декабрь 2014 г.). «Посттранскрипционная регуляция семейства MTA с помощью микроРНК в контексте рака». Отзывы о метастазах рака. 33 (4): 1011–6. Дои:10.1007 / s10555-014-9526-0. ЧВК  4245459. PMID  25332146.
  25. ^ Цуй Ю., Ниу А., Пестелл Р., Кумар Р., Курран Э.М., Лю И., Фукуа С.А. (сентябрь 2006 г.). «Связанный с метастазами белок 2 является репрессором рецептора эстрогена альфа, избыточная экспрессия которого приводит к эстроген-независимому росту клеток рака груди человека». Молекулярная эндокринология. 20 (9): 2020–35. Дои:10.1210 / me.2005-0063. ЧВК  4484605. PMID  16645043.
  26. ^ Ло Дж, Су Ф, Чен Д., Шайло А., Гу В. (ноябрь 2000 г.). «Деацетилирование р53 модулирует его влияние на рост клеток и апоптоз». Природа. 408 (6810): 377–81. Bibcode:2000Натура 408..377л. Дои:10.1038/35042612. PMID  11099047. S2CID  4300392.
  27. ^ Лу Х, Ковалев Г.И., Чанг Х., Каллин Э., Кнудсен Дж., Ся Л., Мишра Н., Руиз П., Ли Э, Су Л, Чжан И (май 2008 г.). «Инактивация NuRD компонента Mta2 вызывает аномальную активацию Т-клеток и волчаночное аутоиммунное заболевание у мышей». Журнал биологической химии. 283 (20): 13825–33. Дои:10.1074 / jbc.M801275200. ЧВК  2376246. PMID  18353770.
  28. ^ Чжоу Ц., Цзи Дж., Цай Ц., Ши М., Чен Х, Ю И, Чжу З, Чжан Дж (2 мая 2015 г.). «MTA2 усиливает образование колоний и рост опухолей клеток рака желудка через IL-11». BMC Рак. 15: 343. Дои:10.1186 / с12885-015-1366-у. ЧВК  4419442. PMID  25929737.
  29. ^ Ким Дж.Й., Квак ПБ, Вайц СиДжей (декабрь 2014 г.). «Специфика обратной связи циркадных часов от целевого восстановления корепрессора NuRD». Молекулярная клетка. 56 (6): 738–48. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.10.017. PMID  25453762.
  30. ^ а б c d е ж Яо Ю.Л., Ян В.М. (октябрь 2003 г.). «Связанные с метастазами белки 1 и 2 образуют различные белковые комплексы с активностью гистондеацетилазы». Журнал биологической химии. 278 (43): 42560–8. Дои:10.1074 / jbc.M302955200. PMID  12920132.
  31. ^ Ю А., Тонг Дж. К., Грозингер С.М., Шрайбер С.Л. (февраль 2001 г.). «CoREST является неотъемлемым компонентом комплекса CoREST-гистондеацетилаза человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (4): 1454–8. Bibcode:2001PNAS ... 98.1454Y. Дои:10.1073 / пнас.98.4.1454. ЧВК  29278. PMID  11171972.
  32. ^ а б c d е Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК  316920. PMID  10444591.
  33. ^ а б Ясуи Д., Мияно М., Цай С., Варга-Вайс П., Кохви-Шигемацу Т. (октябрь 2002 г.). «SATB1 нацелен на ремоделирование хроматина, чтобы регулировать гены на больших расстояниях». Природа. 419 (6907): 641–5. Bibcode:2002Натура.419..641л. Дои:10.1038 / природа01084. PMID  12374985. S2CID  25822700.
  34. ^ Хакими М.А., Донг Й., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидат Х-сцепленного гена умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии. 278 (9): 7234–9. Дои:10.1074 / jbc.M208992200. PMID  12493763.
  35. ^ Сакаи Х., Урано Т., Ооката К., Ким М.Х., Хираи Й., Сайто М., Нодзима Ю., Исикава Ф. (декабрь 2002 г.). «MBD3 и HDAC1, два компонента комплекса NuRD, локализуются в Aurora-A-позитивных центросомах в M фазе». Журнал биологической химии. 277 (50): 48714–23. Дои:10.1074 / jbc.M208461200. PMID  12354758.
  36. ^ Сайто М., Исикава Ф. (сентябрь 2002 г.). «MCpG-связывающий домен MBD3 человека не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD / Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии. 277 (38): 35434–9. Дои:10.1074 / jbc.M203455200. PMID  12124384.

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.