Лимфоидный энхансер-связывающий фактор 1 - Lymphoid enhancer-binding factor 1

LEF1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2LEF, 3OUW, 3OUX
Идентификаторы
Псевдонимы	LEF1, LEF-1, TCF10, TCF1ALPHA, TCF7L3, фактор связывания лимфоидного усилителя 1
Внешние идентификаторы	MGI: 96770 ГомолоГен: 7813 Генные карты: LEF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	108,168,956 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	131,224,356 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание гистондеацетилазы; • Связывание с повторным доменом броненосца; • связывание рецептора эстрогена; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции; • активность рецептора эстрогена; • связывание гамма-катенина; • связывание гистонов; • Связывание с доменом цинкового пальца C2H2; • связывание хроматина; • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в апоптотическом процессе; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание ДНК, изгиб; • Связывание ДНК; • последовательное связывание ДНК; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • связывание бета-катенина; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки; • комплекс регуляторов транскрипции; • комплекс бета-катенин-TCF; • нуклеоплазма; • белок-ДНК комплекс;
Биологический процесс	• сомитогенез; • развитие языка; • формирование параксиальной мезодермы; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция связывания ДНК; • Рекомбинация Т-клеточного рецептора V (D) J; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • клеточный ответ на цитокиновый стимул; • развитие молочной железы; • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-13; • одонтогенез дентинсодержащего зуба; • развитие мышечных волокон; • апоптотический процесс, вовлеченный в морфогенез кровеносных сосудов; • хемотаксис клеток; • отрицательная регуляция канонического сигнального пути Wnt; • морфогенез лица; • дифференцировка нейтрофилов; • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-5; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие зубчатой извилины; • апоптотический процесс, вовлеченный в морфогенез; • транскрипция, ДНК-шаблон; • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительное регулирование роста клеток; • регуляция сигнального пути Wnt; • эмбриональный морфогенез конечностей; • развитие гипоталамуса; • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов; • развитие трахеи; • регуляция развития поперечно-полосатой мышечной ткани; • положительная регуляция межклеточной адгезии; • отдел нейробластов переднего мозга; • пигментация глаз; • отрицательная регуляция апоптотического процесса; • прорастающий ангиогенез; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция перехода эпителия в мезенхиму; • BMP сигнальный путь; • положительная регуляция процесса клеточного цикла; • дифференцировка остеобластов; • ацетилирование гистона H3; • формирование радиальных глиальных каркасов; • положительная регуляция дифференцировки гранулоцитов; • дифференцировка альфа-бета Т-клеток; • канонический путь передачи сигналов Wnt; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • сенсорное восприятие вкуса; • клеточный ответ на интерлейкин-4; • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе; • развитие клеток; • отрицательная регуляция межклеточной адгезии; • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-4; • отрицательная регуляция развития поперечно-полосатой мышечной ткани; • положительное регулирование миграции клеток; • Сигнальный путь Wnt; • Дифференцировка Т-хелперов 1 клетки; • положительное регулирование пролиферации клеток в костном мозге; • регресс анатомической структуры; • хорио-аллантоисный синтез; • отрицательная регуляция апоптотического процесса в костном мозге; • Пролиферация В-клеток; • положительная регуляция экспрессии генов; • развитие сосудистой сети; • дифференцировка радиальных глиальных клеток переднего мозга; • миграция клеток нервного гребня; • положительное регулирование пролиферации клеток; • дифференциация нейронов переднего мозга; • ацетилирование гистона H4; • развитие гиппокампа; • отрицательная регуляция связывания рецептора эстрогена; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • Сигнальный путь Wnt, путь модуляции кальция; • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами; • дифференцировка одонтобластов; • сборка комплекса бета-катенин-TCF; • эпителиально-мезенхимальный переход; • регуляция межклеточной адгезии; • вторичное развитие неба;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51176
	16842
	ENSG00000138795
	ENSMUSG00000027985
	Q9UJU2; Q659G9
	P27782
	NM_001130713; NM_001130714; NM_001166119; NM_016269
NM_001276402; NM_001276403; NM_010703; NM_001379059; NM_001379060;
	NM_001379061; NM_001379062
	NP_001124185; NP_001124186; NP_001159591; NP_057353; NP_057353.1
NP_001263331; NP_001263332; NP_034833; NP_001365988; NP_001365989;
	NP_001365990; NP_001365991
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Лимфоидный энхансер-связывающий фактор 1 (LEF1) это белок что у людей кодируется LEF1 ген.^[5]

Функция

Лимфоидный энхансер-связывающий фактор-1 (LEF1) представляет собой ядерный белок весом 48 кДа, который экспрессируется в пре-B и Т-клетки. Он связывается с функционально важным сайтом Т-клеточного рецептора-альфа (TCRA ) энхансер и обеспечивает максимальную активность энхансера. LEF1 принадлежит к семейству регуляторных белков, которые имеют гомологию с белком-1 группы высокой подвижности (HMG1 ).^[6]

Клиническое значение

LEF1 сильно сверхэкспрессируется и связан с прогрессированием заболевания и плохим прогнозом в В-клеточный хронический лимфоцитарный лейкоз^[7] и другие виды злокачественных новообразований, такие как колоректальный рак.^[8] Это также многообещающая потенциальная мишень для лекарств.^[9]

Взаимодействия

Лимфоидный энхансер-связывающий фактор 1 может взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Уотерман ML (2004). «Экспрессия фактора лимфоидного энхансера / Т-клеточного фактора при колоректальном раке». Раковые метастазы Rev. 23 (1–2): 41–52. Дои:10.1023 / А: 1025858928620. PMID 15000148. S2CID 20996511.
Скокова Дж., Велте К. (2007). «LEF-1 является решающим фактором транскрипции в гранулопоэзе нейтрофилов». Анна. Акад. Наука. 1106: 143–51. Дои:10.1196 / летопись.1392.012. PMID 17360796. S2CID 30579011.
Трэвис А., Амстердам А., Белэнджер С., Гроссчедл Р. (1991). «LEF-1, ген, кодирующий лимфоид-специфический белок с доменом HMG, регулирует функцию усилителя альфа рецептора Т-клеток [исправлено]». Genes Dev. 5 (5): 880–94. Дои:10.1101 / gad.5.5.880. PMID 1827423.
ван де Ветеринг М., Остервегель М., Дойес Д., Клеверс Н. (1991). «Идентификация и клонирование TCF-1, фактора транскрипции, специфичного для Т-лимфоцитов, содержащего специфичный для последовательности HMG-бокс». EMBO J. 10 (1): 123–32. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07928.x. ЧВК 452620. PMID 1989880.
Уотерман М.Л., Фишер WH, Джонс К.А. (1991). «Специфичный для тимуса член семейства белков HMG регулирует энхансер C-альфа рецептора Т-клеток человека». Genes Dev. 5 (4): 656–69. Дои:10.1101 / gad.5.4.656. PMID 2010090.
Чжоу П., Бирн С., Джейкобс Дж., Фукс Э. (1995). «Фактор лимфоидного усилителя 1 управляет формированием рисунка волосяного фолликула и судьбой эпителиальных клеток». Genes Dev. 9 (6): 700–13. Дои:10.1101 / gad.9.6.700. PMID 7537238.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Prieve MG, Guttridge KL, Munguia JE, Waterman ML (1996). «Сигнал ядерной локализации фактора-1 лимфоидного усилителя распознается двумя дифференциально экспрессируемыми белками рецептора последовательности ядерной локализации Srp1». J. Biol. Chem. 271 (13): 7654–8. Дои:10.1074 / jbc.271.13.7654. PMID 8631802.
Беренс Дж., Фон Крис Дж. П., Кюль М. и др. (1996). «Функциональное взаимодействие бета-катенина с фактором транскрипции LEF-1». Природа. 382 (6592): 638–42. Дои:10.1038 / 382638a0. PMID 8757136. S2CID 4369341.
Багга Р., Эмерсон Б.М. (1997). «Репрессорный комплекс, содержащий I / Y HMG, и топология суперспиральной ДНК имеют решающее значение для транскрипции, зависимой от энхансера на большие расстояния, in vitro». Genes Dev. 11 (5): 629–39. Дои:10.1101 / gad.11.5.629. PMID 9119227.
Брун Л., Маннерлин А., Гросседл Р. (1997). «ALY, контекстно-зависимый коактиватор LEF-1 и AML-1, необходим для функции энхансера TCRalpha». Genes Dev. 11 (5): 640–53. Дои:10.1101 / gad.11.5.640. PMID 9119228.
Браннон М., Гомпертс М., Сумой Л. и др. (1997). «Комплекс бета-катенин / XTcf-3 связывается с промотором siamois, чтобы регулировать спецификацию дорсальной оси у Xenopus». Genes Dev. 11 (18): 2359–70. Дои:10.1101 / gad.11.18.2359. ЧВК 316518. PMID 9308964.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Коринек В., Баркер Н., Виллерт К. и др. (1998). «Два члена семейства Tcf участвуют в передаче сигналов Wnt / бета-катенин во время эмбриогенеза у мышей». Мол. Клетка. Биол. 18 (3): 1248–56. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1248. ЧВК 108837. PMID 9488439.
Prieve MG, Guttridge KL, Munguia J, Waterman ML (1998). «Дифференциальное распознавание импортина-альфа и ядерный транспорт с помощью сигналов ядерной локализации в ДНК-связывающих доменах высокоподвижных групп фактора 1 лимфоидного усилителя и фактора 1 Т-клеток». Мол. Клетка. Биол. 18 (8): 4819–32. Дои:10.1128 / MCB.18.8.4819. ЧВК 109067. PMID 9671491.
Леванон Д., Гольдштейн Р. Э., Бернштейн Ю. и др. (1998). «Репрессия транскрипции с помощью AML1 и LEF-1 опосредуется корепрессорами TLE / Groucho». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (20): 11590–5. Дои:10.1073 / пнас.95.20.11590. ЧВК 21685. PMID 9751710.
Хованес К., Ли Т.В., Уотерман М.Л. (2000). «Ген LEF-1 человека содержит промотор, предпочтительно активный в лимфоцитах, и кодирует несколько изоформ, полученных в результате альтернативного сплайсинга». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (9): 1994–2003. Дои:10.1093 / nar / 28.9.1994. ЧВК 103301. PMID 10756202.
Лаббе Э, Летамендия А, Аттисано Л. (2000). «Ассоциация Smads с лимфоидным энхансером, связывающим фактор 1 / Т-клеточно-специфический фактор, опосредует кооперативную передачу сигналов трансформирующим фактором роста бета и путями wnt». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (15): 8358–63. Дои:10.1073 / pnas.150152697. ЧВК 26952. PMID 10890911.
Brantjes H, Roose J, van De Wetering M, Clevers H (2001). «Все факторы транскрипции Tcf HMG box взаимодействуют с корепрессорами, связанными с Groucho». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (7): 1410–9. Дои:10.1093 / nar / 29.7.1410. ЧВК 31284. PMID 11266540.

внешняя ссылка

LEF1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138795 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027985 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1783375-5] Милатович А., Трэвис А., Гроссчедл Р., Франк У. (март 1992 г.). «Ген фактора 1 связывания лимфоидного энхансера (LEF1), картированный на хромосоме 4 человека (q23-q25) и хромосоме 3 мыши рядом с Egf». Геномика. 11 (4): 1040–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90030-И. PMID 1783375.

[entrez-6] «Ген Entrez: фактор 1 связывания лимфоидного энхансера LEF1».

[Erdfelder_et_al.-7] Erdfelder F, Hertweck M, Filipovich A, Uhrmacher S, Kreuzer KA (2010). «Высокая экспрессия фактора-1, связывающего лимфоидный энхансер, связана с прогрессированием заболевания и плохим прогнозом при хроническом лимфолейкозе». Гематологические отчеты. 2 (1): 3. Дои:10.4081 / час 2010.e3. ЧВК 3222268. PMID 22184516.

[Eskandari_et.al-8] Эскандари Э., Маджуби Ф., Моталебзаде Дж. (Декабрь 2018 г.). «Комплексное исследование TF и miRNA в метастазах колоректального рака и оценка трех совместно регулируемых генов-кандидатов в качестве прогностических маркеров». Ген. 679: 150–159. Дои:10.1016 / j.gene.2018.09.003. PMID 30193961.

[pmid20360943-9] Гандираджан Р.К., Стаиб П.А., Минке К., Герке И., Пликерт Г., Шлёссер А., Шмитт Е.К., Халлек М., Кройцер К.А. (апрель 2010 г.). «Низкомолекулярные ингибиторы передачи сигналов Wnt / бета-катенин / lef-1 вызывают апоптоз в клетках хронического лимфоцитарного лейкоза in vitro и in vivo». Неоплазия. 12 (4): 326–35. Дои:10.1593 / neo.91972. ЧВК 2847740. PMID 20360943.

[pmid11696550-10] Борас К., Хамель ПА (январь 2002 г.). «Связывание Alx4 с LEF-1 регулирует активность промотора N-CAM». J. Biol. Chem. 277 (2): 1120–7. Дои:10.1074 / jbc.M109912200. PMID 11696550.

[pmid10617663-11] Lutterbach B, Westendorf JJ, Linggi B, Isaac S, Seto E, Hiebert SW (январь 2000 г.). «Механизм подавления острого миелоидного лейкоза-1, мишень множественных хромосомных транслокаций при остром лейкозе». J. Biol. Chem. 275 (1): 651–6. Дои:10.1074 / jbc.275.1.651. PMID 10617663.

[pmid15684397-12] Эдлунд С., Ли С.И., Гримсби С., Чжан С., Аспенстрём П., Хелдин С.Х., Ландстрем М. (февраль 2005 г.). «Взаимодействие между Smad7 и бета-катенином: важность трансформации апоптоза, вызванного фактором роста бета». Мол. Клетка. Биол. 25 (4): 1475–88. Дои:10.1128 / MCB.25.4.1475-1488.2005. ЧВК 548008. PMID 15684397.

[pmid12748295-13] Грюнеберг Д.А., Пабло Л., Ху К.К., Август П., Вен З., Папкофф Дж. (Июнь 2003 г.). «Функциональный скрининг в клетках человека идентифицирует UBF2 как фактор транскрипции РНК-полимеразы II, который усиливает сигнальный путь бета-катенина». Мол. Клетка. Биол. 23 (11): 3936–50. Дои:10.1128 / MCB.23.11.3936-3950.2003. ЧВК 155208. PMID 12748295.

[pmid8757136-14] Беренс Дж., Фон Крис Дж. П., Кюль М., Брюн Л., Веллих Д., Гросшедль Р., Бирхмайер В. (август 1996). «Функциональное взаимодействие бета-катенина с фактором транскрипции LEF-1». Природа. 382 (6592): 638–42. Дои:10.1038 / 382638a0. PMID 8757136. S2CID 4369341.

[pmid10890911-15] а ^б ^c Лаббе Е., Летамендия А., Аттисано Л. (июль 2000 г.). «Ассоциация Smads с лимфоидным энхансером, связывающим фактор 1 / Т-клеточно-специфический фактор, опосредует кооперативную передачу сигналов трансформирующим фактором роста бета и путями wnt». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (15): 8358–63. Дои:10.1073 / pnas.150152697. ЧВК 26952. PMID 10890911.

[pmid12446687-16] Hecht A, Stemmler MP (февраль 2003 г.). «Идентификация промотор-специфичного домена активации транскрипции на С-конце эффекторного белка Wnt Т-клеточного фактора 4». J. Biol. Chem. 278 (6): 3776–85. Дои:10.1074 / jbc.M210081200. PMID 12446687.

[pmid12032083-17] Ясумото К., Такеда К., Сайто Х., Ватанабе К., Такахаши К., Шибахара С. (июнь 2002 г.). «Фактор транскрипции, связанный с микрофтальмией, взаимодействует с LEF-1, медиатором передачи сигналов Wnt». EMBO J. 21 (11): 2703–14. Дои:10.1093 / emboj / 21.11.2703. ЧВК 126018. PMID 12032083.

[pmid11731474-18] Сачдев С., Брун Л., Зибер Х, Пихлер А., Мельхиор Ф, Гроссчедл Р. (декабрь 2001 г.). «PIASy, связанная с ядерным матриксом лигаза SUMO E3, подавляет активность LEF1 путем секвестрации в ядерные тела». Genes Dev. 15 (23): 3088–103. Дои:10.1101 / gad.944801. ЧВК 312834. PMID 11731474.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]