NFKB2 - NFKB2

NFKB2
Белок NFKB2 PDB 1a3q.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNFKB2, CVID10, H2TF1, LYT-10, LYT10, NF-kB2, p105, p52, p100, p49 / p100, ядерный фактор каппа-субъединица B 2
Внешние идентификаторыOMIM: 164012 MGI: 1099800 ГомолоГен: 1873 Генные карты: NFKB2
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение NFKB2
Геномное расположение NFKB2
Группа10q24.32Начинать102,394,110 бп[1]
Конец102,402,524 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NFKB2 207535 s в формате fs.png

PBB GE NFKB2 209636 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4791

18034

Ансамбль

ENSG00000077150

ENSMUSG00000025225

UniProt

Q00653

Q9WTK5

RefSeq (мРНК)

NM_001177369
NM_001177370
NM_019408

RefSeq (белок)

NP_001170840
NP_001170841
NP_062281

Расположение (UCSC)Chr 10: 102,39 - 102,4 МбChr 19: 46.3 - 46.31 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор субъединица p100 NF-каппа-B это белок что у людей кодируется NFKB2 ген.[5]

Функция

NF-κB был обнаружен во многих типах клеток, которые экспрессируют цитокины, хемокины, факторы роста, молекулы клеточной адгезии и некоторые белки острой фазы при здоровье и различных болезненных состояниях. NF-κB активируется множеством стимулов, таких как цитокины, свободные радикалы, не содержащие окислителей, вдыхаемые частицы, ультрафиолетовое облучение и бактериальные или вирусные продукты. Неправильная активация NF-каппа-B была связана с воспалительными явлениями, связанными с аутоиммунным артритом, астмой, септическим шоком, фиброзом легких, гломерулонефритом, атеросклерозом и СПИДом. Напротив, полное и стойкое ингибирование NF-каппа-B было напрямую связано с апоптозом, несоответствующим развитием иммунных клеток и задержкой роста клеток. Для обзоров см. Chen et al. (1999) и Болдуин (1996). [Предоставлено OMIM][6]

Клиническое значение

Мутация гена NFKB2 была связана с Общий вариабельный иммунодефицит (CVID) как причина заболевания. Другие гены также могут нести ответственность. Частота мутации NFKB2 в популяции ОВИН еще не установлена.[7]

Белок NFKB2 может мутировать и приводить к наследственным эндокринным и иммунодефицитным заболеваниям.[8] Мутация происходит на С-конце NFKB2 и вызывает общий вариабельный иммунодефицит, который, в свою очередь, вызывает эндокринную недостаточность и иммунодефицит.[8] Мутация NFKB2 может вызывать такие вещи, как дефицит адренокортикотропного гормона и синдром ДЭВИДА, который является дефицитом гормона гипофиза и ОВИН.[8][9]

Мутации, происходящие на С-конце, влияют на серин 866 и 870.[9] Эти серины считаются сайтами фосфорилирования для NFKB2.[9] Эти мутации серина на С-конце приводят к ОВИН в сочетании с другими эндокринными нарушениями. Эти эндокринные дефициты вместе с мутацией NFKB2 заставляют ученых полагать, что мутация NFKB2 является редким наследственным заболеванием, называемым болезнью ДЭВИДА.[8]

Взаимодействия

NFKB2 был показан взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077150 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025225 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шмид Р.М., Перкинс Н.Д., Дакетт С.С., Эндрюс П.С., Набель Г.Дж. (август 1991 г.). «Клонирование субъединицы NF-каппа B, которая стимулирует транскрипцию ВИЧ в синергии с p65» (PDF). Природа. 352 (6337): 733–6. Дои:10.1038 / 352733a0. HDL:2027.42/62829. PMID  1876189. S2CID  4237376.
  6. ^ «Ген Entrez: ядерный фактор NFKB2 усилителя гена каппа-легкого полипептида в В-клетках 2 (p49 / p100)».
  7. ^ Чен К., Кунрод Э.М., Куманович А., Фрэнкс З.Ф., Дурчи Д.Д., Марграф Р.Л., Ву В., Хейкал Н.М., Августин Н.Х., Ридж П.Г., Хилл Х.Р., Йорде Л. (Ноябрь 2013 г.). «Мутации зародышевой линии в NFKB2 вовлекают неканонический путь NF-κB в патогенез общего вариабельного иммунодефицита». Американский журнал генетики человека. 93 (5): 812–24. Дои:10.1016 / j.ajhg.2013.09.009. ЧВК  3824125. PMID  24140114.
  8. ^ а б c d Brue T, Quentien MH, Khetchoumian K, Bensa M, Capo-Chichi JM, Delemer B, Balsalobre A, Nassif C, Papadimitriou DT, Pagnier A, Hasselmann C, Patry L, Schwartzentruber J, Souchon PF, Takayasu S, Enjasu Ван Влит Дж., Маевски Дж., Друин Дж., Сэмюэлс М.Э. (декабрь 2014 г.). «Мутации в NFKB2 и потенциальная генетическая гетерогенность у пациентов с синдромом DAVID, имеющим различные эндокринные и иммунные дефициты». BMC Medical Genetics. 15: 139. Дои:10.1186 / s12881-014-0139-9. ЧВК  4411703. PMID  25524009.
  9. ^ а б c Ши Си, Ван Ф, Тонг А, Чжан XQ, Сун Х.М., Лю З.Й., Лю В., Лю ЮХ, Ся ВБ (октябрь 2016 г.). «Мутация NFKB2 при общем вариабельном иммунодефиците и изолированном дефиците адренокортикотропного гормона: описание случая и обзор литературы». Лекарство. 95 (40): e5081. Дои:10.1097 / мкр. 0000000000005081. ЧВК  5059085. PMID  27749582.
  10. ^ а б Торнбург, штат Нью-Джерси, Патманатан Р., Рааб-Трауб Н. (декабрь 2003 г.). «Активация комплексов ядерный фактор-гомодимер kappaB p50 / Bcl-3 при карциноме носоглотки». Исследования рака. 63 (23): 8293–301. PMID  14678988.
  11. ^ Bours V, Franzoso G, Azarenko V, Park S, Kanno T, Brown K, Siebenlist U (март 1993). «Онкопротеин Bcl-3 напрямую трансактивируется через мотивы каппа B через ассоциацию с ДНК-связывающими гомодимерами p50B». Клетка. 72 (5): 729–39. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90401-б. PMID  8453667.
  12. ^ Fong A, Sun SC (июнь 2002 г.). «Генетические доказательства важной роли белка, содержащего повторы бета-трансдуцина, в индуцируемом процессинге NF-каппа B2 / p100». Журнал биологической химии. 277 (25): 22111–4. Дои:10.1074 / jbc.C200151200. PMID  11994270.
  13. ^ Ватсяян Дж., Цин Дж., Сяо Дж., Ху Дж. (Сентябрь 2008 г.). «Модификация SUMO1 NF-kappaB2 / p100 необходима для индуцированного стимулом фосфорилирования и процессинга p100». Отчеты EMBO. 9 (9): 885–90. Дои:10.1038 / embor.2008.122. ЧВК  2529344. PMID  18617892.
  14. ^ а б c d е Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природа клеточной биологии. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
  15. ^ Ли З., Набель Г.Дж. (октябрь 1997 г.). «Новый член семейства белков I kappaB, I kappaB epsilon, ингибирует RelA (p65) -опосредованную транскрипцию NF-kappaB». Молекулярная и клеточная биология. 17 (10): 6184–90. Дои:10.1128 / mcb.17.10.6184. ЧВК  232469. PMID  9315679.
  16. ^ а б Шейнман Р.И., Бег А.А., Болдуин А.С. (октябрь 1993 г.). «NF-каппа B p100 (Lyt-10) является компонентом H2TF1 и может функционировать как I каппа B-подобная молекула». Молекулярная и клеточная биология. 13 (10): 6089–101. Дои:10.1128 / mcb.13.10.6089. ЧВК  364669. PMID  8413211.
  17. ^ Ayroldi E, Migliorati G, Bruscoli S, Marchetti C, Zollo O, Cannarile L, D'Adamio F, Riccardi C (август 2001 г.). «Модуляция активации Т-клеток с помощью глюкокортикоид-индуцированного фактора лейциновой молнии посредством ингибирования ядерного фактора каппаВ». Кровь. 98 (3): 743–53. Дои:10.1182 / blood.v98.3.743. PMID  11468175.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка