BTRC (ген) - Википедия - BTRC (gene)

БТРК
Protein BTRC PDB 1p22.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыБТРК, BETA-TRCP, FBW1A, FBXW1, FBXW1A, FWD1, bTrCP, bTrCP1, betaTrCP, повтор бета-трансдуцина, содержащий убиквитин-протеинлигазу E3
Внешние идентификаторыOMIM: 603482 MGI: 1338871 ГомолоГен: 39330 Генные карты: БТРК
Расположение гена (человек)
Chromosome 10 (human)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Chromosome 10 (human)
Genomic location for BTRC
Genomic location for BTRC
Группа10q24.32Начинать101,354,033 бп[1]
Конец101,557,321 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001256856
NM_003939
NM_033637

RefSeq (белок)

NP_001243785
NP_003930
NP_378663

Расположение (UCSC)Chr 10: 101,35 - 101,56 МбChr 19: 45.36 - 45.53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок 1A, содержащий F-бокс / повтор WD (FBXW1A) также известный как βTrCP1 или же Fbxw1 или же hsSlimb или же субъединица рецептора pIkappaBalpha-E3 это белок что у людей кодируется БТРК (содержащий повтор бета-трансдуцина) ген.[5][6]

Этот ген кодирует член F-бокс протеин семейство, которое характеризуется примерно 40 остатками структурный мотив, F-поле. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц убиквитин белок лигаза комплекс под названием SCFs (Skp1-Cul1-F-бокс-белок ), которые часто, но не всегда, распознают субстраты зависимым от фосфорилирования образом. Белки F-бокса делятся на 3 класса:

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к Fbxw class as, помимо F-бокса, этот белок содержит несколько повторов WD40. Этот белок гомологичен Xenopus βTrCP, дрожжи Мет30, Нейроспора Scon2 и Дрозофила Slimb. У млекопитающих, помимо βTrCP1, белок паралог (называемый βTrCP2 или FBXW11 ) также существует, но пока их функции кажутся избыточными и неразличимыми.

Открытие

Человеческий βTrCP (обозначаемый как βTrCP1 и βTrCP2) первоначально был идентифицирован как клеточная убиквитинлигаза, которая связывается ВИЧ-1 Впу вирусный белок для устранения клеточного CD4 подключив его к протеолитической машине.[7] Впоследствии было показано, что βTrCP регулирует множество клеточных процессов, опосредуя деградацию различных мишеней.[8] Регуляторы клеточного цикла составляют основную группу субстратов βTrCP. Во время фазы S βTrCP контролирует CDK1, способствуя деградации фосфатазы CDC25A,[9] тогда как в G2 βTrCP вносит вклад в активацию CDK1, направляя киназу WEE1 для деградации.[10] В раннем митозе βTrCP опосредует деградацию EMI1,[11][12] ингибитор APC / C комплекс убиквитин-лигаза, который отвечает за переход от анафазы к метафазе (за счет индукции протеолиза секурина) и выхода из митоза (за счет деградации митотических CDK1, активирующих субъединицы циклина). Кроме того, βTrCP контролирует APC / C путем нацеливания на REST, тем самым устраняя его репрессию транскрипции на MAD2, важном компоненте контрольной точки сборки веретена, которая сохраняет APC / C в неактивном состоянии до тех пор, пока все хроматиды не будут прикреплены к микротрубкам веретена.[13]

Функция

βTrCP играет важную роль в регуляции контрольных точек клеточного цикла. В ответ на генотоксический стресс он способствует отключению активности CDK1, опосредуя деградацию CDC25A в сотрудничестве с Chk1,[9][14] тем самым предотвращая развитие клеточного цикла до завершения репарации ДНК. Во время восстановления от репликации ДНК и повреждения ДНК βTrCP вместо этого нацеливается на Claspin Plk1-зависимым образом.[15][16][17]

βTrCP также стал важным игроком в трансляции белков, росте и выживании клеток. В ответ на митогены PDCD4, ингибитор фактора инициации трансляции eIF4A, быстро разрушается βTrCP- и S6K1-зависимым образом, обеспечивая эффективную трансляцию белка и рост клеток.[18] Другой мишенью βTrCP, которая участвует в трансляции белка, является eEF2K, который ингибирует удлинение трансляции за счет фосфорилирования фактора элонгации 2 эукариот (eEF2) и уменьшения его сродства к рибосоме.[19] βTrCP также взаимодействует с mTOR и CK1α, чтобы индуцировать деградацию DEPTOR (ингибитор mTOR), тем самым создавая петлю автоамплификации, способствующую полной активации mTOR.[20][21][22] В то же время βTrCP опосредует деградацию проапоптотического белка BimEL, способствуя выживанию клеток.[23]

βTrCP также связывается с фосфорилированными ИкаппаБальфа и бета-катенин мотивы деструкции, вероятно, функционирующие во множестве транскрипционных программ, регулируя NF-kappaB и WNT пути.[24][25] βTrCP также, как было показано, регулирует разъединение центриолей и лицензирование. βTrCP нацелен на межцентросомный линкерный белок Cep68 в прометафазе, который способствует разъединению центриолей и последующему разделению центриолей.[26]

Взаимодействия

BTRC (ген) показал способность взаимодействовать с:

Клиническое значение

βTrCP ведет себя как онкопротеин в некоторых тканях. Повышенные уровни экспрессии βTrCP были обнаружены в колоректальном,[39] поджелудочная,[40] гапатобластома,[41] и рак груди.[42]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166167 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025217 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Fujiwara T, Suzuki M, Tanigami A, Ikenoue T, Omata M, Chiba T, Tanaka K (май 1999). «Ген BTRC, кодирующий белок человеческого F-бокса / WD40-повтора, отображается на хромосоме 10q24-q25». Геномика. 58 (1): 104–5. Дои:10.1006 / geno.1999.5792. PMID  10331953.
  6. ^ «Ген Entrez: содержащий повтор бета-трансдуцина BTRC».
  7. ^ а б Марготтин Ф., Бур С.П., Дюран Х., Селиг Л., Бенишоу С., Ричард В., Томас Д., Стребель К., Бенарус Р. (март 1998 г.). «Новый человеческий белок WD, h-beta TrCp, который взаимодействует с Vpu ВИЧ-1, соединяет CD4 с путём деградации ER через мотив F-бокса». Молекулярная клетка. 1 (4): 565–74. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80056-8. PMID  9660940.
  8. ^ Frescas D, Pagano M (июнь 2008 г.). «Дерегулированный протеолиз белков F-бокса SKP2 и бета-TrCP: склонность к раку». Обзоры природы. Рак. 8 (6): 438–49. Дои:10.1038 / nrc2396. ЧВК  2711846. PMID  18500245.
  9. ^ а б c Бусино Л., Донцелли М., Кьеза М., Гуардаваккаро Д., Ганот Д., Доррелло Н.В., Хершко А., Пагано М., Драетта Г.Ф. (ноябрь 2003 г.). «Распад Cdc25A бета-TrCP во время фазы S и в ответ на повреждение ДНК». Природа. 426 (6962): 87–91. Bibcode:2003Натура 426 ... 87Б. Дои:10.1038 / природа02082. PMID  14603323. S2CID  768783.
  10. ^ а б Ватанабэ Н., Араи Х., Нишихара Й., Танигучи М., Ватанабэ Н., Хантер Т., Осада Х. (март 2004 г.). «Киназы M-фазы индуцируют фосфо-зависимое убиквитинирование соматического Wee1 с помощью SCFbeta-TrCP». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (13): 4419–24. Bibcode:2004PNAS..101.4419W. Дои:10.1073 / pnas.0307700101. ЧВК  384762. PMID  15070733.
  11. ^ а б c Гуардаваккаро Д., Кудо И., Булар Дж., Барчи М., Бусино Л., Донцелли М., Марготтин-Гоге Ф., Джексон П. К., Ямасаки Л., Пагано М. (июнь 2003 г.). «Контроль мейотической и митотической прогрессии с помощью белка F-бокса бета-Trcp1 in vivo». Клетка развития. 4 (6): 799–812. Дои:10.1016 / S1534-5807 (03) 00154-0. PMID  12791266.
  12. ^ а б Марготтин-Гоге Ф., Сюй Дж. Ю., Локтев А., Се Х. М., Рейманн Дж. Д., Джексон П. К. (июнь 2003 г.). «Профазное разрушение Emi1 убиквитинлигазой SCF (betaTrCP / Slimb) активирует комплекс, способствующий анафазе, что позволяет прогрессировать за пределы прометафазы». Клетка развития. 4 (6): 813–26. Дои:10.1016 / S1534-5807 (03) 00153-9. PMID  12791267.
  13. ^ Гуардаваккаро Д., Фрескас Д., Доррелло Н.В., Пескьяроли А., Мултани А.С., Кардозо Т., Ласорелла А., Иавароне А., Чанг С., Эрнандо Е., Пагано М. (март 2008 г.). «Контроль стабильности хромосом по оси beta-TrCP-REST-Mad2». Природа. 452 (7185): 365–9. Bibcode:2008Натура.452..365G. Дои:10.1038 / природа06641. ЧВК  2707768. PMID  18354482.
  14. ^ а б Джин Дж, Широгане Т., Сюй Л., Налепа Дж., Цинь Дж., Элледж С.Дж., Харпер Дж. В. (декабрь 2003 г.). «SCFbeta-TRCP связывает передачу сигналов Chk1 с деградацией протеинфосфатазы Cdc25A». Гены и развитие. 17 (24): 3062–74. Дои:10.1101 / gad.1157503. ЧВК  305258. PMID  14681206.
  15. ^ а б Пескьяроли А., Доррелло Н.В., Гуардаваккаро Д., Венере М., Халазонетис Т., Шерман Н.Э., Пагано М. (август 2006 г.). «SCFbetaTrCP-опосредованная деградация Claspin регулирует восстановление после ответа контрольной точки репликации ДНК». Молекулярная клетка. 23 (3): 319–29. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.06.013. PMID  16885022.
  16. ^ а б Mailand N, Bekker-Jensen S, Bartek J, Lukas J (август 2006 г.). «Разрушение класпина SCFbetaTrCP сдерживает активацию Chk1 и способствует восстановлению после генотоксического стресса». Молекулярная клетка. 23 (3): 307–18. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.06.016. PMID  16885021.
  17. ^ а б Мамели И., ван Вугт М.А., Смитс В.А., Семпл Д.И., Лемменс Б., Перракис А., Медема Р.Х., Фрейре Р. (октябрь 2006 г.). «Поло-подобная киназа-1 контролирует протеасомно-зависимую деградацию класпина во время восстановления контрольной точки». Текущая биология. 16 (19): 1950–5. Дои:10.1016 / j.cub.2006.08.026. PMID  16934469. S2CID  2928268.
  18. ^ а б Доррелло Н.В., Пескьяроли А., Гуардаваккаро Д., Колберн Н.Х., Шерман Н.Э., Пагано М. (октябрь 2006 г.). «Опосредованная S6K1 и betaTRCP деградация PDCD4 способствует трансляции белка и росту клеток». Наука. 314 (5798): 467–71. Bibcode:2006Научный ... 314..467D. Дои:10.1126 / наука.1130276. PMID  17053147. S2CID  84039829.
  19. ^ Sci Signal. 2012 5 июня; 5 (227): ra40. DOI: 10.1126 / scisignal.2002718. SCFβTrCP-опосредованная деградация eEF2K сочетает удлинение синтеза белка с контрольной точкой повреждения ДНК G2. Kruiswijk F., Yuniati L., Magliozzi R., Bolder R., Lim R., Low T., Heck A., Pagano M. и Guardavaccaro D.
  20. ^ а б Дуан С., Скаар Дж. Р., Кучай С., Тоши А., Канарек Н., Бен-Нерия Ю., Пагано М. (октябрь 2011 г.). «mTOR создает петлю автоамплификации, запуская βTrCP- и CK1α-зависимую деградацию DEPTOR». Молекулярная клетка. 44 (2): 317–24. Дои:10.1016 / j.molcel.2011.09.005. ЧВК  3212871. PMID  22017877.
  21. ^ а б Чжао Ю., Сюн X, Сунь Y (октябрь 2011 г.). «DEPTOR, ингибитор mTOR, является физиологическим субстратом SCF (βTrCP) E3 убиквитинлигазы и регулирует выживание и аутофагию». Молекулярная клетка. 44 (2): 304–16. Дои:10.1016 / j.molcel.2011.08.029. ЧВК  3216641. PMID  22017876.
  22. ^ а б Гао Д., Инузука Х, Тан М.К., Фукусима Х, Локасаль Дж. У., Лю П., Ван Л., Чжай Б., Чин Ю. Р., Шайк С., Лиссиотис К. А., Гиги С. П., Токер А., Кэнтли Л. К., Асара Дж. М., Харпер Дж. В., Вэй В. (Октябрь 2011 г.). «mTOR управляет собственной активацией через SCF (βTrCP) -зависимую деградацию ингибитора mTOR DEPTOR». Молекулярная клетка. 44 (2): 290–303. Дои:10.1016 / j.molcel.2011.08.030. ЧВК  3229299. PMID  22017875.
  23. ^ а б Дехан Э., Бассерманн Ф., Гуардаваккаро Д., Василивер-Шамис Г., Коэн М., Ловес К.Н., Дастин М., Хуанг, округ Колумбия, Тонтон Дж., Пагано М. (январь 2009 г.). «betaTrCP- и Rsk1 / 2-опосредованная деградация BimEL ингибирует апоптоз». Молекулярная клетка. 33 (1): 109–16. Дои:10.1016 / j.molcel.2008.12.020. ЧВК  2655121. PMID  19150432.
  24. ^ Winston JT, Strack P, Beer-Romero P, Chu CY, Elledge SJ, Harper JW (февраль 1999 г.). «Комплекс SCFbeta-TRCP-убиквитинлигаза специфически связывается с фосфорилированными мотивами деструкции в IkappaBalpha и бета-катенине и стимулирует убиквитинирование IkappaBalpha in vitro». Гены и развитие. 13 (3): 270–83. Дои:10.1101 / gad.13.3.270. ЧВК  316433. PMID  9990852.
  25. ^ а б Латрес Э., Чиаур Д.С., Пагано М. (январь 1999 г.). «Человеческий белок F-бокса бета-Trcp связывается с комплексом Cul1 / Skp1 и регулирует стабильность бета-катенина». Онкоген. 18 (4): 849–54. Дои:10.1038 / sj.onc.1202653. PMID  10023660.
  26. ^ Природа клеточной биологии. 2015; 17 (1): 31-43. DOI: 10,1038 / ncb3076. Деградация Cep68 и расщепление PCNT опосредуют удаление Cep215 из PCM, чтобы обеспечить разделение, разъединение и лицензирование центриолей. Пэган Дж. К., Марцио А., Джонс М. Дж., Сараф А., Джаллепалли П. В., Флоренс Л., Уошберн М. П., Пагано М.
  27. ^ Лю Ц., Като Ю., Чжан З., До В.М., Янкнер Б.А., Хе Икс (май 1999 г.). «Бета-Trcp связывает фосфорилирование-деградацию бета-катенина и регулирует формирование оси Xenopus». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (11): 6273–8. Дои:10.1073 / пнас.96.11.6273. ЧВК  26871. PMID  10339577.
  28. ^ а б c Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства человеческих белков F-бокса». Текущая биология. 9 (20): 1177–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID  10531035. S2CID  7467493.
  29. ^ Semplici F, Meggio F, Pinna LA, Oliviero S (июнь 2002 г.). «CK2-зависимое фосфорилирование фермента, конъюгированного с убиквитином E2 UBC3B, индуцирует его взаимодействие с бета-TrCP и усиливает деградацию бета-катенина». Онкоген. 21 (25): 3978–87. Дои:10.1038 / sj.onc.1205574. PMID  12037680.
  30. ^ а б c d Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (январь 2000 г.). «Гомодимер двух белков F-бокса betaTrCP1 или betaTrCP2 связывается с IkappaBalpha для сигнально-зависимого убиквитинирования». Журнал биологической химии. 275 (4): 2877–84. Дои:10.1074 / jbc.275.4.2877. PMID  10644755.
  31. ^ а б Мин К.В., Хван Дж. В., Ли Дж. С., Пак Й., Тамура Т. А., Юн Дж. Б. (май 2003 г.). «TIP120A связывается с кулинами и модулирует активность убиквитинлигазы». Журнал биологической химии. 278 (18): 15905–10. Дои:10.1074 / jbc.M213070200. PMID  12609982.
  32. ^ Mantovani F, Banks L (октябрь 2003 г.). «Регулирование супрессора больших опухолей дисков посредством зависимого от фосфорилирования взаимодействия с бета-TrCP рецептором убиквитинлигазы». Журнал биологической химии. 278 (43): 42477–86. Дои:10.1074 / jbc.M302799200. PMID  12902344.
  33. ^ а б Спенсер Э., Цзян Дж., Чен З.Дж. (февраль 1999 г.). "Сигнально-индуцированное убиквитинирование IkappaBalpha белком F-бокса Slimb / beta-TrCP". Гены и развитие. 13 (3): 284–94. Дои:10.1101 / gad.13.3.284. ЧВК  316434. PMID  9990853.
  34. ^ Фонг А., Sun SC (июнь 2002 г.). «Генетические доказательства важной роли белка, содержащего повторы бета-трансдуцина, в индуцируемом процессинге NF-каппа B2 / p100». Журнал биологической химии. 277 (25): 22111–4. Дои:10.1074 / jbc.C200151200. PMID  11994270.
  35. ^ Ватсяян Дж., Цин Дж., Сяо Дж., Ху Дж. (Сентябрь 2008 г.). «Модификация SUMO1 NF-kappaB2 / p100 необходима для индуцированного стимулом фосфорилирования и процессинга p100». Отчеты EMBO. 9 (9): 885–90. Дои:10.1038 / embor.2008.122. ЧВК  2529344. PMID  18617892.
  36. ^ Уэстбрук Т.Ф., Ху Г., Анг XL, Маллиган П., Павлова Н.Н., Лян А., Ленг И., Маер Р., Ши И., Харпер Дж. В., Элледж С.Дж. (март 2008 г.). «SCFbeta-TRCP контролирует онкогенную трансформацию и нейральную дифференцировку через деградацию REST». Природа. 452 (7185): 370–4. Bibcode:2008 Натур.452..370Вт. Дои:10.1038 / природа06780. ЧВК  2688689. PMID  18354483.
  37. ^ Strack P, Caligiuri M, Pelletier M, Boisclair M, Theodoras A, Beer-Romero P, Glass S, Parsons T., Copeland RA, Auger KR, Benfield P, Brizuela L, Rolfe M (июль 2000 г.). «SCF (бета-TRCP) и зависимое от фосфорилирования убиквитинирование I каппа B альфа, катализируемое Ubc3 и Ubc4». Онкоген. 19 (31): 3529–36. Дои:10.1038 / sj.onc.1203647. PMID  10918611.
  38. ^ «База данных молекулярных взаимодействий». Архивировано из оригинал на 2006-05-06. Получено 2012-05-08.
  39. ^ Уголков А., Чжан Б., Ямасита К., Билим В., Май М., Фукс С.Ю., Минамото Т. (август 2004 г.). «Связь между бета-TrCP, рецептором убиквитинлигазы Е3, бета-катенином и NF-kappaB при колоректальном раке». Журнал Национального института рака. 96 (15): 1161–70. Дои:10.1093 / jnci / djh219. PMID  15292388.
  40. ^ Müerköster S, Arlt A, Sipos B, Witt M, Grossmann M, Klöppel G, Kalthoff H, Fölsch UR, Schäfer H (февраль 2005 г.). «Повышенная экспрессия субъединицы рецептора E3-убиквитинлигазы betaTRCP1 связана с активацией конститутивного ядерного фактора-kappaB и химиорезистентностью в клетках карциномы поджелудочной железы». Исследования рака. 65 (4): 1316–24. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-1626. PMID  15735017.
  41. ^ Koch A, Waha A, Hartmann W, Hrychyk A, Schüller U, Waha A, Wharton KA, Fuchs SY, von Schweinitz D, Pietsch T. (июнь 2005 г.). «Повышенная экспрессия антагонистов Wnt - обычное явление при гепатобластомах». Клинические исследования рака. 11 (12): 4295–304. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-1162. PMID  15958610.
  42. ^ Шпигельман В.С., Тан В., Чан А.М., Игараши М., Ааронсон С.А., Сассун Д.А., Като М., Слага Т.Дж., Фукс С.Ю. (сентябрь 2002 г.). «Индукция гомолога рецептора убиквитинлигазы Slimb посредством передачи сигналов митогена». Журнал биологической химии. 277 (39): 36624–30. Дои:10.1074 / jbc.M204524200. PMID  12151397.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение