HOXD3 - HOXD3

HOXD3
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXD3, HOX1D, HOX4, HOX4A, Hox-4.1, гомеобокс D3
Внешние идентификаторы	OMIM: 142980 MGI: 96207 ГомолоГен: 5034 Генные карты: HOXD3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	176,173,102 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	74,748,442 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• агрессивный; • нуклеоплазма; • ядро клетки; • ядерное тело;
Биологический процесс	• Notch сигнальный путь; • морфогенез языкоглоточного нерва; • морфогенез эмбриональной скелетной системы; • развитие многоклеточного организма; • развитие щитовидной железы; • развитие хряща; • положительная регуляция экспрессии генов; • адгезия клеточного матрикса; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция дифференцировки нейронов; • транскрипция, ДНК-шаблон; • спецификация переднего / заднего рисунка; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3232
	15434
	ENSG00000128652
	ENSMUSG00000079277
	P31249
	P09027
	NM_006898
	NM_010468
	NP_008829
	NP_034598
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин Hox-D3 это белок что у людей кодируется HOXD3 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству генов гомеобоксов. Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство факторов транскрипции, которые играют важную роль в морфогенезе всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя схожими кластерами генов гомеобокса, HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, расположенными на разных хромосомах, состоящих из 9-11 генов, расположенных тандемно. Этот ген является одним из нескольких генов HOXD гомеобокса, расположенных в областях хромосомы 2q31-2q37. Делеции, которые удаляли весь кластер генов HOXD или 5'-конец этого кластера, были связаны с серьезными аномалиями конечностей и гениталий. Белок, кодируемый этим геном, может играть роль в регуляции процессов клеточной адгезии.^[7]

Смотрите также

Homeobox

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128652 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079277 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.
^ Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^а ^б "Entrez Gene: HOXD3 homeobox D3".

дальнейшее чтение

Танигучи Ю., Фудзи А., Мориучи Т. (октябрь 1992 г.). «Клонирование и секвенирование гена гомеобокса человека HOX4A». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1132 (3): 332–4. Дои:10.1016 / 0167-4781 (92) 90173-в.. PMID 1358204.
Magli MC, Barba P, Celetti A, De Vita G, Cillo C, Boncinelli E (июль 1991 г.). «Координированная регуляция генов HOX в гемопоэтических клетках человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (14): 6348–52. Bibcode:1991ПНАС ... 88.6348М. Дои:10.1073 / pnas.88.14.6348. ЧВК 52080. PMID 1712489.
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (декабрь 1989 г.). «Семейство генов HOX человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (24): 10385–402. Дои:10.1093 / nar / 17.24.10385. ЧВК 335308. PMID 2574852.
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г., Сторнаиуоло А., Кафьеро М., Файелла А., Симеоне А. (1990). «Организация генов гомеобокса класса I человека». Геном. 31 (2): 745–56. Дои:10.1139 / g89-133. PMID 2576652.
Канниццаро Л.А., Кроче С.М., Гриффин К.А., Симеоне А., Бончинелли Е., Хюбнер К. (июль 1987 г.). "Гены, содержащие гомеобокс человека, расположены в областях хромосомы 2q31 ---- 2q37 и 12q12 ---- 12q13". Американский журнал генетики человека. 41 (1): 1–15. ЧВК 1684175. PMID 2886047.
Танигучи Ю., Комацу Н., Мориучи Т. (май 1995 г.). «Сверхэкспрессия гена гомеобокса HOX4A (HOXD3) в HEL-клетках эритролейкемии человека приводит к изменению адгезионных свойств». Кровь. 85 (10): 2786–94. Дои:10.1182 / blood.V85.10.2786.bloodjournal85102786. PMID 7742539.
Guazzi S, Lonigro R, Pintonello L, Boncinelli E, Di Lauro R, Mavilio F (июль 1994 г.). «Ген фактора транскрипции щитовидной железы-1 является кандидатом-мишенью для регуляции Hox-белками». Журнал EMBO. 13 (14): 3339–47. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06636.x. ЧВК 395231. PMID 7913891.
Мэнли Н.Р., Капеччи М.Р. (март 1998 г.). «Паралоги Hox группы 3 регулируют развитие и миграцию тимуса, щитовидной и паращитовидных желез». Биология развития. 195 (1): 1–15. Дои:10.1006 / dbio.1997.8827. PMID 9520319.
Дель Кампо М., Джонс М.С., Веракса А.Н., Карри С.Дж., Джонс К.Л., Маскарелло Д.Т., Али-Кан-Каттс З., Драмхеллер Т., Макгиннис В. (июль 1999 г.). «Монодактильные конечности и аномальные гениталии связаны с гемизиготностью в области 2q31 человека, которая включает кластер HOXD». Американский журнал генетики человека. 65 (1): 104–10. Дои:10.1086/302467. ЧВК 1378080. PMID 10364522.
Майерс К., Шарбоно А., Будро Н. (январь 2000 г.). «Homeobox B3 способствует морфогенезу и ангиогенезу капилляров». Журнал клеточной биологии. 148 (2): 343–51. Дои:10.1083 / jcb.148.2.343. ЧВК 2174277. PMID 10648567.
Лимонги MZ, Pelliccia F, Gaddini L, Rocchi A (2000). «Кластеризация двух хрупких сайтов и семи генов гомеобокса в области хромосомы человека 2q31 -> q32.1». Цитогенетика и клеточная генетика. 90 (1–2): 151–3. Дои:10.1159/000015651. PMID 11060466. S2CID 35579702.
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёсихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология. 65 (2): 50–62. Дои:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Окубо Ю., Хамада Дж., Такахаши Ю., Тада М., Цуцумида А., Фуруучи К., Аояма Т., Сугихара Т., Мориучи Т. (2002). «Трансдукция HOXD3-антисмысла в клетки меланомы человека приводит к снижению инвазивной и подвижной активности». Клинические и экспериментальные метастазы. 19 (6): 503–11. Дои:10.1023 / А: 1020346211686. PMID 12405287. S2CID 2728036.
Boudreau NJ, Varner JA (февраль 2004 г.). «Фактор транскрипции гомеобокса Hox D3 способствует экспрессии и функции интегрина альфа5бета1 во время ангиогенеза». Журнал биологической химии. 279 (6): 4862–8. Дои:10.1074 / jbc.M305190200. PMID 14610084.
Hansen SL, Myers CA, Charboneau A, Young DM, Boudreau N (декабрь 2003 г.). «HoxD3 ускоряет заживление ран у мышей с диабетом». Американский журнал патологии. 163 (6): 2421–31. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63597-3. ЧВК 1892363. PMID 14633614.
Чен Ю., Сюй Б., Ардериу Г., Хашимото Т., Янг В. Л., Будро Н., Ян Г. Ю. (ноябрь 2004 г.). «Ретровирусная доставка гена гомеобокса D3 индуцирует церебральный ангиогенез у мышей». Журнал церебрального кровотока и метаболизма. 24 (11): 1280–7. Дои:10.1097 / 01.WCB.0000141770.09022.AB. PMID 15545924.

внешние ссылки

HOXD3 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128652 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079277 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: HOXD3 homeobox D3".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]