PRRX1 - PRRX1

PRRX1
Идентификаторы
Псевдонимы	PRRX1, AGOTC, PHOX1, PMX1, PRX-1, PRX1, связанный гомеобокс 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 167420 MGI: 97712 ГомолоГен: 7896 Генные карты: PRRX1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	170,739,421 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	163,313,710 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции; • Связывание ДНК; • Привязка коробочного домена HMG; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• морфогенез эмбриональной скелетной системы; • развитие неба; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • определение судьбы нейрона; • положительная регуляция сглаженного сигнального пути; • регуляция регенерации проекций нейронов; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • поддержание популяции нейрональных стволовых клеток; • развитие многоклеточного организма; • развитие хряща; • положительное регулирование пролиферации мезенхимальных клеток; • эмбриональный морфогенез конечностей; • морфогенез внутреннего уха; • морфогенез артерии; • морфогенез среднего уха; • морфогенез эмбрионального черепного скелета; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5396
	18933
	ENSG00000116132
	ENSMUSG00000026586
	P54821
	P63013
	NM_006902; NM_022716
	NM_001025570; NM_011127; NM_175686
	NP_008833; NP_073207
	NP_001020741; NP_035257; NP_783617
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Парный родственный гомеобокс 1 это белок что у людей кодируется PRRX1 ген.^[5]^[6]

Функция

ДНК-ассоциированный белок, кодируемый этим геном, является членом парного семейства гомеобокс белки, локализованные в ядре. Белок функционирует как коактиватор транскрипции, усиливая ДНК-связывающую активность фактор ответа сыворотки, белок, необходимый для индукции генов факторами роста и дифференцировки. Белок регулирует мышцы креатинкиназа, что указывает на роль в создании разнообразных мезодермальный типы мышц. Альтернативный сплайсинг дает две изоформы, которые различаются по численности и паттернам экспрессии.^[6]

Роль в дифференцировке мезенхимальных стволовых клеток

Prrx1 выражение ограничено мезодерма в течение эмбриональное развитие, и как Prrx1, так и Prrx2 выражаются в мезенхимальный ткани у взрослых мышей.^[7]^[8]^[9]^[10]^[11] Мыши, у которых отсутствуют как Prrx1, так и Prrx2, имеют глубокие дефекты дифференцировки мезенхимальных клеток в черепно-лицевой область, край.^[9]^[12] Несколько недавних исследований демонстрируют, что PRRX1 может регулировать дифференцировку мезенхимальных предшественников. Например, PRRX1 ингибирует адипогенез, активируя трансформирующий фактор роста-бета (TGF-бета) передача сигналов,^[13] а также действует после фактор некроза опухоли альфа подавлять остеобласт дифференциация.^[14]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116132 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026586 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Грюнеберг Д.А., Натесан С., Александр С., Гилман М.З. (сентябрь 1992 г.). «Белки гомеодомена человека и дрозофилы, которые усиливают ДНК-связывающую активность сывороточного фактора ответа». Наука. 257 (5073): 1089–95. Дои:10.1126 / science.257.5073.1089. PMID 1509260. S2CID 1206059.
^ ^а ^б "Entrez Gene: PRRX1 спаренный гомеобокс 1".
^ Керн М.Дж., Витте Д.П., Валериус М.Т., Ароноу Б.Дж., Поттер СС (октябрь 1992 г.). «Новый мышиный ген гомеобокса, выделенный с помощью тканеспецифической стратегии клонирования ПЦР». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (19): 5189–95. Дои:10.1093 / nar / 20.19.5189. ЧВК 334304. PMID 1383943.
^ Nohno T, Koyama E, Myokai F, Taniguchi S, Ohuchi H, Saito T, Noji S (июль 1993 г.). «Ген гомеобокса курицы, связанный с парными дрозофилами, преимущественно экспрессируется в развивающейся конечности». Dev. Биол. 158 (1): 254–64. Дои:10.1006 / dbio.1993.1184. PMID 8101172.
^ ^а ^б Лу М.Ф., Ченг Х.Т., Керн М.Дж., Поттер С.С., Тран Б., Диквиш Т.Г., Мартин Дж.Ф. (февраль 1999 г.). «prx-1 функционирует совместно с другим парным геном гомеобокса, prx-2, чтобы поддерживать судьбу клеток в краниофациальной мезенхиме» (PDF). Разработка. 126 (3): 495–504. PMID 9876178.
^ Ху Ю.С., Чжоу Х., Карцогианнис В., Эйсман Дж. А., Мартин Т.Дж., Нг К.В. (ноябрь 1998 г.). «Экспрессия гена гомеобокса крысы, rHOX, в развивающихся и взрослых тканях мышей и регулирование экспрессии его мРНК в остеобластах с помощью костного морфогенетического белка 2 и белка, связанного с паратироидным гормоном». Мол. Эндокринол. 12 (11): 1721–32. Дои:10.1210 / me.12.11.1721. PMID 9817598.
^ Cserjesi P, Lilly B, Bryson L, Wang Y, Sassoon DA, Olson EN (август 1992 г.). «MHox: мезодермально ограниченный гомеодоменный белок, который связывает важный участок в усилителе креатинкиназы в мышцах». Разработка. 115 (4): 1087–101. PMID 1360403.
^ тен Берге Д., Брауэр А., Корвинг Дж., Мартин Дж. Ф., Мейлинк Ф. (октябрь 1998 г.). «Prx1 и Prx2 в скелетогенезе: роли в краниофациальной области, внутреннем ухе и конечностях». Разработка. 125 (19): 3831–42. PMID 9729491.
^ Du B, Cawthorn WP, Su A, Doucette CR, Yao Y, Hemati N, Kampert S, McCoin C, Broome DT, Rosen CJ, Yang G, MacDougald OA (февраль 2013 г.). «Связанный с парным фактором транскрипции гомеобокс 1 (Prrx1) ингибирует адипогенез путем активации передачи сигналов трансформирующего фактора роста-β (TGFβ)». J. Biol. Chem. 288 (5): 3036–47. Дои:10.1074 / jbc.M112.440370. ЧВК 3561528. PMID 23250756.
^ Лу Икс, Бек Г.Р., Гилберт Л.К., Камалье С.Е., Бейтман Н.В., Худ Б.Л., Конрадс Т.П., Керн М.Дж., Ю С., Чен Х., Нанес М.С. (январь 2011 г.). «Идентификация гомеобокса белка Prx1 (MHox, Prrx-1) как регулятора экспрессии остерикса и медиатора действия фактора некроза опухоли α при дифференцировке остеобластов». J. Bone Miner. Res. 26 (1): 209–19. Дои:10.1002 / jbmr.203. ЧВК 3179318. PMID 20683885.

дальнейшее чтение

Грюнеберг Д.А., Саймон К.Дж., Бреннан К., Гилман М. (1995). «Последовательно-специфическое нацеливание путей передачи ядерного сигнала с помощью гомеодоменных белков». Мол. Cell. Биол. 15 (6): 3318–26. Дои:10.1128 / MCB.15.6.3318. ЧВК 230565. PMID 7760827.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Грюнеберг Д.А., Генри Р.В., Брауэр А., Новина С.Д., Черият В., Рой А.Л., Гилман М. (октябрь 1997 г.). «Многофункциональный ДНК-связывающий белок, который способствует образованию комплексов фактор ответа сыворотки / гомеодомен: идентичность TFII-I». Genes Dev. 11 (19): 2482–93. Дои:10.1101 / gad.11.19.2482. ЧВК 316568. PMID 9334314.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Накамура Т., Ямадзаки Ю., Хатано Ю., Миура И. (1999). «NUP98 слит с геном гомеобокса PMX1 при остром миелогенном лейкозе человека с транслокацией хромосомы t (1; 11) (q23; p15)». Кровь. 94 (2): 741–7. Дои:10.1182 / blood.V94.2.741. PMID 10397741.
Катаока К., Ёситомо-Накагава К., Сиода С., Нисидзава М. (2001). «Набор Hox-белков взаимодействует с онкобелком Maf, подавляя его ДНК-связывание, трансактивацию и трансформирующую активность». J. Biol. Chem. 276 (1): 819–26. Дои:10.1074 / jbc.M007643200. PMID 11036080.
Норрис Р.А., Скотт К.К., Мур С.С., Стеттен Дж., Браун С.Р., Джабс Е.В., Вульфсберг Е.А., Ю Дж., Керн М.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Гены PRRX1 и PRRX2 человека: клонирование, экспрессия, геномная локализация и исключение как гены болезни для синдрома Нагера». Мамм. Геном. 11 (11): 1000–5. Дои:10.1007 / s003350010193. PMID 11063257. S2CID 9937434.
Джонс Ф. С., Мич Р., Эдельман Д. Б., Оки Р. Дж., Джонс П. Л. (июль 2001 г.). «Prx1 контролирует пролиферацию гладкомышечных клеток сосудов и экспрессию тенасцина-C и активируется с помощью Prx2 при легочных сосудистых заболеваниях». Circ. Res. 89 (2): 131–8. Дои:10.1161 / чч1401.093582. PMID 11463719.
Измайлова Э., Бертли Ф.М., Хуанг К., Макори Н, Миллер С.Дж., Янг Р.А., Альдовини А. (февраль 2003 г.). «ВИЧ-1 Tat перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Nat. Med. 9 (2): 191–7. Дои:10,1038 / нм 822. PMID 12539042. S2CID 26145639.
Wissmüller S, Kosian T, Wolf M, Finzsch M, Wegner M (2006). «Домен группы с высокой подвижностью белков Sox взаимодействует с ДНК-связывающими доменами многих факторов транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (6): 1735–44. Дои:10.1093 / нар / gkl105. ЧВК 1421504. PMID 16582099.
Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э., Каул Р., Сварбрек Д., Данхэм А., Скотт К.Э., Хоу К.Л., Вудфайн К., Спенсер С.К. и др. (Май 2006 г.). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID 16710414.
Ким Й.Дж., Ан Дж.Й., Лян П, Ип С., Чжан И, Пак Й.М. (январь 2007 г.). «Ген prx1 человека является мишенью для Nrf2 и активируется гипоксией / реоксигенацией: значение для биологии опухоли». Рак Res. 67 (2): 546–54. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2401. PMID 17234762.

внешняя ссылка

PRRX1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116132 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026586 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1509260-5] Грюнеберг Д.А., Натесан С., Александр С., Гилман М.З. (сентябрь 1992 г.). «Белки гомеодомена человека и дрозофилы, которые усиливают ДНК-связывающую активность сывороточного фактора ответа». Наука. 257 (5073): 1089–95. Дои:10.1126 / science.257.5073.1089. PMID 1509260. S2CID 1206059.

[entrez-6] а ^б "Entrez Gene: PRRX1 спаренный гомеобокс 1".

[pmid1383943-7] Керн М.Дж., Витте Д.П., Валериус М.Т., Ароноу Б.Дж., Поттер СС (октябрь 1992 г.). «Новый мышиный ген гомеобокса, выделенный с помощью тканеспецифической стратегии клонирования ПЦР». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (19): 5189–95. Дои:10.1093 / nar / 20.19.5189. ЧВК 334304. PMID 1383943.

[pmid8101172-8] Nohno T, Koyama E, Myokai F, Taniguchi S, Ohuchi H, Saito T, Noji S (июль 1993 г.). «Ген гомеобокса курицы, связанный с парными дрозофилами, преимущественно экспрессируется в развивающейся конечности». Dev. Биол. 158 (1): 254–64. Дои:10.1006 / dbio.1993.1184. PMID 8101172.

[pmid9876178-9] а ^б Лу М.Ф., Ченг Х.Т., Керн М.Дж., Поттер С.С., Тран Б., Диквиш Т.Г., Мартин Дж.Ф. (февраль 1999 г.). «prx-1 функционирует совместно с другим парным геном гомеобокса, prx-2, чтобы поддерживать судьбу клеток в краниофациальной мезенхиме» (PDF). Разработка. 126 (3): 495–504. PMID 9876178.

[pmid9817598-10] Ху Ю.С., Чжоу Х., Карцогианнис В., Эйсман Дж. А., Мартин Т.Дж., Нг К.В. (ноябрь 1998 г.). «Экспрессия гена гомеобокса крысы, rHOX, в развивающихся и взрослых тканях мышей и регулирование экспрессии его мРНК в остеобластах с помощью костного морфогенетического белка 2 и белка, связанного с паратироидным гормоном». Мол. Эндокринол. 12 (11): 1721–32. Дои:10.1210 / me.12.11.1721. PMID 9817598.

[pmid1360403-11] Cserjesi P, Lilly B, Bryson L, Wang Y, Sassoon DA, Olson EN (август 1992 г.). «MHox: мезодермально ограниченный гомеодоменный белок, который связывает важный участок в усилителе креатинкиназы в мышцах». Разработка. 115 (4): 1087–101. PMID 1360403.

[pmid9729491-12] тен Берге Д., Брауэр А., Корвинг Дж., Мартин Дж. Ф., Мейлинк Ф. (октябрь 1998 г.). «Prx1 и Prx2 в скелетогенезе: роли в краниофациальной области, внутреннем ухе и конечностях». Разработка. 125 (19): 3831–42. PMID 9729491.

[pmid23250756-13] Du B, Cawthorn WP, Su A, Doucette CR, Yao Y, Hemati N, Kampert S, McCoin C, Broome DT, Rosen CJ, Yang G, MacDougald OA (февраль 2013 г.). «Связанный с парным фактором транскрипции гомеобокс 1 (Prrx1) ингибирует адипогенез путем активации передачи сигналов трансформирующего фактора роста-β (TGFβ)». J. Biol. Chem. 288 (5): 3036–47. Дои:10.1074 / jbc.M112.440370. ЧВК 3561528. PMID 23250756.

[pmid20683885-14] Лу Икс, Бек Г.Р., Гилберт Л.К., Камалье С.Е., Бейтман Н.В., Худ Б.Л., Конрадс Т.П., Керн М.Дж., Ю С., Чен Х., Нанес М.С. (январь 2011 г.). «Идентификация гомеобокса белка Prx1 (MHox, Prrx-1) как регулятора экспрессии остерикса и медиатора действия фактора некроза опухоли α при дифференцировке остеобластов». J. Bone Miner. Res. 26 (1): 209–19. Дои:10.1002 / jbmr.203. ЧВК 3179318. PMID 20683885.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]