Фоторецепторный клеточно-специфический ядерный рецептор - Photoreceptor cell-specific nuclear receptor
В фоторецептор клеточно-специфический ядерный рецептор (PNR), также известный как NR2E3 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа E, член 3), представляет собой белок что у людей кодируется NR2E3 ген.[5] PNR является членом ядерный рецептор супер семья внутриклеточный факторы транскрипции.
Функция
PNR выражается исключительно в сетчатка. Основными генами-мишенями PNR являются: родопсин и несколько опсины которые необходимы для зрения.[6]
Строение и лиганды
Кристаллическая структура лиганд-связывающего домена PNR известна. По умолчанию он самодимеризуется в репрессорное состояние. Компьютерное моделирование, основанное на этой модели, показывает, что лиганд может вписаться в PNR и превратить его в активатор транскрипции. 13-цис-ретиноевая кислота является известным слабым агонистом, который помещается в такой карман, но физиологический лиганд неизвестен. Два синтетических соединения, 11A и 11B, кажутся агонистами, но не попадают в карман, а вместо этого действуют как аллостерические модуляторы.[7] Более поздний скрининг выявил другое соединение, называемое фоторегулин-1 (PR1), которое действует как обратный агонист, что, возможно, полезно при лечении пигментного ретинита.[8]
Клиническое значение
Мутации в NR2E3 ген был связан с несколькими наследственными заболеваниями сетчатки, включая синдром усиленного S-конуса (ESCS),[9] форма пигментный ретинит,[10] и синдром Гольдмана-Фавра.[11]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000278570 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032292 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Кобаяси М., Такедзава С., Хара К., Ю. Р. Т., Умесоно Ю., Агата К. и др. (Апрель 1999 г.). «Идентификация ядерного рецептора, специфичного для фоторецепторной клетки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (9): 4814–9. Bibcode:1999PNAS ... 96.4814K. Дои:10.1073 / пнас.96.9.4814. ЧВК 21774. PMID 10220376.
- ^ Milam AH, Rose L, Cideciyan AV, Barakat MR, Tang WX, Gupta N, et al. (Январь 2002 г.). «Ядерный рецептор NR2E3 играет роль в дифференцировке и дегенерации фоторецепторов сетчатки человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (1): 473–8. Дои:10.1073 / pnas.022533099. ЧВК 117584. PMID 11773633.
- ^ Тан MH, Чжоу XE, Soon FF, Li X, Li J, Yong EL и др. (2013). «Кристаллическая структура орфанного ядерного рецептора NR2E3 / лиганд-связывающего домена PNR демонстрирует димерную авто-репрессированную конформацию». PLOS ONE. 8 (9): e74359. Bibcode:2013PLoSO ... 874359T. Дои:10.1371 / journal.pone.0074359. ЧВК 3771917. PMID 24069298.
- ^ Накамура П.А., Тан С., Шимчук А.А., Динг С., Рех Т.А. (ноябрь 2016 г.). «Потенциал опосредованного малыми молекулами перепрограммирования фоторецепторов палочек для лечения пигментного ретинита». Исследовательская офтальмология и визуализация. 57 (14): 6407–6415. Дои:10.1167 / iovs.16-20177. ЧВК 5134355. PMID 27893103.
- ^ Хайдер Н.Б., Якобсон С.Г., Сидесиян А.В., Свидерски Р., Стреб Л.М., Сирби С. и др. (Февраль 2000 г.). «Мутация гена ядерного рецептора, NR2E3, вызывает синдром усиленного S-конуса, нарушение судьбы клеток сетчатки». Природа Генетика. 24 (2): 127–31. Дои:10.1038/72777. PMID 10655056. S2CID 19508439.
- ^ Гербер С., Розет Дж. М., Такезава С. И., дос Сантос Л. С., Лопес Л., Грибуваль О. и др. (Сентябрь 2000 г.). «Ген ядерных рецепторов, специфичных для фоторецепторных клеток (PNR), является причиной пигментного ретинита у криптоевреев из Португалии (Марранос), выживших из испанской инквизиции». Генетика человека. 107 (3): 276–84. Дои:10.1007 / s004390000350. HDL:10400.17/1708. PMID 11071390. S2CID 2774255.
- ^ Чавала С.Х., Сари А., Льюис Х., Пауэр Г.Дж., Симпсон Э., Хагстром С.А., Трабулси Е.И. (август 2005 г.). «Мутация Arg311Gln NR2E3 в семье с классическим синдромом Гольдмана-Фавра». Британский журнал офтальмологии. 89 (8): 1065–6. Дои:10.1136 / bjo.2005.068130. ЧВК 1772771. PMID 16024868.
дальнейшее чтение
- Chen F, Figueroa DJ, Marmorstein AD, Zhang Q, Petrukhin K, Caskey CT, Austin CP (декабрь 1999 г.). «Ретина-специфический ядерный рецептор: потенциальный регулятор клеточного ретинальдегид-связывающего белка, экспрессируемого в пигментном эпителии сетчатки и клетках Мюллера». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (26): 15149–54. Дои:10.1073 / пнас.96.26.15149. ЧВК 24788. PMID 10611353.
- Хайдер Н.Б., Якобсон С.Г., Сидесиян А.В., Свидерски Р., Стреб Л.М., Сирби С. и др. (Февраль 2000 г.). «Мутация гена ядерного рецептора, NR2E3, вызывает синдром усиленного S-конуса, нарушение судьбы клеток сетчатки». Природа Генетика. 24 (2): 127–31. Дои:10.1038/72777. PMID 10655056. S2CID 19508439.
- Рендторфф Н.Д., Виссинг Х., Тюмер З., Силахтароглу А., Томмеруп Н. (2000). «Присвоение гена NR2E3 хромосоме 9 мыши и хромосоме 15q22.33 -> q23 человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 89 (3–4): 279–80. Дои:10.1159/000015635. PMID 10965145. S2CID 34825159.
- Гербер С., Розет Дж. М., Такезава С. И., дос Сантос Л. С., Лопес Л., Грибуваль О. и др. (Сентябрь 2000 г.). «Ген ядерных рецепторов, специфичных для фоторецепторных клеток (PNR), является причиной пигментного ретинита у криптоевреев из Португалии (Марранос), выживших из испанской инквизиции». Генетика человека. 107 (3): 276–84. Дои:10.1007 / s004390000350. HDL:10400.17/1708. PMID 11071390. S2CID 2774255.
- Хайдер Н.Б., Наггерт Дж.К., Нишина П.М. (август 2001 г.). «Избыточная пролиферация колбочек из-за отсутствия функционального NR2E3 вызывает дисплазию и дегенерацию сетчатки у мышей rd7 / rd7». Молекулярная генетика человека. 10 (16): 1619–26. Дои:10.1093 / hmg / 10.16.1619. PMID 11487564.
- Milam AH, Rose L, Cideciyan AV, Barakat MR, Tang WX, Gupta N, et al. (Январь 2002 г.). «Ядерный рецептор NR2E3 играет роль в дифференцировке и дегенерации фоторецепторов сетчатки человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (1): 473–8. Дои:10.1073 / pnas.022533099. ЧВК 117584. PMID 11773633.
- Шарон Д., Сандберг М.А., Карузо Р.К., Берсон Э.Л., Дрийя Т.П. (сентябрь 2003 г.). «Общие мутации в NR2E3 при синдроме усиленного S-конуса, синдроме Гольдмана-Фавра и многих случаях комкованной пигментной дегенерации сетчатки». Архив офтальмологии. 121 (9): 1316–23. Дои:10.1001 / archopht.121.9.1316. PMID 12963616.
- Ченг Х., Ханна Х., О ЕС, Хикс Д., Миттон К. П., Сваруп А. (август 2004 г.). «Фоторецептор-специфический ядерный рецептор NR2E3 функционирует как активатор транскрипции в палочковидных фоторецепторах». Молекулярная генетика человека. 13 (15): 1563–75. Дои:10,1093 / hmg / ddh173. PMID 15190009.
- Бамстед О'Брайен К.М., Ченг Х., Цзян Й., Шульте Д., Сваруп А., Хендриксон А.Э. (август 2004 г.). «Экспрессия фоторецептор-специфического ядерного рецептора NR2E3 в палочковидных фоторецепторах сетчатки плода человека». Исследовательская офтальмология и визуализация. 45 (8): 2807–12. Дои:10.1167 / iovs.03-1317. PMID 15277507.
- Райт А.Ф., Реддик А.С., Шварц С.Б., Фергюсон Дж.С., Алеман Т.С., Келлнер У. и др. (Ноябрь 2004 г.). «Мутационный анализ генов NR2E3 и NRL при синдроме усиленного конуса S». Человеческая мутация. 24 (5): 439. Дои:10.1002 / humu.9285. PMID 15459973.
- Чен Дж., Раттнер А., Натанс Дж. (Январь 2005 г.). «Ядерный рецептор Nr2e3, специфичный для фоторецептора палочки, подавляет транскрипцию множества генов, специфичных для колбочек». Журнал неврологии. 25 (1): 118–29. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.3571-04.2005. ЧВК 6725199. PMID 15634773.
- Пэн Г.Х., Ахмад О., Ахмад Ф., Лю Дж., Чен С. (март 2005 г.). «Ядерный рецептор Nr2e3, специфичный для фоторецепторов, взаимодействует с Crx и оказывает противоположные эффекты на транскрипцию генов палочек и колбочек». Молекулярная генетика человека. 14 (6): 747–64. Дои:10.1093 / hmg / ddi070. PMID 15689355.
- Хаяси Т., Гекка Т., Гото-Омото С., Такеучи Т., Кубо А., Китахара К. (декабрь 2005 г.). «Новые мутации NR2E3 (R104Q, R334G), связанные с легкой формой синдрома усиленного S-конуса, демонстрируют сложную гетерозиготность». Офтальмология. 112 (12): 21152115.e1–2115.e10. Дои:10.1016 / j.ophtha.2005.07.002. PMID 16225923.
- Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Коппитерс Ф., Лерой Б.П., Бейсен Д., Хеллеманс Дж., Де Босшер К., Хэгеман Г. и др. (Июль 2007 г.). «Рецидивирующая мутация в первом цинковом пальце орфанного ядерного рецептора NR2E3 вызывает аутосомно-доминантный пигментный ретинит». Американский журнал генетики человека. 81 (1): 147–57. Дои:10.1086/518426. ЧВК 1950922. PMID 17564971.
внешняя ссылка
- NR2E3 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- NR2E3 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
- NR2E3 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9Y5X4 (Фоторецептор-специфический ядерный рецептор) на PDBe-KB.
Эта статья о ген на хромосома человека 15 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |