Фоторецепторный клеточно-специфический ядерный рецептор - Photoreceptor cell-specific nuclear receptor

NR2E3
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNR2E3, Nr2e3, A930035N01Rik, PNR, RNR, rd7, ESCS, RP37, ядерный рецептор подсемейства 2, член группы E 3
Внешние идентификаторыOMIM: 604485 MGI: 1346317 ГомолоГен: 84397 Генные карты: NR2E3
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение NR2E3
Геномное расположение NR2E3
Группа15q23Начинать71,792,638 бп[1]
Конец71,818,259 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NR2E3 208388 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001281446
NM_014249
NM_016346

NM_013708

RefSeq (белок)

NP_055064
NP_057430

NP_038736

Расположение (UCSC)Chr 15: 71.79 - 71.82 МбChr 9: 59.94 - 59.96 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В фоторецептор клеточно-специфический ядерный рецептор (PNR), также известный как NR2E3 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа E, член 3), представляет собой белок что у людей кодируется NR2E3 ген.[5] PNR является членом ядерный рецептор супер семья внутриклеточный факторы транскрипции.

Функция

PNR выражается исключительно в сетчатка. Основными генами-мишенями PNR являются: родопсин и несколько опсины которые необходимы для зрения.[6]

Строение и лиганды

Кристаллическая структура лиганд-связывающего домена PNR известна. По умолчанию он самодимеризуется в репрессорное состояние. Компьютерное моделирование, основанное на этой модели, показывает, что лиганд может вписаться в PNR и превратить его в активатор транскрипции. 13-цис-ретиноевая кислота является известным слабым агонистом, который помещается в такой карман, но физиологический лиганд неизвестен. Два синтетических соединения, 11A и 11B, кажутся агонистами, но не попадают в карман, а вместо этого действуют как аллостерические модуляторы.[7] Более поздний скрининг выявил другое соединение, называемое фоторегулин-1 (PR1), которое действует как обратный агонист, что, возможно, полезно при лечении пигментного ретинита.[8]

Клиническое значение

Мутации в NR2E3 ген был связан с несколькими наследственными заболеваниями сетчатки, включая синдром усиленного S-конуса (ESCS),[9] форма пигментный ретинит,[10] и синдром Гольдмана-Фавра.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000278570 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032292 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кобаяси М., Такедзава С., Хара К., Ю. Р. Т., Умесоно Ю., Агата К. и др. (Апрель 1999 г.). «Идентификация ядерного рецептора, специфичного для фоторецепторной клетки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (9): 4814–9. Bibcode:1999PNAS ... 96.4814K. Дои:10.1073 / пнас.96.9.4814. ЧВК  21774. PMID  10220376.
  6. ^ Milam AH, Rose L, Cideciyan AV, Barakat MR, Tang WX, Gupta N, et al. (Январь 2002 г.). «Ядерный рецептор NR2E3 играет роль в дифференцировке и дегенерации фоторецепторов сетчатки человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (1): 473–8. Дои:10.1073 / pnas.022533099. ЧВК  117584. PMID  11773633.
  7. ^ Тан MH, Чжоу XE, Soon FF, Li X, Li J, Yong EL и др. (2013). «Кристаллическая структура орфанного ядерного рецептора NR2E3 / лиганд-связывающего домена PNR демонстрирует димерную авто-репрессированную конформацию». PLOS ONE. 8 (9): e74359. Bibcode:2013PLoSO ... 874359T. Дои:10.1371 / journal.pone.0074359. ЧВК  3771917. PMID  24069298.
  8. ^ Накамура П.А., Тан С., Шимчук А.А., Динг С., Рех Т.А. (ноябрь 2016 г.). «Потенциал опосредованного малыми молекулами перепрограммирования фоторецепторов палочек для лечения пигментного ретинита». Исследовательская офтальмология и визуализация. 57 (14): 6407–6415. Дои:10.1167 / iovs.16-20177. ЧВК  5134355. PMID  27893103.
  9. ^ Хайдер Н.Б., Якобсон С.Г., Сидесиян А.В., Свидерски Р., Стреб Л.М., Сирби С. и др. (Февраль 2000 г.). «Мутация гена ядерного рецептора, NR2E3, вызывает синдром усиленного S-конуса, нарушение судьбы клеток сетчатки». Природа Генетика. 24 (2): 127–31. Дои:10.1038/72777. PMID  10655056. S2CID  19508439.
  10. ^ Гербер С., Розет Дж. М., Такезава С. И., дос Сантос Л. С., Лопес Л., Грибуваль О. и др. (Сентябрь 2000 г.). «Ген ядерных рецепторов, специфичных для фоторецепторных клеток (PNR), является причиной пигментного ретинита у криптоевреев из Португалии (Марранос), выживших из испанской инквизиции». Генетика человека. 107 (3): 276–84. Дои:10.1007 / s004390000350. HDL:10400.17/1708. PMID  11071390. S2CID  2774255.
  11. ^ Чавала С.Х., Сари А., Льюис Х., Пауэр Г.Дж., Симпсон Э., Хагстром С.А., Трабулси Е.И. (август 2005 г.). «Мутация Arg311Gln NR2E3 в семье с классическим синдромом Гольдмана-Фавра». Британский журнал офтальмологии. 89 (8): 1065–6. Дои:10.1136 / bjo.2005.068130. ЧВК  1772771. PMID  16024868.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка