ATF1 - ATF1

ATF1
Идентификаторы
Псевдонимы	ATF1, EWS-FUS / ATF-1, TREB36, активирующий фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 123803 MGI: 3037720 ГомолоГен: 3790 Генные карты: ATF1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 12 (человек)
Конец	50,821,162 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность гетеродимеризации белков; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • идентичное связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса;
Сотовый компонент	• Комплекс фактора транскрипции ATF1-ATF4; • комплекс регуляторов транскрипции; • нуклеоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • реакция на органическое циклическое соединение; • транскрипция, ДНК-шаблон; • положительная регуляция репликации ДНК; • положительная регуляция развития проекции нейронов; • реакция на ион кобальта; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • сборка клеточного макромолекулярного комплекса;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	466
	100040260
	ENSG00000123268
	н / д
	P18846
	н / д
	NM_005171
	н / д
	NP_005162
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Циклический АМФ-зависимый фактор транскрипции ATF-1 это белок что у людей кодируется ATF1 ген.

Этот ген кодирует активирующий фактор транскрипции, который принадлежит к подсемейству ATF и bZIP (основная область лейциновой молнии) семейство. Он влияет на клеточные физиологические процессы, регулируя экспрессию нижестоящих генов-мишеней, которые связаны с ростом, выживанием и другой клеточной активностью. Этот белок фосфорилируется по серину 63 в его индуцируемом киназой домене серин / треонинкиназами, цАМФ-зависимой протеинкиназой A, кальмодулин-зависимой протеинкиназой I / II, митоген- и стресс-активированная протеинкиназа и циклин-зависимая киназа 3 (cdk-3). Его фосфорилирование усиливает его трансактивационную и транскрипционную активность, а также усиливает трансформацию клеток.^[4]

Клиническое значение

Слияние этого гена и FUS на хромосоме 16 или EWSR1 на хромосоме 22, индуцированной транслокацией, генерирует химерные белки в ангиоматоидная фиброзная гистиоцитома и светлоклеточная саркома. Этот ген имеет псевдоген на 6 хромосоме.^[4]^[5]

Смотрите также

Активирующий фактор транскрипции

Взаимодействия

ATF1 показал взаимодействовать с:

дальнейшее чтение

Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей тела с транслокацией t (12; 22) хромосомы, кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген. 12 (1): 159–67. PMID 8552387.
Fujimura Y, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (октябрь 2001 г.). «Химерный белок EWS-ATF-1 в светлоклеточной саркоме мягких тканей ассоциируется с CREB-связывающим белком и мешает р53-опосредованной функции трансактивации». Онкоген. 20 (46): 6653–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1204684. PMID 11709699.
Рефусс Р.П., Уолтон К.М., Лорио М.М., Гудман Р.Х. (1991). «ЦАМФ-регулируемый энхансер-связывающий белок ATF-1 активирует транскрипцию в ответ на цАМФ-зависимую протеинкиназу А.». J. Biol. Chem. 266 (28): 18431–4. PMID 1655749.
Ёсимура Т., Фудзисава Дж., Ёсида М. (1990). «Множественные клоны кДНК, кодирующие ядерные белки, которые связываются с такс-зависимым энхансером HTLV-1: все они содержат структуру лейциновой молнии и основной аминокислотный домен». EMBO J. 9 (8): 2537–42. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07434.x. ЧВК 552284. PMID 2196176.
Хай Т.В., Лю Ф., Кукос В.Дж., Грин М.Р. (1990). «Клоны кДНК фактора транскрипции ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры». Genes Dev. 3 (12B): 2083–90. Дои:10.1101 / gad.3.12b.2083. PMID 2516827.
Понгубала Дж. М., Атчисон М. Л. (1995). «Активация фактора транскрипции 1 и модулятора элемента ответа на циклический АМФ может модулировать активность энхансера иммуноглобулина каппа 3 '». J. Biol. Chem. 270 (17): 10304–13. Дои:10.1074 / jbc.270.17.10304. PMID 7730336.
Лю Ф., Томпсон М.А., Вагнер С. и др. (1993). «Активирующий фактор транскрипции-1 может опосредовать Са (2 +) - и цАМФ-индуцируемую активацию транскрипции». J. Biol. Chem. 268 (9): 6714–20. PMID 8384217.
Дорси MJ, Tae HJ, Sollenberger KG и др. (1996). «B-ATF: новый белок bZIP человека, который ассоциируется с членами семейства факторов транскрипции AP-1». Онкоген. 11 (11): 2255–65. PMID 8570175.
Сан П., Лу Л., Маурер Р.А. (1996). «Регулирование активации фактора транскрипции-1 и белка, связывающего элемент ответа цАМФ, с помощью Ca2 + / кальмодулин-зависимых протеинкиназ типа I, II и IV». J. Biol. Chem. 271 (6): 3066–73. Дои:10.1074 / jbc.271.6.3066. PMID 8621702.
Шимомура А., Огава Ю., Китани Т. и др. (1996). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II усиливает активацию транскрипции за счет активации фактора транскрипции 1, но не белка, связывающего элемент ответа цАМФ». J. Biol. Chem. 271 (30): 17957–60. Дои:10.1074 / jbc.271.30.17957. PMID 8663317.
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Кобаяси М., Шимомура А., Хагивара М., Каваками К. (1997). «Фосфорилирование ATF-1 усиливает его связывание с ДНК и транскрипцию промотора гена субъединицы альфа 1 Na, K-АТФазы». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (4): 877–82. Дои:10.1093 / nar / 25.4.877. ЧВК 146500. PMID 9016641.
Soubt MK, Marksitzer R, Menoud PA, Nagamine Y (1998). «Роль тканеспецифического фактора транскрипции LFB3 в циклическом AMP-чувствительном энхансере гена активатора плазминогена урокиназного типа в клетках LLC-PK1». Мол. Клетка. Биол. 18 (8): 4698–706. Дои:10.1128 / mcb.18.8.4698. ЧВК 109056. PMID 9671480.
Ямагути Ю., Вада Т., Сузуки Ф. и др. (1998). «Казеинкиназа II взаимодействует с доменами bZIP нескольких факторов транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (16): 3854–61. Дои:10.1093 / nar / 26.16.3854. ЧВК 147779. PMID 9685505.
Пеллин А., Монтеагудо С., Лопес-Хинес С. и др. (1999). «Новый тип химерного продукта слияния генов EWS и ATFI при светлоклеточной саркоме (злокачественная меланома мягких частей тела)». Гены Хромосомы Рак. 23 (4): 358–60. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-2264 (199812) 23: 4 <358 :: AID-GCC11> 3.0.CO; 2-3. PMID 9824209.
Кабе Й., Гото М., Шима Д. и др. (1999). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора». J. Biol. Chem. 274 (48): 34196–202. Дои:10.1074 / jbc.274.48.34196. PMID 10567391.
Савада Дж., Симидзу Н., Сузуки Ф. и др. (2000). «Синергическая активация транскрипции с помощью hGABP и избранных членов семейства белков, связывающих фактор транскрипции / ответный элемент цАМФ». J. Biol. Chem. 274 (50): 35475–82. Дои:10.1074 / jbc.274.50.35475. PMID 10585419.
Houvras Y, Benezra M, Zhang H и др. (2000). «BRCA1 физически и функционально взаимодействует с ATF1». J. Biol. Chem. 275 (46): 36230–7. Дои:10.1074 / jbc.M002539200. PMID 10945975.
Кнёфлер М., Салех Л., Бауэр С. и др. (2000). «Промоторные элементы и факторы транскрипции, участвующие в дифференцировочно-зависимой экспрессии рибонуклеиновой кислоты мессенджера хорионического гонадотропина-альфа человека в термических ворсинчатых трофобластах». Эндокринология. 141 (10): 3737–48. Дои:10.1210 / en.141.10.3737. PMID 11014230.
Артур Дж. С., Коэн П. (2000). «MSK1 необходим для фосфорилирования CREB в ответ на митогены в эмбриональных стволовых клетках мыши». FEBS Lett. 482 (1–2): 44–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02031-7. PMID 11018520. S2CID 30094202.
Андреуччи Дж. Дж., Грант Д., Кокс Д. М. и др. (2002). «Состав и функция транскрипционных комплексов АР-1 при дифференцировке мышечных клеток». J. Biol. Chem. 277 (19): 16426–32. Дои:10.1074 / jbc.M110891200. PMID 11877423.

внешняя ссылка

ATF1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Человек ATF1 расположение генома и ATF1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

^ Шимомура А., Огава Ю., Китани Т., Фудзисава Х., Хагивара М. (июль 1996 г.). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II усиливает активацию транскрипции за счет активации фактора транскрипции 1, но не белка, связывающего элемент ответа цАМФ». J. Biol. Chem. 271 (30): 17957–60. Дои:10.1074 / jbc.271.30.17957. PMID 8663317.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123268 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-4] а ^б «Ген Entrez: ATF1, активирующий фактор транскрипции 1».

[pmid8401579-5] Zucman J, Delattre O, Desmaze C, Epstein AL, Stenman G, Speleman F, Fletchers CD, Aurias A, Thomas G (ноябрь 1993 г.). «Слияние генов EWS и ATF-1, индуцированное транслокацией t (12; 22) при злокачественной меланоме мягких частей тела». Нат Жене. 4 (4): 341–5. Дои:10.1038 / ng0893-341. PMID 8401579. S2CID 10944105.

[pmid10945975-6] Хуврас Ю., Бенезра М., Чжан Х., Манфреди Дж. Дж., Вебер Б. Л., Лихт Дж. Д. (ноябрь 2000 г.). «BRCA1 физически и функционально взаимодействует с ATF1». J. Biol. Chem. 275 (46): 36230–7. Дои:10.1074 / jbc.M002539200. PMID 10945975.

[pmid9685505-7] а ^б Ямагути Ю., Вада Т., Судзуки Ф., Такаги Т., Хасегава Дж., Ханда Х (август 1998 г.). «Казеинкиназа II взаимодействует с доменами bZIP нескольких факторов транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (16): 3854–61. Дои:10.1093 / nar / 26.16.3854. ЧВК 147779. PMID 9685505.

[pmid8552387-8] Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей тела с транслокацией t (12; 22) хромосомы, кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген. 12 (1): 159–67. PMID 8552387.

[pmid8663317_group=note-9] Шимомура А., Огава Ю., Китани Т., Фудзисава Х., Хагивара М. (июль 1996 г.). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II усиливает активацию транскрипции за счет активации фактора транскрипции 1, но не белка, связывающего элемент ответа цАМФ». J. Biol. Chem. 271 (30): 17957–60. Дои:10.1074 / jbc.271.30.17957. PMID 8663317.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[1]

Regulome
Активирует	фосфолипаза D
Активируется	CaMK II^[1]