Regulome - Википедия - Regulome
 | Эта статья не цитировать любой источники. (Октябрь 2009 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
Regulome относится ко всему набору регулирующих компонентов в клетка. Эти компоненты могут быть регулирующими элементами, гены, мРНК, белки, и метаболиты. Описание включает взаимодействие регуляторных эффектов между этими компонентами и их зависимость от таких переменных, как субклеточная локализация, ткань, стадия развития и патологическое состояние.
Составные части
Одним из основных игроков в клеточной регуляции являются факторы транскрипции, белки, регулирующие экспрессию генов. Другие белки, которые связываются с факторами транскрипции, образуют транскрипционные комплексы может изменять активность факторов транскрипции, например, блокируя их способность связываться с промоутер.
Сигнальные пути представляют собой группы белков, которые производят эффект в цепочке, которые передают сигнал от одной части клетки к другой части, например, связывая присутствие вещества снаружи клетки с активацией экспрессии гена.
Измерение
Высокопроизводительные технологии анализа биологических образцов (например, ДНК-микрочипы, протеомика анализ) позволяют измерять тысячи биологических компонентов, таких как мРНК, белки или метаболиты. Иммунопреципитация хроматина факторов транскрипции можно использовать для картирования сайтов связывания факторов транскрипции в геноме.
Такие методы позволяют исследователям изучать влияние определенных веществ и / или ситуаций на клеточный образец на геномном уровне (например, путем добавления лекарства или помещения клеток в стрессовую ситуацию). Полученная информация позволяет сделать вывод о частях регулома.
Моделирование
Одна из целей системная биология моделирование биологических процессов с использованием математика и компьютерное моделирование. Получение данных с помощью методов геномного анализа не всегда поддается интерпретации в основном из-за сложности данных и большого количества точек данных. Моделирование может обрабатывать данные и позволяет проверить гипотезу (например, ген A регулируется белком B), которая может быть проверена экспериментально.
Приложения
Полное знание этого регулома позволит исследователям полностью смоделировать поведение клеток. Это облегчит дизайн лекарств для терапии, контроль стволовая клетка дифференциация и прогноз болезнь.