ZBTB33 - ZBTB33

ZBTB33
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2LT7, 3FKC, 3М4Т, 3М8В, 4Ф6М, 4F6N
Идентификаторы
Псевдонимы	ZBTB33, ZNF-kaiso, ZNF348, цинковый палец и домен BTB, содержащий 33
Внешние идентификаторы	OMIM: 300329 MGI: 1927290 ГомолоГен: 4931 Генные карты: ZBTB33
Расположение гена (человек)
Chr.	Х-хромосома (человек)
Конец	120,258,398 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Х-хромосома (мышь)
Конец	38,197,046 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание метил-CpG; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • связывание нуклеиновой кислоты; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• клеточная мембрана; • ядрышко; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • Сигнальный путь Wnt; • транскрипция, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10009
	56805
	ENSG00000177485
	ENSMUSG00000048047
	Q86T24
	Q8BN78
	NM_006777; NM_001184742
	NM_001079513; NM_020256
	NP_001171671; NP_006768
	NP_001072981; NP_064652
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Регулятор транскрипции Kaiso это белок что у людей кодируется ZBTB33 ген.^[5] Этот ген кодирует регулятор транскрипции с бимодальной специфичностью связывания ДНК, который связывается с метилированным CGCG, а также с неметилированным консенсусным сайтом связывания KAISO TCCTGCNA. Белок содержит N-концевой домен POZ / BTB и 3 С-концевых мотива «цинковые пальцы». Он задействует репрессорный комплекс N-CoR, чтобы способствовать деацетилированию гистонов и формированию репрессивных структур хроматина в промоторах гена-мишени. Он может способствовать репрессии генов-мишеней сигнального пути Wnt, а также может активировать транскрипцию подмножества генов-мишеней за счет рекрутирования катенина дельта-2 (CTNND2). Его взаимодействие с катенином дельта-1 (CTNND1) ингибирует связывание как с метилированной, так и с неметилированной ДНК. Он также напрямую взаимодействует с ядерным рецептором импорта Importin-α2 (также известным как кариоферин альфа2 или когорта 1 RAG), который может опосредовать ядерный импорт этого белка. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие один и тот же белок.^[6]

Взаимодействия

ZBTB33 был показан взаимодействовать с участием HDAC3,^[7] Корепрессор ядерного рецептора 1^[7] и CTNND1.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000177485 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000048047 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ «Ген Entrez: цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33».
^ «ZBTB33 цинковый палец и домен BTB, содержащий 33 [Homo sapiens (человек)] - ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2016-03-22.
^ ^а ^б Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (Сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через метил-CpG-связывающий белок Kaiso». Молекулярная клетка. 12 (3): 723–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
^ Дэниел Дж. М., Рейнольдс AB (май 1999 г.). «Катенин p120 (ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции« цинковые пальцы »в домене BTB / POZ». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3614–23. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3614. ЧВК 84161. PMID 10207085.

дальнейшее чтение

Дэниел Дж. М., Рейнольдс AB (май 1999 г.). «Катенин p120 (ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции« цинковые пальцы »в домене BTB / POZ». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3614–23. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3614. ЧВК 84161. PMID 10207085.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Прохорчук А., Хендрих Б., Йоргенсен Х., Рузов А., Вильм М., Георгиев Г., Берд А., Прохорчук Е. (июль 2001 г.). «Катенин-партнер p120 Kaiso представляет собой зависимый от метилирования ДНК репрессор транскрипции». Гены и развитие. 15 (13): 1613–8. Дои:10.1101 / гад.198501. ЧВК 312733. PMID 11445535.
Дэниэл Дж. М., Иретон Р. К., Рейнольдс AB (июнь 2001 г.). «Моноклональные антитела к Kaiso: новый фактор транскрипции и p120ctn-связывающий белок». Гибридома. 20 (3): 159–66. Дои:10.1089/027245701750293484. PMID 11461664.
Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (Сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через метил-CpG-связывающий белок Kaiso». Молекулярная клетка. 12 (3): 723–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
Кондапалли Дж., Флозак А.С., Альбукерке М.Л. (март 2004 г.). «Напряжение ламинарного сдвига по-разному модулирует экспрессию генов катенина p120, фактора транскрипции Kaiso и кадгерина эндотелия сосудов в эндотелиальных клетках коронарных артерий человека». Журнал биологической химии. 279 (12): 11417–24. Дои:10.1074 / jbc.M306057200. PMID 14699141.
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Ким С.В., Пак Джи, Спринг К.М., Сатер А.К., Джи Х., Отчере А.А., Дэниел Дж. М., Маккри П.Д. (декабрь 2004 г.). «Неканонические сигналы Wnt модулируются репрессором транскрипции Kaiso и p120-catenin». Природа клеточной биологии. 6 (12): 1212–20. Дои:10.1038 / ncb1191. PMID 15543138. S2CID 19404686.
Рузов А., Дуникан Д.С., Прохорчук А., Пеннингс С., Станчева И., Прохорчук Е., Михан Р.Р. (декабрь 2004 г.). «Kaiso - это репрессор транскрипции всего генома, который необходим для развития амфибий». Развитие. 131 (24): 6185–94. Дои:10.1242 / dev.01549. PMID 15548582.
Kelly KF, Otchere AA, Graham M, Daniel JM (декабрь 2004 г.). "Ядерный импорт регулятора транскрипции BTB / POZ Kaiso". Журнал клеточной науки. 117 (Pt 25): 6143–52. Дои:10.1242 / jcs.01541. PMID 15564377.
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Субри А., ван Хенгель Дж., Партоенс Э., Кольперт С., Ван Марк Э., Уолтрегни Д., Рейнольдс А. Б., ван Рой Ф. (март 2005 г.). «Экспрессия и расположение ядра репрессора транскрипции Kaiso регулируются микросредой опухоли». Исследования рака. 65 (6): 2224–33. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-2020. PMID 15781635.
Spring CM, Kelly KF, O'Kelly I, Graham M, Crawford HC, Daniel JM (май 2005 г.). «Катенин p120ctn ингибирует Kaiso-опосредованную репрессию транскрипции матрилизина гена-мишени бета-катенина / TCF». Экспериментальные исследования клеток. 305 (2): 253–65. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.01.007. PMID 15817151.
Араньи Т., Фошо Б.А., Халфаллах О., Водждани Г., Биге Н.Ф., Маллет Дж., Мелони Р. (июль 2005 г.). «Ткань-специфическое метилирование гена тирозингидроксилазы человека обнаруживает новые регуляторные элементы в первом экзоне». Журнал нейрохимии. 94 (1): 129–39. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2005.03173.x. PMID 15953356.
Defossez PA, Kelly KF, Filion GJ, Pérez-Torrado R, Magdinier F, Menoni H, Nordgaard CL, Daniel JM, Gilson E (декабрь 2005 г.). «Человеческий энхансерный блокатор CTC-связывающий фактор взаимодействует с фактором транскрипции Kaiso». Журнал биологической химии. 280 (52): 43017–23. Дои:10.1074 / jbc.M510802200. PMID 16230345.

внешние ссылки

ZBTB33 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
FactorBook ZBTB33
ZBTB33 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
ZBTB33 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на человека Х хромосома и / или связанный с ним белок это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000177485 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000048047 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «Ген Entrez: цинковый палец ZBTB33 и домен BTB, содержащий 33».

[6] «ZBTB33 цинковый палец и домен BTB, содержащий 33 [Homo sapiens (человек)] - ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2016-03-22.

[pmid14527417-7] а ^б Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (Сентябрь 2003 г.). «N-CoR опосредует репрессию, зависящую от метилирования ДНК, через метил-CpG-связывающий белок Kaiso». Молекулярная клетка. 12 (3): 723–34. Дои:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.

[pmid10207085-8] Дэниел Дж. М., Рейнольдс AB (май 1999 г.). «Катенин p120 (ctn) взаимодействует с Kaiso, новым фактором транскрипции« цинковые пальцы »в домене BTB / POZ». Молекулярная и клеточная биология. 19 (5): 3614–23. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3614. ЧВК 84161. PMID 10207085.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]