COUP-TFII - Википедия - COUP-TFII

NR2F2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3CJW
Идентификаторы
Псевдонимы	NR2F2, ARP1, CHTD4, COUPTFB, COUPTFII, NF-E3, NR2F1, SVP40, TFCOUP2, COUP-TFII, член 2 группы F подсемейства ядерных рецепторов 2, COUPTF2, ARP-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 107773 MGI: 1352452 ГомолоГен: 7628 Генные карты: NR2F2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 15 (человек)
Конец	96,340,263 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	70,366,735 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • связывание ретиноевой кислоты; • активность гомодимеризации белков; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • связывание ионов цинка; • связывание ионов металлов; • активность рецепторов стероидных гормонов; • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• дифференцировка гигантских клеток трофобласта; • ответ на эстрадиол; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • морфогенез кровеносных сосудов; • отрицательная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы; • липидный обмен; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • развитие кровеносных сосудов плаценты; • формирование радиального рисунка; • миграция нейронов; • внутриутробное эмбриональное развитие; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • развитие лимфатических сосудов; • транскрипция, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция миграции эндотелиальных клеток; • развитие конечностей; • отрицательная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции, вовлеченная в коммит судьбы лимфатических эндотелиальных клеток; • развитие материнской плаценты; • оплодотворение; • развитие переднего мозга; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие скелетной мышечной ткани; • преобразование сигнала; • спецификация переднего / заднего рисунка; • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами; • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора; • положительная регуляция системного артериального давления;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7026
	11819
	ENSG00000185551
	ENSMUSG00000030551
	P24468
	P43135
	NM_021005; NM_001145155; NM_001145156; NM_001145157
	NM_009697; NM_183261
	NP_001138627; NP_001138628; NP_001138629; NP_066285
	NP_033827; NP_899084
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

COUP-TFII (Фактор транскрипции COUP 2), также известный как NR2F2 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа F, член 2) представляет собой белок что у людей кодируется NR2F2 ген.^[5]^[6] Акроним COUP означает cкурица овальбумин тыpstream промотер.

Функция

COUP-TFII играет решающую роль в контроле развития ряда тканей и органов, включая сердце, кровеносные сосуды, мышцы и конечности.^[7]^[8]

В рецептор глюкокортикоидов (GR) стимулирует COUP-TFII-индуцированный трансактивация в то время как COUP-TFII репрессирует транскрипционную активность GR.^[9]^[10] COUP-TFII взаимодействует с GATA2 подавлять адипоцит дифференциация.^[11]

Строение и лиганды

Структура LBD COUP-TF2 известна. Ретиноевой кислоты, хотя и не в физиологических концентрациях, активирует этот рецептор.^[12]

Взаимодействия

COUP-TFII продемонстрировал взаимодействовать с:

внешняя ссылка

Человек NR2F1 расположение генома и NR2F1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
Человек NR2F2 расположение генома и NR2F2 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P24468 (Фактор транскрипции COUP 2) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

Де Мартино М.Ю., Алеши С., Хрусос Г.П., Кино Т (2004). «Взаимодействие рецептора глюкокортикоидов и куриного овальбумина выше промотора - фактора транскрипции II (COUP-TFII): последствия для действия глюкокортикоидов на глюкозу, липопротеины и метаболизм ксенобиотиков». Анна. Акад. Наука. 1024 (1): 72–85. Bibcode:2004НЯСА1024 ... 72Д. Дои:10.1196 / Анналы.1321.006. PMID 15265774.
Митус-Снайдер М., Сладек Ф.М., Гинзбург Г.С., Куо С.Ф., Ладиас Дж. А., Дарнелл Дж. Э., Каратанасис С.К. (1992). «Антагонизм между регуляторным белком 1 аполипопротеина AI, Ear3 / COUP-TF и ядерным фактором гепатоцитов 4 модулирует экспрессию гена аполипопротеина CIII в клетках печени и кишечника». Мол. Клетка. Биол. 12 (4): 1708–18. Дои:10.1128 / MCB.12.4.1708. ЧВК 369614. PMID 1312668.
Ван Л.Х., Инг Н.Х., Цай С.Ю., О'Мэлли Б.В., Цай М.Дж. (1992). «COUP-TF составляют семейство функционально связанных факторов транскрипции». Джин Экспр. 1 (3): 207–16. ЧВК 5952191. PMID 1820218.
Ladias JA, Karathanasis SK (1991). «Регулирование гена аполипопротеина AI с помощью ARP-1, нового члена суперсемейства стероидных рецепторов». Наука. 251 (4993): 561–5. Bibcode:1991Научный ... 251..561L. Дои:10.1126 / science.1899293. PMID 1899293. S2CID 37214450.
Маркус С.Л., Уинроу С.Дж., Капоне Дж.П., Рачубинский Р.А. (1996). «Лиганд p56 (lck) служит коактиватором рецептора орфанного ядерного гормона». J. Biol. Chem. 271 (44): 27197–200. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27197. PMID 8910285.
Тено С., Анрике С., Рошфор Н., Кавай В. (1997). «Дифференциальное взаимодействие ядерных рецепторов с предполагаемым коактиватором транскрипции человека hTIF1». J. Biol. Chem. 272 (18): 12062–8. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID 9115274.
Чу К., Зинг Х. Х. (1998). «Ядерные орфанные рецепторы COUP-TFII и Ear-2 действуют как глушители промотора гена окситоцина человека». J. Mol. Эндокринол. 19 (2): 163–72. Дои:10.1677 / jme.0.0190163. PMID 9343308.
Бейли П., Сарторелли В., Хамамори Ю., Маскат Дж. Э. (1999). «Орфанный ядерный рецептор, COUP-TF II, ингибирует миогенез посредством посттранскрипционной регуляции функции MyoD: COUP-TF II напрямую взаимодействует с p300 и myoD». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (23): 5501–10. Дои:10.1093 / nar / 26.23.5501. ЧВК 147985. PMID 9826778.
Аврам Д., Измаил Дж. Э., Невривой Д. Д., Петерсон В. Дж., Ли Ш., Доуэлл П., Лейд М. (1999). «Гетеродимерные взаимодействия между членами семейства промоторных транскрипционных факторов куриного овальбумина, ARP1 и Ear2». J. Biol. Chem. 274 (20): 14331–6. Дои:10.1074 / jbc.274.20.14331. ЧВК 2823254. PMID 10318855.
Смирнов Д.А., Хоу С., Риккарди Р.П. (2000). «Ассоциация гистондеацетилазы с COUP-TF в опухолевых клетках, трансформированных Ad12, и ее потенциальная роль в отключении транскрипции MHC класса I». Вирусология. 268 (2): 319–28. Дои:10.1006 / viro.1999.0181. PMID 10704340.
Аврам Д., Поля A, Pretty On Top K, Невривой Д. Д., Измаил Дж. Э., Лейд М. (2000). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C2H2, участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной куриным овальбумином, вышестоящим промоторным фактором транскрипции фактора транскрипции (COUP-TF), орфанных ядерных рецепторов». J. Biol. Chem. 275 (14): 10315–22. Дои:10.1074 / jbc.275.14.10315. ЧВК 2819356. PMID 10744719.
Джордан Э.М., Уорли Т., Брин Г.А. (2003). «Регуляция транскрипции ядерного гена, кодирующего альфа-субъединицу комплекса АТФ-синтазы F1F0 митохондрий млекопитающих: роль орфанного ядерного рецептора, COUP-TFII / ARP-1». Биохимия. 42 (9): 2656–63. Дои:10.1021 / bi0268347. PMID 12614160.
Сато Й, Сузуки Т., Хидака К., Сато Х, Ито К., Ито С., Сасано Х (2003). «Иммунолокализация ядерных факторов транскрипции DAX-1 и COUP-TF II в нормальном яичнике человека: корреляция с иммунолокализацией адреналового 4-связывающего белка / стероидогенного фактора-1 во время менструального цикла». J. Clin. Эндокринол. Метаб. 88 (7): 3415–20. Дои:10.1210 / jc.2002-021723. PMID 12843196.
Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Курихара И., Шибата Х, Кобаяси С., Суда Н., Икеда Й, Йокота К., Мураи А., Сайто И., Рейни В.Е., Сарута Т. (2005). "Ubc9 и белковый ингибитор активированного STAT 1 активируют опосредованную вышестоящим промотором куриного овальбумина транскрипцию фактора I человеческого гена CYP11B2". J. Biol. Chem. 280 (8): 6721–30. Дои:10.1074 / jbc.M411820200. PMID 15611122.
Шибата Х., Кобаяси С., Курихара И., Суда Н., Йокота К., Мураи А., Икеда Ю., Сайто И., Рейни В.Е., Сарута Т. (2005). «COUP-TF и ко-регуляторы транскрипции в стероидогенезе надпочечников». Endocr. Res. 30 (4): 795–801. Дои:10.1081 / ERC-200044042. PMID 15666827. S2CID 37921753.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185551 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030551 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] «Ген Entrez: подсемейство 2 ядерных рецепторов NR2F2, группа F, член 2».

[pmid8530078-6] Цю Ю., Кришнан В., Цзэн З., Гилберт Д. Д., Коупленд Н. Г., Гибсон Л., Ян-Фенг Т., Дженкинс Н. А., Цай М. Дж., Цай С. Ю. (сентябрь 1995 г.). «Выделение, характеристика и хромосомная локализация генов COUP-TF I и II мыши и человека». Геномика. 29 (1): 240–6. Дои:10.1006 / geno.1995.1237. PMID 8530078.

[pmid10215630-7] Перейра Ф.А., Цю И, Чжоу Г., Цай М.Дж., Цай С.Ю. (апрель 1999 г.). «Орфанный ядерный рецептор COUP-TFII необходим для ангиогенеза и развития сердца». Genes Dev. 13 (8): 1037–49. Дои:10.1101 / gad.13.8.1037. ЧВК 316637. PMID 10215630.

[pmid15572686-8] Ли CT, Ли Л., Такамото Н., Мартин Дж. Ф., Демайо Ф. Дж., Цай М. Дж., Цай С. Ю. (декабрь 2004 г.). «Ядерный орфанный рецептор COUP-TFII необходим для развития конечностей и скелетных мышц». Мол. Клетка. Биол. 24 (24): 10835–43. Дои:10.1128 / MCB.24.24.10835-10843.2004. ЧВК 533959. PMID 15572686.

[pmid14739255-9] Де Мартино М.Ю., Бхаттачрия Н., Алеши С., Ичихо Т., Хрусос Г.П., Кино Т. (апрель 2004 г.). «Глюкокортикоидный рецептор и орфанный ядерный рецептор куриного овальбумина, вышестоящий промотор - фактор транскрипции II, взаимодействуют и взаимно влияют на транскрипционную активность друг друга: последствия для промежуточного метаболизма». Мол. Эндокринол. 18 (4): 820–33. Дои:10.1210 / me.2003-0341. PMID 14739255.

[pmid15265774-10] Де Мартино М.Ю., Алеши С., Хрусос Г.П., Кино Т. (июнь 2004 г.). «Взаимодействие рецептора глюкокортикоидов и куриного овальбумина выше промотора - фактора транскрипции II (COUP-TFII): последствия для действия глюкокортикоидов на глюкозу, липопротеины и метаболизм ксенобиотиков». Анна. Акад. Наука. 1024 (1): 72–85. Bibcode:2004НЯСА1024 ... 72Д. Дои:10.1196 / Анналы.1321.006. PMID 15265774.

[pmid18250317-11] Xu Z, Yu S, Hsu CH, Eguchi J, Rosen ED (февраль 2008 г.). «Орфанный ядерный рецептор куриного овальбумина выше промотора - фактор транскрипции II является критическим регулятором адипогенеза». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 105 (7): 2421–6. Bibcode:2008PNAS..105.2421X. Дои:10.1073 / pnas.0707082105. ЧВК 2268152. PMID 18250317.

[pmid18798693-12] Kruse SW, Suino-Powell K, Zhou XE, Kretschman JE, Reynolds R, Vonrhein C и др. (Сентябрь 2008 г.). «Идентификация орфанного ядерного рецептора COUP-TFII как рецептора, активируемого ретиноевой кислотой». PLOS Биология. 6 (9): e227. Дои:10.1371 / journal.pbio.0060227. ЧВК 2535662. PMID 18798693.

[pmid10704340-13] Смирнов Д.А., Хоу С., Риккарди Р.П. (март 2000 г.). «Ассоциация гистоновой деацетилазы с COUP-TF в опухолегенных Ad12-трансформированных клетках и ее потенциальная роль в отключении транскрипции MHC класса I». Вирусология. 268 (2): 319–28. Дои:10.1006 / viro.1999.0181. PMID 10704340.

[pmid8910285-14] Маркус С.Л., Уинроу С.Дж., Капоне Дж.П., Рачубински Р.А. (ноябрь 1996 г.). «Лиганд p56 (lck) служит коактиватором рецептора орфанного ядерного гормона». J. Biol. Chem. 271 (44): 27197–200. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27197. PMID 8910285.

[pmid10318855-15] Аврам Д., Измаил Дж. Э., Невриви Д. Д., Петерсон В. Дж., Ли Ш., Доуэлл П., Лейд М. (май 1999 г.). «Гетеродимерные взаимодействия между членами семейства промоторных транскрипционных факторов куриного овальбумина, ARP1 и Ear2». J. Biol. Chem. 274 (20): 14331–6. Дои:10.1074 / jbc.274.20.14331. ЧВК 2823254. PMID 10318855.

[pmid22693611-16] Личфилд Л.М., Риггс К.А., Хокенберри А.М., Оливер Л.Д., Барнхарт К.Г., Кай Дж., Пирс В.М., Иванова М.М., Бейтс П.Дж., Аппана С.Н., Датта С., Кулеша П., Макбрайан Дж., Янг Л.С., Клиндж К. «Идентификация и характеристика нуклеолина как коактиватора COUP-TFII транскрипции β рецептора ретиноевой кислоты в клетках рака груди». PLOS ONE. 7 (5): e38278. Bibcode:2012PLoSO ... 738278L. Дои:10.1371 / journal.pone.0038278. ЧВК 3365040. PMID 22693611.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]