ZEB2 - ZEB2

ZEB2
Белок ZEB2 PDB 2da7.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыZEB2, HSPC082, SIP-1, SIP1, SMADIP1, ZFHX1B, привязка электронного блока с цинковыми пальцами homeobox 2
Внешние идентификаторыOMIM: 605802 MGI: 1344407 ГомолоГен: 8868 Генные карты: ZEB2
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное местоположение для ZEB2
Геномное местоположение для ZEB2
Группа2q22.3Начинать144,364,364 бп[1]
Конец144,521,057 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ZEB2 203603 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001171653
NM_014795

RefSeq (белок)

NP_001165124
NP_055610

Расположение (UCSC)Chr 2: 144,36 - 144,52 МбChr 2: 44.98 - 45.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Цинковый палец E-box-binding homeobox 2 это белок что у людей кодируется ZEB2 ген.[5] Белок ZEB2 представляет собой фактор транскрипции что играет роль в трансформирующий фактор роста β (TGFβ) сигнальные пути, которые необходимы на раннем этапе развития плода.[6]

Функция

ZEB2 (ранее также известный как SMADIP1, SIP1) и его паралог млекопитающих ZEB1 принадлежит к семейству Zeb в классе факторов транскрипции гомеодомена ZF (цинковый палец). Белок ZEB2 имеет 8 цинковых пальцев и 1 гомеодомен.[7] Структура гомеодомена показана справа.

ZEB2 взаимодействует с рецептор-опосредованным активированным полноразмерным SMAD.[5] Активация рецепторов TGFβ вызывает фосфорилирование внутриклеточных эффекторных молекул, R-SMAD. ZEB2 является белком, связывающим R-SMAD, и действует как корепрессор транскрипции.

Транскрипты ZEB2 обнаруживаются в тканях, дифференцированных от нервный гребень такой как ганглии черепных нервов, ганглии задних корешков, симпатические ганглиозные цепи, то кишечная нервная система и меланоциты. ZEB2 также обнаруживается в тканях, которые не происходят от нервного гребня, включая стенку пищеварительного тракта, почки и скелетные мышцы.

Клиническое значение

Мутации в гене ZEB2 связаны с Синдром Мовата-Вильсона. Это заболевание проявляется мутации и даже полные делеции гена ZEB2. Мутации гена могут привести к тому, что ген вырабатывает нефункциональные белки ZEB2 или инактивирует функциональный ген в целом. Этот дефицит белка ZEB2 мешает развитию многих органов. Многие симптомы можно объяснить неравномерным развитием структур нервного гребня.[8]

Болезнь Гиршпрунга также имеет много симптомов, которые можно объяснить отсутствием ZEB2 во время развития нервов пищеварительного тракта. Это заболевание вызывает сильный запор и увеличение толстой кишки.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169554 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026872 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б "Entrez Gene: ZEB2 цинковый палец E-box связывание homeobox 2".
  6. ^ Bassez G, Camand OJ, Cacheux V, Kobetz A, Dastot-Le Moal F, Marchant D, Catala M, Abitbol M, Goossens M (март 2004 г.). «Плейотропная и разнообразная экспрессия транскриптов гена ZFHX1B во время развития мышей и человека поддерживает различные клинические проявления синдрома« Мовата-Вильсона »». Нейробиология болезней. 15 (2): 240–50. Дои:10.1016 / j.nbd.2003.10.004. PMID  15006694. S2CID  25770329.
  7. ^ Bürglin TR, Affolter M (июнь 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление». Хромосома. 125 (3): 497–521. Дои:10.1007 / s00412-015-0543-8. ЧВК  4901127. PMID  26464018.
  8. ^ Dastot-Le Moal F, Wilson M, Mowat D, Collot N, Niel F, Goossens M (апрель 2007 г.). «Мутации ZFHX1B у пациентов с синдромом Мовата-Вильсона». Человеческая мутация. 28 (4): 313–21. Дои:10.1002 / humu.20452. PMID  17203459. S2CID  37981110.
  9. ^ Сондерс С.Дж., Чжао В., Ардингер Х.Х. (ноябрь 2009 г.). «Комплексный анализ гена ZEB2 для синдрома Мовата-Вильсона в когорте Северной Америки: предлагаемый подход к молекулярной диагностике». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 149A (11): 2527–31. Дои:10.1002 / ajmg.a.33067. PMID  19842203. S2CID  22472646.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка