ZEB1 - ZEB1

ZEB1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2Э19
Идентификаторы
Псевдонимы	ZEB1, цинковый палец E-box связывание homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A
Внешние идентификаторы	OMIM: 189909 MGI: 1344313 ГомолоГен: 31779 Генные карты: ZEB1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 10 (человек)
Конец	31,529,814 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 18 (мышь)
Конец	5,775,467 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции; • связывание ионов цинка; • связывание фактора транскрипции; • связывание хроматина; • связывание ионов металлов; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание нуклеиновой кислоты; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Переплет электронного ящика; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• комплекс регуляторов транскрипции; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• процесс спецификации шаблона; • морфогенез эмбриональной скелетной системы; • регуляция дифференцировки гладкомышечных клеток; • развитие органов животных; • дифференциация клеток; • морфогенез полукружного канала; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • развитие нервной системы; • регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста; • регуляция дифференцировки Т-клеток в тимусе; • развитие центральной нервной системы; • развитие хряща; • регуляция пролиферации мезенхимальных клеток; • эмбриональный морфогенез глаза камерного типа; • морфогенез улитки; • иммунная реакция; • эмбриональный морфогенез; • клеточный ответ на аминокислотный стимул; • клеточная пролиферация; • отрицательная регуляция дифференцировки эпителиальных клеток; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательное регулирование пролиферации клеток; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция дифференцировки нейронов; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция дифференцировки эндотелиальных клеток; • цитокин-опосредованный сигнальный путь;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6935
	21417
	ENSG00000148516
	ENSMUSG00000024238
	P37275
	Q64318
NM_001128128; NM_001174093; NM_001174094; NM_001174095; NM_001174096;
	NM_030751; NM_001323638; NM_001323641; NM_001323642; NM_001323643; NM_001323644; NM_001323645; NM_001323646; NM_001323647; NM_001323648; NM_001323649; NM_001323650; NM_001323651; NM_001323652; NM_001323653; NM_001323654; NM_001323655; NM_001323656; NM_001323657; NM_001323658; NM_001323659; NM_001323660; NM_001323661; NM_001323662; NM_001323663; NM_001323664; NM_001323665; NM_001323666; NM_001323671; NM_001323672; NM_001323673; NM_001323674; NM_001323675; NM_001323676; NM_001323677; NM_001323678
	NM_011546; NM_001360981; NM_001360982
NP_001121600; NP_001167564; NP_001167565; NP_001167566; NP_001167567;
	NP_001310567; NP_001310570; NP_001310571; NP_001310572; NP_001310573; NP_001310574; NP_001310575; NP_001310576; NP_001310577; NP_001310578; NP_001310579; NP_001310580; NP_001310581; NP_001310582; NP_001310583; NP_001310584; NP_001310585; NP_001310586; NP_001310587; NP_001310588; NP_001310589; NP_001310590; NP_001310591; NP_001310592; NP_001310593; NP_001310594; NP_001310595; NP_001310600; NP_001310601; NP_001310602; NP_001310603; NP_001310604; NP_001310605; NP_001310606; NP_001310607; NP_110378
	NP_035676; NP_001347910; NP_001347911
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Цинковый палец E-box-binding homeobox 1 это белок что у людей кодируется ZEB1 ген.^[5]^[6]^[7]

ZEB1 (ранее известный как TCF8) кодирует цинковый палец и гомеодомен фактор транскрипции который подавляет специфические для Т-лимфоцитов IL2 экспрессия гена путем связывания с негативным регуляторным доменом 100 нуклеотидов 5-первичного IL2 сайт начала транскрипции.^[7]^[8] ZEB1 и его паралог млекопитающих ZEB2 принадлежит к семейству Zeb в классе факторов транскрипции гомеодомена ZF (цинковый палец). Белок ZEB1 имеет 7 цинковых пальцев и 1 гомеодомен.^[9] Структура гомеодомена показана справа.

Клиническое значение

Мутации гена связаны с задняя полиморфная дистрофия роговицы 3. ZEB1 подавляет E-кадгерин и побуждает эпителиально-мезенхимальный переход в груди и других карциномах.^[10] Недавнее исследование показало, что его роль в рак легких инвазивность и развитие метастазов.^[11]. ZEB1 способствует метастазированию карцином молочной железы в костную ткань, инактивируя передачу сигналов BMP за счет индукции экспрессии ингибиторов BMP.^{[нужна цитата ]}

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148516 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024238 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Williams TM, Montoya G, Wu Y, Eddy RL, Byers MG, Shows TB (сентябрь 1992 г.). «Ген TCF8, кодирующий белок цинкового пальца (Nil-2-a), находится на хромосоме человека 10p11.2». Геномика. 14 (1): 194–6. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80307-6. PMID 1427828.
^ Williams TM, Moolten D, Burlein J, Romano J, Bhaerman R, Godillot A, Mellon M, Rauscher FJ, Kant JA (декабрь 1991). «Идентификация белка цинкового пальца, который ингибирует экспрессию гена IL-2». Наука. 254 (5039): 1791–4. Bibcode:1991Научный ... 254,1791W. Дои:10.1126 / science.1840704. PMID 1840704.
^ ^а ^б "Entrez Gene: ZEB1 цинковый палец E-box связывание гомеобокс 1".
^ Williams TM, Moolten D, Burlein J, Romano J, Bhaerman R, Godillot A, Mellon M, Rauscher FJ, Kant JA (декабрь 1991 г.). «Идентификация белка цинкового пальца, который ингибирует экспрессию гена IL-2». Наука. 254 (5039): 1791–4. Bibcode:1991Научный ... 254,1791W. Дои:10.1126 / science.1840704. PMID 1840704.
^ Bürglin TR, Affolter M (июль 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление». Хромосома. 125 (3): 497–521. Дои:10.1007 / s00412-015-0543-8. ЧВК 4901127. PMID 26464018.
^ Эгер А., Айгнер К., Сондереггер С., Дампир Б., Олер С., Шрайбер М., Берк Дж., Кано А., Бьюг Х., Фойснер Р. (март 2005 г.). «DeltaEF1 является репрессором транскрипции E-кадгерина и регулирует пластичность эпителия в клетках рака груди». Онкоген. 31;24 (14): 2375–85. Дои:10.1038 / sj.onc.1208429. PMID 15674322.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)
^ Лю В., Хуан Ю. Дж., Лю Ц., Янг Ю. Ю., Лю Х., Цуй Дж. Г., Ченг И., Гао Ф., Цай Дж. М., Ли Б. Л. (апрель 2014 г.). «Ингибирование TBK1 ослабляет радиационно-индуцированный эпителиально-мезенхимальный переход клеток рака легкого человека A549 посредством активации GSK-3β и репрессии ZEB1». Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии. 94 (4): 362–70. Дои:10.1038 / labinvest.2013.153. PMID 24468793.

дальнейшее чтение

Франклин А.Дж., Джеттон Т.Л., Шелтон К.Д., Магнусон М.А. (октябрь 1994 г.). «BZP, новый сывороточный белок цинкового пальца, который ингибирует транскрипцию гена». Молекулярная и клеточная биология. 14 (10): 6773–88. Дои:10.1128 / MCB.14.10.6773. ЧВК 359208. PMID 7935395.
Ватанабе Ю., Каваками К., Хираяма Ю., Нагано К. (декабрь 1993 г.). «Факторы транскрипции, положительно и отрицательно регулирующие ген субъединицы альфа 1 Na, K-АТФазы». Журнал биохимии. 114 (6): 849–55. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124267. PMID 8138542.
Ikeda K, Halle JP, Stelzer G, Meisterernst M, Kawakami K (январь 1998 г.). «Участие отрицательного кофактора NC2 в активной репрессии фактором транскрипции гомеодомена цинкового пальца AREB6». Молекулярная и клеточная биология. 18 (1): 10–8. Дои:10.1128 / mcb.18.1.10. ЧВК 121442. PMID 9418848.
Тернер Дж., Кроссли М. (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика mCtBP2, корепрессора, который ассоциируется с основным Krüppel-подобным фактором и другими регуляторами транскрипции млекопитающих». Журнал EMBO. 17 (17): 5129–40. Дои:10.1093 / emboj / 17.17.5129. ЧВК 1170841. PMID 9724649.
Постиго А.А., декан округа Колумбия (июнь 1999 г.). «ZEB подавляет транскрипцию посредством взаимодействия с корепрессором CtBP». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (12): 6683–8. Bibcode:1999PNAS ... 96.6683P. Дои:10.1073 / pnas.96.12.6683. ЧВК 21975. PMID 10359772.
Hlubek F, Löhberg C, Meiler J, Jung A, Kirchner T, Brabletz T (апрель 2001 г.). «Tip60 представляет собой регулятор транскрипции, специфичный для определенного типа клеток». Журнал биохимии. 129 (4): 635–41. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a002901. PMID 11275565.
Локлин Р.М., Риггс Б.Л., Хикок К.С., Хортон Х.Ф., Бирн М.С., Хосла С. (декабрь 2001 г.). «Оценка регуляции генов костным морфогенетическим белком 2 в стромальных клетках костного мозга человека с использованием технологии массива генов». Журнал исследований костей и минералов. 16 (12): 2192–204. Дои:10.1359 / jbmr.2001.16.12.2192. PMID 11760832. S2CID 25397480.
Шахедуззаман С., Кришнан В., Петрович А., Биттнер М., Мельцер П., Трент Дж., Венкатесан С., Цайхнер С. (2002). «Влияние Nef ВИЧ-1 на профили экспрессии клеточных генов». Журнал биомедицинских наук. 9 (1): 82–96. Дои:10.1007 / BF02256581. PMID 11810028.
Гуайта С., Пуч И., Франси С., Гарридо М., Домингес Д., Батлле Е., Санчо Е., Дедар С., Де Эррерос А.Г., Баулида Дж. (Октябрь 2002 г.). «Улитка индукция перехода эпителия в мезенхиму в опухолевых клетках сопровождается репрессией MUC1 и экспрессией ZEB1». Журнал биологической химии. 277 (42): 39209–16. Дои:10.1074 / jbc.M206400200. PMID 12161443.
Константино М.Э., Стирман Р.П., Смит Г.Э., Дарлинг Д.С. (август 2002 г.). «Клеточно-специфическое фосфорилирование фактора транскрипции Zfhep». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 296 (2): 368–73. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00880-X. ЧВК 3682420. PMID 12163027.
Постиго А.А. (май 2003 г.). «Противоположные функции белков ZEB в регуляции пути передачи сигналов TGFbeta / BMP». Журнал EMBO. 22 (10): 2443–52. Дои:10.1093 / emboj / cdg225. ЧВК 155983. PMID 12743038.
Постиго А.А., Депп Дж. Л., Тейлор Дж. Дж., Кролл К. Л. (май 2003 г.). "Регулирование передачи сигналов Smad посредством дифференциального набора коактиваторов и корепрессоров белками ZEB". Журнал EMBO. 22 (10): 2453–62. Дои:10.1093 / emboj / cdg226. ЧВК 155984. PMID 12743039.
Диллнер Н.Б., Сандерс М.М. (январь 2004 г.). «Активация транскрипции с помощью гомеодоменного белка цинкового пальца дельта EF1 в эстрогеновых сигнальных каскадах». ДНК и клеточная биология. 23 (1): 25–34. Дои:10.1089/104454904322745907. PMID 14965470.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Симидзу С., Крафчак С., Фьюз Н., Эпштейн М.П., Штайнгарт М.Т., Шугар А., Эйбшитц-Цимхони М., Даунс, Калифорния, Ф. Розса, Трагер Э. Х., Рид Д. М., Бёнке М., Морой С. Е., Ричардс Дж. Э. (ноябрь 2004 г.). «Локус задней полиморфной дистрофии роговицы (PPCD3) отображается на хромосоме 10». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 130A (4): 372–7. Дои:10.1002 / ajmg.a.30267. ЧВК 1249494. PMID 15384081.
Eger A, Aigner K, Sonderegger S, Dampier B, Oehler S, Schreiber M, Berx G, Cano A, Beug H, Foisner R (март 2005 г.). «DeltaEF1 является репрессором транскрипции E-кадгерина и регулирует пластичность эпителия в клетках рака груди». Онкоген. 24 (14): 2375–85. Дои:10.1038 / sj.onc.1208429. PMID 15674322.

внешние ссылки

FactorBook ZEB1

Эта статья о ген на хромосома человека 10 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148516 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024238 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1427828-5] Williams TM, Montoya G, Wu Y, Eddy RL, Byers MG, Shows TB (сентябрь 1992 г.). «Ген TCF8, кодирующий белок цинкового пальца (Nil-2-a), находится на хромосоме человека 10p11.2». Геномика. 14 (1): 194–6. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80307-6. PMID 1427828.

[pmid1840704-6] Williams TM, Moolten D, Burlein J, Romano J, Bhaerman R, Godillot A, Mellon M, Rauscher FJ, Kant JA (декабрь 1991). «Идентификация белка цинкового пальца, который ингибирует экспрессию гена IL-2». Наука. 254 (5039): 1791–4. Bibcode:1991Научный ... 254,1791W. Дои:10.1126 / science.1840704. PMID 1840704.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: ZEB1 цинковый палец E-box связывание гомеобокс 1".

[autogenerated1-8] Williams TM, Moolten D, Burlein J, Romano J, Bhaerman R, Godillot A, Mellon M, Rauscher FJ, Kant JA (декабрь 1991 г.). «Идентификация белка цинкового пальца, который ингибирует экспрессию гена IL-2». Наука. 254 (5039): 1791–4. Bibcode:1991Научный ... 254,1791W. Дои:10.1126 / science.1840704. PMID 1840704.

[pmid26464018-9] Bürglin TR, Affolter M (июль 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление». Хромосома. 125 (3): 497–521. Дои:10.1007 / s00412-015-0543-8. ЧВК 4901127. PMID 26464018.

[10] Эгер А., Айгнер К., Сондереггер С., Дампир Б., Олер С., Шрайбер М., Берк Дж., Кано А., Бьюг Х., Фойснер Р. (март 2005 г.). «DeltaEF1 является репрессором транскрипции E-кадгерина и регулирует пластичность эпителия в клетках рака груди». Онкоген. 31;24 (14): 2375–85. Дои:10.1038 / sj.onc.1208429. PMID 15674322.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)

[pmid24468793-11] Лю В., Хуан Ю. Дж., Лю Ц., Янг Ю. Ю., Лю Х., Цуй Дж. Г., Ченг И., Гао Ф., Цай Дж. М., Ли Б. Л. (апрель 2014 г.). «Ингибирование TBK1 ослабляет радиационно-индуцированный эпителиально-мезенхимальный переход клеток рака легкого человека A549 посредством активации GSK-3β и репрессии ZEB1». Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии. 94 (4): 362–70. Дои:10.1038 / labinvest.2013.153. PMID 24468793.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]