KLF3 - Википедия - KLF3

KLF3
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1П7А, 1U85, 1U86
Идентификаторы
Псевдонимы	KLF3, BKLF, фактор типа Круппеля 3 (базовый), фактор типа Круппеля 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 609392 MGI: 1342773 ГомолоГен: 7396 Генные карты: KLF3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 4 (человек)
Конец	38,701,517 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 5 (мышь)
Конец	64,832,901 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • связывание нуклеиновой кислоты; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• развитие многоклеточного организма; • клеточный ответ на пептид; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51274
	16599
	ENSG00000109787
	ENSMUSG00000029178
	P57682
	Q60980
	NM_016531
	NM_008453
	NP_057615
	NP_032479
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Крюппель-подобный фактор 3 это белок что у людей кодируется KLF3 ген.

Структура

KLF3, первоначально называвшийся базовым фактором Крюппеля (BKLF), был третьим членом Крюппель-подобный фактор семья цинковый палец факторы транскрипции быть обнаруженным.^[5] Факторы транскрипции в этом семействе связывают ДНК в силу трех характерных трех C₂ЧАС₂ цинковые пальцы на их C-конец. Поскольку их ДНК-связывающие домены в семействе высококонсервативны, все белки KLF распознают боксы CACCC или CGCCC общей формы NCR CRC CCN (где N - любое основание, а R - пурин ).

Функция

В то время как C-конец похожи в разных KLF, N-конец варьируются, и, соответственно, разные KLF могут активировать или репрессировать транскрипцию, либо и то, и другое. KLF3, по-видимому, функционирует преимущественно как репрессор транскрипции. Это выключает гены. Это достигается путем привлечения корепрессоров С-концевого связывающего белка. CTBP1 и CTBP2.^[6]^[7] CtBP стыкуется с коротким мотивом (остатки 61-65) на N-конце KLF3 общей формы пролин - изолейцин - аспартат - лейцин - серин (мотив PIDLS).^[6]^[7] CtBP, в свою очередь, набирает гистон модификация ферментов для изменения хроматин и подавлять экспрессию генов.

KLF3 высоко экспрессируется в эритроцитах или эритроидном клоне. Здесь им управляет другой KLF, Erythroid KLF или KLF1, и его экспрессия увеличивается по мере созревания эритроидных клеток. Исследования в нокаутные мыши выявляют легкую анемию в отсутствие функционального KLF3 и дерепрессию нескольких генов-мишеней, которые содержат CACCC-боксы в своих регуляторных областях.^[8] Многие из этих генов активируются KLF1, следовательно, похоже, что KLF3 действует в петле отрицательной обратной связи, чтобы сбалансировать активирующий потенциал KLF1. KLF3 также регулирует другой репрессивный KLF, KLF8.^[9] Таким образом, KLF1, KLF3 и KLF8 работают в жесткой регулирующей сети. KLF3 и KLF8 могут иметь избыточные функции, поскольку у мышей, лишенных как KLF3, так и KLF8, обнаруживаются более серьезные дефекты, чем при любом одиночном нокауте. Они умирают в утробе матери примерно на 14 день беременности.^[10]

Помимо экспрессии в эритроидных клетках, KLF3 присутствует и в других типах клеток, и анализ нокаутные мыши выявил дефекты, затрагивающие жировая ткань^[11] и В-клетки.^[12] У мышей с дефицитом KLF3 меньше жировой ткани и признаки метаболического здоровья, что может быть связано с дерепрессией адипокин ген гормона адиполин.^[13] Роль KLF3 в В-лимфоцитах сложна, но, по-видимому, он действует в сети с KLF2 и KLF4 влиять на переключение между селезенка краевая зона и фолликулярные В-клетки.^[14]

Взаимодействия

KLF3 был показан взаимодействовать с:

CTBP2^[6]^[7] и
FHL3.^[6]

дальнейшее чтение

Тернер Дж, Кроссли М (2000). «Основные функции Крюппель-подобных факторов в сети взаимодействующих гематопоэтических транскрипционных факторов». Int. J. Biochem. Cell Biol. 31 (10): 1169–74. Дои:10.1016 / S1357-2725 (99) 00067-9. PMID 10582345.
Ван MJ, Цюй XH, Ван LS, Чжай Y, Wu SL, He FC (2003). «Клонирование кДНК, субклеточная локализация и тканевая экспрессия нового человеческого фактора транскрипции Krüppel-подобного: человеческого основного Krüppel-подобного фактора (hBKLF)». И Чуан Сюэ Бао. 30 (1): 1–9. PMID 12812068.
Пердомо Дж., Вергер А., Тернер Дж., Кроссли М. (2005). «Роль модификации SUMO в облегчении репрессии транскрипции с помощью BKLF». Мол. Клетка. Биол. 25 (4): 1549–59. Дои:10.1128 / MCB.25.4.1549-1559.2005. ЧВК 548027. PMID 15684403.
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК 1356129. PMID 16344560.
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

внешняя ссылка

Белок KLF3, человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109787 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029178 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[5] Crossley M (апрель 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей BKLF / TEF-2, основного белка, связывающего CACCC-бокс, в эритроидных клетках и некоторых других клетках». Мол. Клетка. Биол. 16 (4): 1695–705. Дои:10.1128 / mcb.16.4.1695. ЧВК 231156. PMID 8657145.

[pmid12556451-6] а ^б ^c ^d Тернер Дж, Николас Х, Епископ Д., Мэтьюз Дж. М., Кроссли М. (2003). «Белок LIM FHL3 связывает основной Krüppel-подобный фактор / Krüppel-подобный фактор 3 и его корепрессор C-концевой связывающий белок 2». J. Biol. Chem. 278 (15): 12786–95. Дои:10.1074 / jbc.M300587200. PMID 12556451.

[pmid9724649-7] а ^б ^c Тернер Дж, Кроссли М (1998). «Клонирование и характеристика mCtBP2, корепрессора, который ассоциируется с основным Krüppel-подобным фактором и другими регуляторами транскрипции млекопитающих». EMBO J. 17 (17): 5129–40. Дои:10.1093 / emboj / 17.17.5129. ЧВК 1170841. PMID 9724649.

[pmid22711990-8] Funnell AP, Norton LJ, Mak KS, Burdach J, Artuz CM, Twine NA, Wilkins MR, Power CA, Hung TT, Perdomo J, Koh P, Bell-Anderson KS, Orkin SH, Fraser ST, Perkins AC, Pearson RC, Crossley M (август 2012 г.). «CACCC-связывающий белок KLF3 / BKLF репрессирует подмножество генов-мишеней KLF1 / EKLF и необходим для правильного созревания эритроидов in vivo». Мол. Клетка. Биол. 32 (16): 3281–92. Дои:10.1128 / MCB.00173-12. ЧВК 3434552. PMID 22711990.

[9] Eaton SA, Funnell AP, Sue N, Nicholas H, Pearson RC, Crossley M (август 2008 г.). «Сеть Krüppel-подобных факторов (Klfs). Klf8 репрессируется Klf3 и активируется Klf1 in vivo». J. Biol. Chem. 283 (40): 26937–47. Дои:10.1074 / jbc.M804831200. ЧВК 2556010. PMID 18687676.

[pmid23716600-10] Фаннелл А.П., Мак К.С., Шпагат Н.А., Пелка Г.Дж., Нортон Л.Дж., Радзевич Т., Пауэр М., Уилкинс М.Р., Белл-Андерсон К.С., Фрейзер С.Т., Перкинс А.С., Там П.П., Пирсон Р.К., Кроссли М. (август 2013 г.). «Создание мышей с дефицитом KLF3 / BKLF и KLF8 показывает генетическое взаимодействие и роль этих факторов в подавлении эмбрионального гена глобина». Мол. Клетка. Биол. 33 (15): 2976–87. Дои:10.1128 / MCB.00074-13. ЧВК 3719677. PMID 23716600.

[pmid18391014-11] Сью Н., Джек Б.Х., Итон С.А., Пирсон Р.С., Фаннелл А.П., Тернер Дж., Чолидж Р., Дениер Дж., Бао С., Молеро-Навахас Дж. К., Перкинс А., Фудзивара И., Оркин С.Х., Белл-Андерсон К., Кроссли М. (июн. 2008 г.). «Целенаправленное нарушение гена основного фактора Круппеля (Klf3) показывает его роль в адипогенезе». Mol Cell Biol. 28 (12): 3967–78. Дои:10.1128 / MCB.01942-07. ЧВК 2423134. PMID 18391014.

[pmid22003205-12] Vu TT, Gatto D, Turner V, Funnell AP, Mak KS, Norton LJ, Kaplan W, Cowley MJ, Agenès F, Kirberg J, Brink R, Pearson RC, Crossley M (ноябрь 2011 г.). «Нарушение развития В-клеток в отсутствие фактора Крюппеля 3». J. Immunol. 187 (10): 5032–42. Дои:10.4049 / jimmunol.1101450. PMID 22003205.

[pmid23633521-13] Белл-Андерсон К.С., Фаннелл А.П., Уильямс Х., Мэт Джусо Х., Скалли Т., Лим В.Ф., Бурдах Дж. Г., Мак К.С., Найтс Эй-Джей, Хой А.Дж., Николас Х.Р., Сейнсбери А., Тернер Н., Пирсон Р.К., Кроссли М. (апрель 2013 ). «Потеря Kruppel-подобного фактора 3 (KLF3 / BKLF) приводит к усилению регуляции инсулино-сенсибилизирующего фактора адиполина (FAM132A / CTRP12 / C1qdc2)». Сахарный диабет. 62 (8): 2728–37. Дои:10.2337 / db12-1745. ЧВК 3717849. PMID 23633521.

[pmid21360637-14] Pearson RC, Funnell AP, Crossley M (февраль 2011 г.). «Фактор транскрипции« цинковый палец »млекопитающих, подобный Krüppel-фактор 3 (KLF3 / BKLF)». IUBMB Life. 63 (2): 86–93. Дои:10.1002 / iub.422. PMID 21360637. S2CID 38842040.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]