HOXB6 - HOXB6

HOXB6
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXB6, HOX2, HOX2B, HU-2, Hox-2.2, гомеобокс B6
Внешние идентификаторы	OMIM: 142961 MGI: 96187 ГомолоГен: 7366 Генные карты: HOXB6
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	48,604,992 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	96,301,569 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание РНК; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки;
Биологический процесс	• морфогенез эмбриональной скелетной системы; • развитие многоклеточного организма; • гомеостаз эритроцитов; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • спецификация переднего / заднего рисунка; • развитие эмбриональной скелетной системы; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3216
	15414
	ENSG00000108511
	ENSMUSG00000000690
	P17509
	P09023
	NM_018952; NM_156036; NM_156037; NM_001369397
	NM_008269
	NP_061825; NP_001356326
	NP_032295
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин Hox-B6 это белок что у людей кодируется HOXB6 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген входит в состав Antp гомеобокс семьи и кодирует белок с помощью гомеобокса ДНК-связывающий домен. Он включен в кластер генов гомеобокса B, расположенный на хромосома 17. Кодируемый белок функционирует как специфичный для последовательности фактор транскрипции, который участвует в развитии, включая развитие легких и кожи, и локализован как в ядре, так и в цитоплазме. Измененная экспрессия этого гена или изменение субклеточной локализации его белка связаны с некоторыми случаями острый миелоидный лейкоз и колоректальный рак.^[7]

Во время разработки

Ген HOX B6 экспрессируется только в эритоидных клетках-предшественниках, которые являются предшественниками красных кровяных телец, используемых для транспорта кислорода и углекислого газа по всему телу. В процессе развития формирование фактора гена HOX происходит на первых этапах внутриутробного развития плода, а именно вскоре после установления мезодерма, который является «средним слоем» будущего эмбриона. Однако HOX B6 экспрессируется только после того, как недифференцированные стволовые клетки эмбриона переходят в эритпоэтическую фазу. Исследование показало, что HOX B6 не экспрессируется в гемопоэтических стволовых клетках, расположенных в красном костном мозге, которые являются клетками-предшественниками для всех типов клеток крови, или первичными зародышевыми клетками (PGC), предшественниками клеток, передаваемых в каждом поколении. .^[8] Поскольку HOX B6 является фактором транскрипции, он регулирует эритпоогенез (образование красных кровяных телец), используя мРНК в качестве основы для продукции определенных белков. Специфический генный фактор эритопогенеза в научном сообществе относительно не наблюдался, и никакие известные заболевания не были связаны с дефектом гена HOX B6. Однако это было показано в корреляции с серьезными деформациями скелета.^[9]

HOXB6 - это структурный белок, который, как было показано, влияет на рост и дифференциацию различных линий крови. Было также показано, что этот ген стимулирует рост гранулоцитов и моноцитов, но за счет других клеток крови. НОХВ6 обладает способностью вызывать неограниченную пролиферацию клеток костного мозга мышей, а также увеличивать кроветворные стволовые клетки. При аномальной экспрессии HOXB6 проявляет многие характеристики мощного онкопротеина. Онкопротеин может вызвать превращение нормальной клетки в опухолевую. Сверхэкспрессия HOXB6, наряду с добавлением белка MEIS1, вовлечена в развитие острого миелоидного лейкоза (AML). Острый миелоидный лейкоз - это рак клеток крови, в частности лейкоцитов. Хромосомная аномалия, наиболее часто наблюдаемая при HOXB6 AML, - это вновь появляющаяся интерстициальная делеция хромосомы 2. Фундаментальная экспрессия HOXB6 останавливает миелоидную дифференцировку и ослабляет эритропоэз, мегакариопоэз и лимфопоэз.^[10]

Смотрите также

Homeobox

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108511 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000690 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.
^ Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^а ^б "Entrez Gene: HOXB6 homeobox B6".
^ Циммерманн Ф., Рич И.Н. (апрель 1997 г.). «Экспрессия гомеобокса B6 млекопитающих может быть коррелирована с сайтами продукции эритропоэтина и эритропоэзом во время развития, но не с популяциями гемопоэтических или негематопоэтических стволовых клеток». Кровь. 89 (8): 2723–35. Дои:10.1182 / кровь.V89.8.2723. PMID 9108390.
^ Ранкур Д.Е., Цузуки Т., Капеччи М.Р. (январь 1995 г.). «Генетическое взаимодействие между hoxb-5 и hoxb-6 выявлено неаллельным отсутствием дополнений». Гены и развитие. 9 (1): 108–22. Дои:10.1101 / gad.9.1.108. PMID 7828847.
^ Фишбах Н.А., Розенфельд С., Шен В., Фонг С., Чробак Д., Гинзингер Д., Коган С. К., Радхакришнан А., Ле Бо М. М., Ларгман С., Лоуренс Г. Дж. (2005). «Сверхэкспрессия НОХВ6 в костном мозге мышей иммортализует предшественник миеломоноцитов in vitro и вызывает расширение гемопоэтических стволовых клеток и острый миелоидный лейкоз in vivo». Кровь. 105 (4): 1456–66. Дои:10.1182 / кровь-2004-04-1583. PMID 15522959.

дальнейшее чтение

Каур С., Сингх Дж., Сток Дж. Л., Шрейнер С. М., Киер А. Б., Ягер К. Л., Муценски М. Л., Скотт В. Дж., Поттер С. С. (декабрь 1992 г.). «Доминирующая мутация мышиного гена Hox-2.2 приводит к аномалиям развития». Журнал экспериментальной зоологии. 264 (3): 323–36. Дои:10.1002 / jez.1402640311. PMID 1358998.
Шен В.Ф., Детмер К., Саймонитч-Исон Т.А., Лоуренс Х.Дж., Ларгман К. (февраль 1991 г.). «Альтернативный сплайсинг гомеобокса гена HOX 2.2 в человеческих гемопоэтических клетках и тканях эмбрионов и взрослых мышей». Исследования нуклеиновых кислот. 19 (3): 539–45. Дои:10.1093 / nar / 19.3.539. ЧВК 333645. PMID 1672751.
Певерали Ф.А., Д'Эспозито М., Акампора Д., Буноне Дж., Негри М., Файелла А., Сторнаиуоло А., Паннесе М., Мильяччио Е., Симеоне А. (октябрь 1990 г.). «Экспрессия гомеогенов HOX в линиях культур клеток нейробластомы человека». Дифференциация; Исследования в области биологического разнообразия. 45 (1): 61–9. Дои:10.1111 / j.1432-0436.1990.tb00458.x. PMID 1981366.
Джампаоло А., Акампора Д., Заппавинья В., Паннесе М., Д'Эспозито М., Каре А., Файелла А., Сторнаиуоло А., Руссо Г., Симеоне А. (июнь 1989 г.). «Дифференциальная экспрессия генов HOX-2 человека вдоль передне-задней оси в центральной нервной системе эмбриона». Дифференциация; Исследования в области биологического разнообразия. 40 (3): 191–7. Дои:10.1111 / j.1432-0436.1989.tb00598.x. PMID 2570724.
Шен В.Ф., Ларгман К., Лоуни П., Коррал Дж. К., Детмер К., Хаузер, Калифорния, Симонич Т. А., Хак FM, Лоуренс Г. Дж. (Ноябрь 1989 г.). «Ограниченная по клонам экспрессия гомеобокс-содержащих генов в линиях гемопоэтических клеток человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (21): 8536–40. Bibcode:1989PNAS ... 86.8536S. Дои:10.1073 / pnas.86.21.8536. ЧВК 298317. PMID 2573064.
Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (декабрь 1989 г.). «Семейство генов HOX человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (24): 10385–402. Дои:10.1093 / nar / 17.24.10385. ЧВК 335308. PMID 2574852.
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Г., Сторнаиуоло А., Кафьеро М., Файелла А., Симеоне А. (1990). «Организация генов гомеобокса класса I человека». Геном. 31 (2): 745–56. Дои:10.1139 / g89-133. PMID 2576652.
Мерфи П.Д., Фергюсон-Смит А.С., Мики Т., Фейнберг А.А., Раддл Ф.Х., Кидд К.К. (август 1987 г.). «Умеренно частый RFLP, идентифицированный как SacI, так и BanII с зондом из локуса HOX2 у человека (17q11-17q22)». Исследования нуклеиновых кислот. 15 (15): 6311. Дои:10.1093 / nar / 15.15.6311. ЧВК 306101. PMID 2888083.
Левин М., Рубин Г.М., Тьянь Р. (октябрь 1984 г.). «Последовательности ДНК человека, гомологичные белковой кодирующей области, консервативной между гомеотическими генами дрозофилы». Ячейка. 38 (3): 667–73. Дои:10.1016/0092-8674(84)90261-7. PMID 6091895. S2CID 28848659.
Чанг С. П., Шен В. Ф., Розенфельд С., Лоуренс Х. Дж., Ларгман С., Клири М. Л. (март 1995 г.). «Белки Pbx демонстрируют гексапептид-зависимое кооперативное связывание ДНК с подмножеством белков Hox». Гены и развитие. 9 (6): 663–74. Дои:10.1101 / gad.9.6.663. PMID 7729685.
Castronovo V, Kusaka M, Chariot A, Gielen J, Sobel M (январь 1994 г.). «Гены гомеобокса: потенциальные кандидаты на транскрипционный контроль трансформированного и инвазивного фенотипа». Биохимическая фармакология. 47 (1): 137–43. Дои:10.1016/0006-2952(94)90447-2. PMID 7906121.
Апиу Ф, Флагиелло Д., Силло С., Малфой Б., Поупон М. Ф., Датрилло Б. (1996). «Тонкое картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 73 (1–2): 114–5. Дои:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Соцер С., Джонс Х. Б., Фикс Р., Грей Дж., Смолдон Н., Чатавей Дж., Робертсон Н., Клейтон Д., Гудфеллоу П. Н., Компстон А. (август 1996 г.). «Скрининг генома при рассеянном склерозе выявляет локусы восприимчивости на хромосомах 6p21 и 17q22». Природа Генетика. 13 (4): 464–8. Дои:10.1038 / ng0896-464. PMID 8696343. S2CID 20543659.
Циммерманн Ф., Рич И.Н. (апрель 1997 г.). «Экспрессия гомеобокса B6 млекопитающих может быть коррелирована с сайтами продукции эритропоэтина и эритропоэзом во время развития, но не с популяциями гемопоэтических или негематопоэтических стволовых клеток». Кровь. 89 (8): 2723–35. Дои:10.1182 / кровь.V89.8.2723. PMID 9108390.
Видер Б.З., Цимбер А., Хирш Д., Эстлейн Д., Частре Э, Превот С., Геспах С., Янив А., Газит А. (март 1997 г.). «Колоректальный канцерогенез человека связан с нарушением регуляции экспрессии гена гомеобокса». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 232 (3): 742–8. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6364. PMID 9126347.
Охниши К., Тобита Т., Синджо К., Такешита А., Оно Р. (ноябрь 1998 г.). «Модуляция экспрессии генов гомеобокса B6 и B9 в клеточных линиях лейкемии человека во время миеломоноцитарной дифференцировки». Лейкемия и лимфома. 31 (5–6): 599–608. Дои:10.3109/10428199809057620. PMID 9922051.
Файнберг А.А., Нордштедт С., Белтинг Х.Г., Черник А.Дж., Нэрн А.С., Ганди С., Грингард П., Раддл Ф.Х. (апрель 1999 г.). «Филогенетически консервативный сайт фосфорилирования CK-II гомеодоменного белка Hoxb-6 мыши». Журнал экспериментальной зоологии. 285 (1): 76–84. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-010X (19990415) 285: 1 <76 :: AID-JEZ9> 3.0.CO; 2-K. PMID 10327653.
Видер Б.З., Зимбер А., Частре Е., Геспах С., Гальперин М., Машиа П., Янив А., Газит А. (июнь 2000 г.). «Дерегулированная экспрессия гомеобокс-содержащих генов HOXB6, B8, C8, C9 и Cdx-1 в клеточных линиях рака толстой кишки человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 272 (2): 513–8. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2804. PMID 10833444.

внешние ссылки

HOXB6 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q24645 (Drosophila subobscura, гомеотическая белковая антеннапедия) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108511 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000690 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: HOXB6 homeobox B6".

[8] Циммерманн Ф., Рич И.Н. (апрель 1997 г.). «Экспрессия гомеобокса B6 млекопитающих может быть коррелирована с сайтами продукции эритропоэтина и эритропоэзом во время развития, но не с популяциями гемопоэтических или негематопоэтических стволовых клеток». Кровь. 89 (8): 2723–35. Дои:10.1182 / кровь.V89.8.2723. PMID 9108390.

[9] Ранкур Д.Е., Цузуки Т., Капеччи М.Р. (январь 1995 г.). «Генетическое взаимодействие между hoxb-5 и hoxb-6 выявлено неаллельным отсутствием дополнений». Гены и развитие. 9 (1): 108–22. Дои:10.1101 / gad.9.1.108. PMID 7828847.

[pmid15522959-10] Фишбах Н.А., Розенфельд С., Шен В., Фонг С., Чробак Д., Гинзингер Д., Коган С. К., Радхакришнан А., Ле Бо М. М., Ларгман С., Лоуренс Г. Дж. (2005). «Сверхэкспрессия НОХВ6 в костном мозге мышей иммортализует предшественник миеломоноцитов in vitro и вызывает расширение гемопоэтических стволовых клеток и острый миелоидный лейкоз in vivo». Кровь. 105 (4): 1456–66. Дои:10.1182 / кровь-2004-04-1583. PMID 15522959.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]