NFE2L3 - NFE2L3

NFE2L3
Идентификаторы
ПсевдонимыNFE2L3, NRF3, ядерный фактор, эритроид 2 как 3
Внешние идентификаторыOMIM: 604135 MGI: 1339958 ГомолоГен: 3168 Генные карты: NFE2L3
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение NFE2L3
Геномное расположение NFE2L3
Группа7п15.2Начинать26,152,198 бп[1]
Конец26,187,137 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9603

18025

Ансамбль

ENSG00000050344

ENSMUSG00000029832

UniProt

Q9Y4A8

Q9WTM4

RefSeq (мРНК)

NM_004289

NM_010903

RefSeq (белок)

NP_004280

NP_035033

Расположение (UCSC)Chr 7: 26.15 - 26.19 МбChr 6: 51.43 - 51.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор (эритроид 2) -подобный фактор 3, также известный как NFE2L3 или же 'NRF3 ', это фактор транскрипции что у людей кодируется Кfe2l3 ген.[5][6]

Nrf3 - базовый лейциновая молния (bZIP ) фактор транскрипции принадлежат к семейству белков Cap ‘n’ Collar (CNC).[7] В 1989 году первый ЧПУ фактор транскрипции NFE2L2 был идентифицирован. Впоследствии несколько связанных белки были выявлены, в том числе NFE2L1 и NFE2L3 у разных организмов, таких как человек, мышей, и данио.[8] Эти белки специфически кодируются у человека Кfe2l1 и Кfe2l3 гены соответственно.[9][10]

Ген

В Кfe2l3 ген был сопоставлен с хромосомной локацией 7п15-п14 к флуоресценция in situ гибридизация (РЫБЫ).[9] Он занимает 34,93 КБ от основания 26191830 до 26226754 на прямой цепи ДНК с числом экзонов 4. Ген находится рядом с HOXA генный кластер, аналогичный кластеризации p45 NF-E2, NFE2L1, и NFE2L2 рядом с генами HOXC, HOXB и HOXD соответственно.[7][9] Это означает, что все четыре гена, вероятно, произошли от одного предкового гена, который дублировался вместе с предковым кластером HOX, расходясь, давая начало четырем близкородственным факторам транскрипции.[9]

Человек Кfe2l3 ген кодирует 694 аминокислота последовательность остатков.[7][9] Из биоинформатический анализа, было замечено, что белок NRF3 показывает высокую степень консервативности благодаря его эволюционный путь от рыбок данио к человеку. Ключ сохраненные домены Такие как N-концевой бокс гомологии 1 (NHB1), N-концевой блок гомологии 2 (NHB2) и домен CNC указывают на консервативные функциональные свойства этого фактора транскрипции.[11]

Субсотовое расположение

NRF3 - это мембрана граница гликопротеин которые могут быть специально нацелены на эндоплазматический ретикулум (ER) и ядерная мембрана.[9] Биохимический исследования выявили три миграция эндогенный формы белка NRF3 - A, B и C - которые конститутивно разлагаются несколькими протеолитический механизмы.[9][12] Известно, что форма «А» - это гликозилированный, тогда как "B" негликозилирован, а "C" образуется при расщеплении "B".[7][9] Всего семь потенциальных сайтов N-связанного гликозилирования. [7] наблюдается в центральной части белка NRF3. Однако дальнейшие детали расположения, регуляции и функции трех форм в каждом клеточном компартменте остаются неизвестными.

Уровни экспрессии белков

Выражение уровни белков NRF3 самые высокие в плацента.[13] более конкретно в ворсинки хориона (на 12 неделе беременность период) [14] Экспрессия, по-видимому, специфична для первичного плацентарного цитотрофобласты, а не плацентарный фибробласты. Наряду с плацентой экспрессия этого белка наблюдалась также у человека. хориокарцинома клеточные линии, полученные из трофобластический опухоли плаценты. NFE2L2 также был обнаружен в сердце, мозг, легкие, почка, поджелудочная железа, двоеточие, вилочковая железа, лейкоциты, и селезенка.[15] Очень низкие уровни экспрессии были обнаружены у человека. мегакариоциты и эритроциты, а экспрессия NRF3 не наблюдалась в репродуктивный органы любого пола.[9][16]

Функция

Конкретные функции белка NRF3 все еще неизвестны, но некоторые предполагаемые функциональные свойства были выведены из свойств NFE2L1 из-за их структурного сходства. Известно, что NRF3 может гетеродимеризовать с небольшой мышечно-апоневротической фибросаркомой (Гены MAF ) факторы для связывания антиоксидант элементы ответа в генах-мишенях.[17]

Сопутствующие заболевания

РНК микрочип данные показали участие NRF3 в различных злокачественные новообразования, с чрезмерной экспрессией, наблюдаемой в Лимфома Ходжкина, неходжкинская лимфома, и лимфома из клеток мантии.[18] Экспрессия NRF3 также повышена у человека. рак молочной железы клетки и рак яичка, подразумевая, что NRF3 может играть роль в индукции канцерогенез.[19]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000050344 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029832 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Энтреса: ядерный фактор (эритроидный 2) -подобный 3».
  6. ^ Кобаяси А., Ито Э, Токи Т., Когаме К., Такахаши С., Игараси К., Хаяси Н., Ямамото М. (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика нового транскрипционного фактора семейства Cap'n 'collar Nrf3». Журнал биологической химии. 274 (10): 6443–52. Дои:10.1074 / jbc.274.10.6443. PMID  10037736.
  7. ^ а б c d е Landschulz WH, Johnson PF, McKnight SL (июнь 1988 г.). «Лейциновая молния: гипотетическая структура, общая для нового класса ДНК-связывающих белков». Наука. 240 (4860): 1759–64. Дои:10.1126 / science.3289117. JSTOR  1701639. PMID  3289117.
  8. ^ Derjuga A, Gourley TS, Holm TM, Heng HH, Shivdasani RA, Ahmed R, Andrews NC, Blank V (апрель 2004 г.). «Сложность факторов транскрипции CNC, выявленная при нацеливании на локус Nrf3». Молекулярная и клеточная биология. 24 (8): 3286–94. Дои:10.1128 / mcb.24.8.3286-3294.2004. ЧВК  381672. PMID  15060151.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я Chevillard G, Blank V (октябрь 2011 г.). «NFE2L3 (NRF3): Золушка факторов транскрипции Cap'n'Collar». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 68 (20): 3337–48. Дои:10.1007 / s00018-011-0747-х. PMID  21687990. S2CID  25006101.
  10. ^ Катерина Дж.Дж., Донце Д., Сан CW, Ciavatta DJ, Townes TM (июнь 1994). «Клонирование и функциональная характеристика LCR-F1: фактора транскрипции bZIP, который активирует эритроид-специфическую экспрессию гена глобина человека». Исследования нуклеиновых кислот. 22 (12): 2383–91. Дои:10.1093 / nar / 22.12.2383. ЧВК  523699. PMID  8036168.
  11. ^ Сяо Кью, Пепе А.Э., Ван Г, Ло З., Чжан Л., Цзэн Л., Чжан З., Ху И, Йе С, Сюй Кью (март 2012 г.). «Взаимодействие Nrf3-Pla2g7 играет важную роль в дифференцировке гладких мышц из стволовых клеток». Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов. 32 (3): 730–44. Дои:10.1161 / ATVBAHA.111.243188. PMID  22247257.
  12. ^ Чоудхури АММА, Като Х, Хатанака А., Иванари Х, Накамура Н., Хамакубо Т., Нацумэ Т., Ваку Т., Кобаяши А. (2017). «Множественные регуляторные механизмы биологической функции NRF3 (NFE2L3) контролируют пролиферацию раковых клеток». Научный представитель. 7 (1): 12494. Дои:10.1038 / с41598-017-12675-у. ЧВК  5624902. PMID  28970512.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  13. ^ Чене Б., Держуга А., Массри В., Ред-Хорс К., Беллингард В., Фишер С. Дж., Бланк В. (январь 2005 г.). «Анализ функциональной и плацентарной экспрессии человеческого фактора транскрипции NRF3». Молекулярная эндокринология. 19 (1): 125–37. Дои:10.1210 / me.2003-0379. PMID  15388789.
  14. ^ Chevillard G, Paquet M, Blank V (февраль 2011 г.). «Дефицит Nfe2l3 (Nrf3) предрасполагает мышей к Т-клеточной лимфобластной лимфоме». Кровь. 117 (6): 2005–8. Дои:10.1182 / кровь-2010-02-271460. PMID  21148084.
  15. ^ Мартин-Монтальво, А .; Villalba, J.M .; Navas, P .; де Кабо, Р. (3 февраля 2011 г.). «NRF2, рак и ограничение калорий» (PDF). Онкоген. 30 (5): 505–520. Дои:10.1038 / onc.2010.492. ISSN  1476-5594. ЧВК  4684645. PMID  21057541.
  16. ^ Венугопал Р., Джайсвал А.К. (декабрь 1998 г.). «Nrf2 и Nrf1 в сочетании с белками Jun регулируют экспрессию, опосредованную элементами антиоксидантного ответа, и скоординированную индукцию генов, кодирующих детоксифицирующие ферменты». Онкоген. 17 (24): 3145–56. Дои:10.1038 / sj.onc.1202237. PMID  9872330.
  17. ^ Бланк V, Эндрюс, Северная Каролина (ноябрь 1997 г.). «Факторы транскрипции Maf: регуляторы дифференцировки». Тенденции в биохимических науках. 22 (11): 437–41. Дои:10.1016 / s0968-0004 (97) 01105-5. PMID  9397686.
  18. ^ Вилленброк К., Кюпперс Р., Ренне С., Брюн В., Экерле С., Вайдманн Э., Бройнингер А., Хансманн М.Л. (май 2006 г.). «Общие черты и различия в транскриптоме крупноклеточной анапластической лимфомы и классической лимфомы Ходжкина». Haematologica. 91 (5): 596–604. PMID  16670065.
  19. ^ Hayes JD, McMahon M (декабрь 2001 г.). «Молекулярная основа вклада антиоксидантного чувствительного элемента в химиопрофилактику рака». Письма о раке. 174 (2): 103–13. Дои:10.1016 / s0304-3835 (01) 00695-4. PMID  11689285.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.