Рецептор ретиноевой кислоты альфа - Retinoic acid receptor alpha

RARA
Белок RARA PDB 1dkf.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыRARA, NR1B1, RAR, рецептор ретиноевой кислоты альфа
Внешние идентификаторыOMIM: 180240 MGI: 97856 ГомолоГен: 20262 Генные карты: RARA
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение RARA
Геномное расположение RARA
Группа17q21.2Начинать40,309,180 бп[1]
Конец40,357,643 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE RARA 203750 s в формате fs.png

PBB GE RARA 211605 s в формате fs.png

PBB GE RARA 203749 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_000964
NM_001024809
NM_001033603
NM_001145301
NM_001145302

NM_001176528
NM_001177302
NM_001177303
NM_009024
NM_001361954

RefSeq (белок)

NP_001169999
NP_001170773
NP_001170774
NP_033050
NP_001348883

Расположение (UCSC)Chr 17: 40.31 - 40.36 МбChr 11: 98.93 - 98.97 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Рецептор ретиноевой кислоты альфа (RAR-α), также известный как NR1B1 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа B, член 1) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется RARA ген.[5][6]

Функция

Ретиноид Передача сигналов передается двумя семействами ядерных рецепторов, рецептором ретиноевой кислоты (RAR ) и ретиноидный рецептор X (RXR ), которые образуют гетеродимеры RXR / RAR. В отсутствие лиганда связанный с ДНК RXR / RARA репрессирует транскрипцию путем привлечения корепрессоров. NCOR1, SMRT (NCOR2 ), и гистоновая деацетилаза. Когда лиганд связывается с комплексом, он вызывает конформационные изменения, позволяющие привлекать коактиваторы, гистоновые ацетилтрансферазы и основной аппарат транскрипции.[7]

Клиническое значение

Транслокации, которые всегда связаны с перестройкой гена RARA, являются кардинальным признаком острого промиелоцитарного лейкоза (APL; MIM 612376). Наиболее частой транслокацией является t (15,17) (q21; q22), которая сливает ген RARA с PML ген.[8]

Взаимодействия

Альфа-рецептор ретиноевой кислоты взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131759 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037992 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Жигер В., Онг Э.С., Сегуи П., Эванс Р.М. (1987). «Идентификация рецептора морфогена ретиноевой кислоты». Природа. 330 (6149): 624–9. Bibcode:1987Натура. 330..624Г. Дои:10.1038 / 330624a0. PMID  2825036. S2CID  4308015.
  6. ^ Андерсон Л.А., Фридман Л., Осборн-Лоуренс С., Линч Е., Вайссенбах Дж., Боукок А., Кинг М.С. (сентябрь 1993 г.). «Генетическая карта высокой плотности BRCA1 области хромосомы 17q12-q21». Геномика. 17 (3): 618–23. Дои:10.1006 / geno.1993.1381. PMID  8244378.
  7. ^ «Энтрез Ген: рецептор ретиноевой кислоты».
  8. ^ Vitoux D, Nasr R, de The H (2007). «Острый промиелоцитарный лейкоз: новые вопросы патогенеза и ответа на лечение». Int. J. Biochem. Cell Biol. 39 (6): 1063–70. Дои:10.1016 / j.biocel.2007.01.028. PMID  17468032.
  9. ^ Лю Р., Такаяма С., Чжэн И, Фроеш Б., Чен Г.К., Чжан Х, Рид Дж. К., Чжан ХК (июль 1998 г.). «Взаимодействие BAG-1 с рецептором ретиноевой кислоты и его ингибирование апоптоза, вызванного ретиноевой кислотой, в раковых клетках». J. Biol. Chem. 273 (27): 16985–92. Дои:10.1074 / jbc.273.27.16985. PMID  9642262.
  10. ^ а б Макнамара П., Сео С.Б., Рудик Р.Д., Сегал А., Чакраварти Д., Фитцджеральд Г.А. (июнь 2001 г.). «Регулирование ЧАСОВ и MOP4 рецепторами ядерных гормонов в сосудистой сети: гуморальный механизм для сброса периферических часов». Клетка. 105 (7): 877–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00401-9. PMID  11439184. S2CID  6251321.
  11. ^ Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (февраль 2003 г.). «Циклин D3 является кофактором рецепторов ретиноевой кислоты, модулируя их активность в присутствии клеточного белка II, связывающего ретиноевую кислоту». J. Biol. Chem. 278 (8): 6355–62. Дои:10.1074 / jbc.M210697200. PMID  12482873.
  12. ^ Ли С.К., Юнг С.И., Ким Ю.С., На СЫ, Ли Ю.С., Ли Дж.В. (февраль 2001 г.). «Два различных домена взаимодействия ядерных рецепторов и CREB-связывающий белок-зависимая трансактивационная функция активирующего сигнального коинтегратора-2». Мол. Эндокринол. 15 (2): 241–54. Дои:10.1210 / me.15.2.241. PMID  11158331.
  13. ^ Ли С.К., Анзик С.Л., Чой Дж.Э., Бубендорф Л., Гуан XY, Юнг Ю.К., Каллиониеми О.П., Кононен Дж., Трент Дж. М., Азорса Д., Джун Б. Х., Чеонг Дж. Х., Ли Ю. К., Мельцер П. С., Ли Дж. В. (ноябрь 1999 г.). «Ядерный фактор, ASC-2, как усиленный раком транскрипционный коактиватор, необходимый для лиганд-зависимой трансактивации ядерными рецепторами in vivo». J. Biol. Chem. 274 (48): 34283–93. Дои:10.1074 / jbc.274.48.34283. PMID  10567404.
  14. ^ Ко Л., Кардона Г. Р., Чин В. В. (май 2000 г.). «Белок, связывающий рецептор тироидного гормона, белок, содержащий мотив LXXLL, функционирует как общий коактиватор». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (11): 6212–7. Bibcode:2000PNAS ... 97.6212K. Дои:10.1073 / пнас.97.11.6212. ЧВК  18584. PMID  10823961.
  15. ^ Доуэлл П., Измаил Дж. Э., Аврам Д., Петерсон В. Дж., Невривы Д. Д., Лейд М. (май 1999 г.). «Идентификация корепрессора ядерного рецептора как белка, взаимодействующего с альфа-рецептором, активируемого пролифератором пероксисом». J. Biol. Chem. 274 (22): 15901–7. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID  10336495.
  16. ^ Guidez F, Ivins S, Zhu J, Söderström M, Waxman S, Zelent A (апрель 1998 г.). «Пониженная чувствительность к ретиноевой кислоте при связывании корепрессора ядерного рецептора с PML- и PLZF-RARalpha лежит в основе молекулярного патогенеза и лечения острого промиелоцитарного лейкоза». Кровь. 91 (8): 2634–42. Дои:10.1182 / blood.V91.8.2634.2634_2634_2642. PMID  9531570.
  17. ^ Донг С., Tweardy DJ (апрель 2002 г.). «Взаимодействие STAT5b-RARalpha, нового слитого белка для острого промиелоцитарного лейкоза, с рецептором ретиноевой кислоты и сигнальными путями STAT3». Кровь. 99 (8): 2637–46. Дои:10.1182 / blood.V99.8.2637. PMID  11929748.
  18. ^ Хонг С.Х., Дэвид Дж., Вонг К.В., Дежан А., Привальский М.Л. (август 1997 г.). «Корепрессор SMRT взаимодействует с PLZF и с онкобелками рецептора PML-ретиноевой кислоты альфа (RARalpha) и PLZF-RARalpha, связанными с острым промиелоцитарным лейкозом». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (17): 9028–33. Bibcode:1997PNAS ... 94.9028H. Дои:10.1073 / пнас.94.17.9028. ЧВК  23013. PMID  9256429.
  19. ^ Ху Х, Чен И, Фаруки М., Томас М.К., Чан СМ, Вэй Л.Н. (январь 2004 г.). «Подавляющий эффект взаимодействующего с рецептором белка 140 на связывание корегулятора с рецепторными комплексами ретиноевой кислоты, активность гистон-модифицирующего фермента и активацию гена». J. Biol. Chem. 279 (1): 319–25. Дои:10.1074 / jbc.M307621200. PMID  14581481.
  20. ^ Фаруки М., Франко П.Дж., Томпсон Дж., Кагечика Х., Чандраратна Р.А., Банашак Л., Вей Л.Н. (февраль 2003 г.). «Влияние ретиноидных лигандов на RIP140: молекулярное взаимодействие с ретиноидными рецепторами и биологическая активность». Биохимия. 42 (4): 971–9. Дои:10.1021 / bi020497k. PMID  12549917.
  21. ^ L'Horset F, Dauvois S, Heery DM, Cavaillès V, Parker MG (ноябрь 1996 г.). «RIP-140 взаимодействует с множеством ядерных рецепторов посредством двух различных сайтов». Мол. Клетка. Биол. 16 (11): 6029–36. Дои:10.1128 / MCB.16.11.6029. ЧВК  231605. PMID  8887632.
  22. ^ Соль В., Чой Х.С., Мур Д.Д. (май 1996 г.). «Рецептор орфанного ядерного гормона, у которого отсутствует ДНК-связывающий домен и который гетеродимеризуется с другими рецепторами». Наука. 272 (5266): 1336–9. Bibcode:1996Научный ... 272.1336С. Дои:10.1126 / science.272.5266.1336. PMID  8650544. S2CID  32853062.
  23. ^ Соль В., Ханштейн Б., Браун М., Мур Д.Д. (октябрь 1998 г.). «Ингибирование действия рецептора эстрогена сиротским рецептором SHP (короткий гетеродимерный партнер)». Мол. Эндокринол. 12 (10): 1551–7. Дои:10.1210 / мэ.12.10.1551. PMID  9773978.
  24. ^ Перлманн Т., Янссон Л. (апрель 1995 г.). «Новый путь передачи сигналов витамина А, опосредованный гетеродимеризацией RXR с NGFI-B и NURR1». Genes Dev. 9 (7): 769–82. Дои:10.1101 / gad.9.7.769. PMID  7705655.
  25. ^ Чжун С., Дельва Л., Рашез К., Ченчарелли С., Гандини Д., Чжан Х., Калантри С., Фридман Л. П., Пандольфи П. П. (ноябрь 1999 г.). «RA-зависимый комплекс транскрипции, подавляющий рост опухоли, является мишенью для онкопротеинов PML-RARalpha и T18». Nat. Genet. 23 (3): 287–95. Дои:10.1038/15463. PMID  10610177. S2CID  23613492.
  26. ^ Бенкусса М., Бренд С, Дельмотт М.Х., Formstecher P, Лефевр П. (июль 2002 г.). «Рецепторы ретиноевой кислоты ингибируют активацию AP1, регулируя киназу, регулируемую внеклеточными сигналами, и рекрутирование CBP на AP1-чувствительный промотор». Мол. Клетка. Биол. 22 (13): 4522–34. Дои:10.1128 / MCB.22.13.4522-4534.2002. ЧВК  133906. PMID  12052862.
  27. ^ Багге Т.Х., Поль Дж., Лонной О., Стунненберг Г.Г. (апрель 1992 г.). «RXR альфа, беспорядочный партнер рецепторов ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы». EMBO J. 11 (4): 1409–18. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05186.x. ЧВК  556590. PMID  1314167.
  28. ^ Ким Х.Дж., Йи Джи, Сон Х.С., Мур Д.Д., Чжун Б.Х., Ли Ю.К., Ли Дж.В. (сентябрь 1999 г.). «Активирующий сигнальный коинтегратор 1, новый коактиватор транскрипции ядерных рецепторов, и его цитозольная локализация в условиях сывороточной депривации». Мол. Клетка. Биол. 19 (9): 6323–32. Дои:10.1128 / mcb.19.9.6323. ЧВК  84603. PMID  10454579.
  29. ^ Он Б., Уилсон Э.М. (март 2003 г.). «Электростатическая модуляция в рекрутинге стероидных рецепторов мотивов LXXLL и FXXLF». Мол. Клетка. Биол. 23 (6): 2135–50. Дои:10.1128 / MCB.23.6.2135-2150.2003. ЧВК  149467. PMID  12612084.
  30. ^ Цзэн М., Кумар А., Мэн Г., Гао Кью, Димри Г., Вазер Д., Группа Н, Группа V (ноябрь 2002 г.). «Онкопротеин E6 вируса папилломы человека 16 ингибирует трансактивацию, опосредованную ретиноидным X-рецептором, воздействуя на коактиватор ADA3 человека». J. Biol. Chem. 277 (47): 45611–8. Дои:10.1074 / jbc.M208447200. PMID  12235159.
  31. ^ Мартин П.Дж., Дельмотт М.Х., Formstecher P, Лефевр П. (сентябрь 2003 г.). «PLZF - негативный регулятор транскрипционной активности рецепторов ретиноевой кислоты». Nucl. Прием. 1 (1): 6. Дои:10.1186/1478-1336-1-6. ЧВК  212040. PMID  14521715.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.