Фактор транскрипции Sp3 - Sp3 transcription factor

SP3
Белок SP3 PDB 1va1.png
Идентификаторы
ПсевдонимыSP3, SPR2, фактор транскрипции Sp3
Внешние идентификаторыOMIM: 601804 MGI: 1277166 ГомолоГен: 7952 Генные карты: SP3
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение SP3
Геномное расположение SP3
Группа2q31.1Начинать173,880,850 бп[1]
Конец173,965,702 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SP3 213168 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003111
NM_001017371
NM_001172712

NM_001018042
NM_001098425
NM_011450

RefSeq (белок)

NP_001017371
NP_001166183
NP_003102
NP_003102.1

NP_001018052
NP_001091895

Расположение (UCSC)Chr 2: 173,88 - 173,97 МбChr 2: 72.94 - 72.98 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции Sp3, также известный как SP3, относится как к белок и ген он закодирован.

Этот ген принадлежит к семейству генов, связанных с Sp1, которые кодируют факторы транскрипции, которые регулируют транскрипцию путем связывания с консенсусными регуляторными элементами GC- и GT-box в генах-мишенях. Этот белок содержит цинковый палец ДНК -связывающий домен и несколько доменов трансактивации, которые, как сообщается, функционируют как бифункциональный фактор транскрипции который либо стимулирует, либо подавляет транскрипцию множества генов. Варианты транскрипции, кодирующие разные изоформы были описаны для этого гена, и сообщалось, что один из них инициирует трансляцию из не-AUG (AUA) стартовый кодон. Также были отмечены дополнительные изоформы, возникающие в результате использования альтернативных нижестоящих сайтов инициации трансляции.[5]

Взаимодействия

Фактор транскрипции Sp3 может взаимодействовать с Гистоновая деацетилаза 2,[6][7] PIAS1,[8] E2F1[9] и ГАБПА.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172845 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027109 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: фактор транскрипции SP3 Sp3».
  6. ^ Вон, Чжеджун; Им Чжонбин; Ким Тэ Кук (октябрь 2002 г.). «Sp1 и Sp3 привлекают гистондеацетилазу для подавления транскрипции промотора обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT) в нормальных соматических клетках человека». J. Biol. Chem. 277 (41): 38230–8. Дои:10.1074 / jbc.M206064200. ISSN  0021-9258. PMID  12151407.
  7. ^ Сунь, Цзянь-Минь; Чен Хоу Ю; Монива Марико; Литчфилд Дэвид В; Сето Эдвард; Дэви Джеймс Р. (сентябрь 2002 г.). «Репрессор транскрипции Sp3 связан с CK2-фосфорилированной гистондеацетилазой 2». J. Biol. Chem. 277 (39): 35783–6. Дои:10.1074 / jbc.C200378200. ISSN  0021-9258. PMID  12176973.
  8. ^ Сапечниг, Александра; Ришитор Григоре; Браун Харальд; Кукла Андреас; Шергаут Марион; Мельхиор Фрауке; Суске Гунтрам (октябрь 2002 г.). «Фактор транскрипции Sp3 подавляется посредством модификации SUMO с помощью PIAS1». EMBO J. 21 (19): 5206–15. Дои:10.1093 / emboj / cdf510. ISSN  0261-4189. ЧВК  129032. PMID  12356736.
  9. ^ Rotheneder, H; Геймайер С; Haidweger E (ноябрь 1999 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол. 293 (5): 1005–15. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3213. ISSN  0022-2836. PMID  10547281.
  10. ^ Galvagni, F; Capo S; Oliviero S (март 2001 г.). «Sp1 и Sp3 физически взаимодействуют и взаимодействуют с GABP для активации промотора атрофина» (PDF). J. Mol. Биол. 306 (5): 985–96. Дои:10.1006 / jmbi.2000.4335. HDL:2318/141203. ISSN  0022-2836. PMID  11237613.

дальнейшее чтение