USF2 - USF2

USF2
Идентификаторы
Псевдонимы	USF2, FIP, bHLHb12, вышестоящий фактор транскрипции 2, взаимодействие c-fos
Внешние идентификаторы	OMIM: 600390 MGI: 99961 ГомолоГен: 2527 Генные карты: USF2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 19 (человек)
Конец	35,279,821 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	30,956,803 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • активность димеризации белков; • активность гомодимеризации белков; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • связывание фактора транскрипции bHLH; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность гетеродимеризации белков; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II глюкозой; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • поздняя вирусная транскрипция; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II глюкозой; • липидный гомеостаз; • лактация; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7392
	22282
	ENSG00000105698
	ENSMUSG00000058239
	Q15853
	Q64705
	NM_003367; NM_207291; NM_001321150
	NM_011680
	NP_001308079; NP_003358; NP_997174
	NP_035810
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Стимулирующий фактор 2 выше по течению это белок что у людей кодируется USF2 ген.^[5]^[6]

Функция

Этот ген кодирует член основного семейства лейциновых застежек спираль-петля-спираль и может функционировать как фактор клеточной транскрипции. Кодируемый белок может активировать транскрипцию через элементы богатого пиридином инициатора (Inr) и мотивы E-бокса. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

USF2 был показан взаимодействовать с участием USF1 (человеческий ген),^[7]^[8] PPRC1^[9] и BRCA1.^[10]

Регулирование

В USF2 ген подавленный посредством микроРНК miR-10a.^[11]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105698 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058239 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Groenen PM, Garcia E, Debeer P, Devriendt K, Fryns JP, Van de Ven WJ (декабрь 1996 г.). «Структура, последовательность и локализация хромосомы 19 человеческого USF2 и его перестройка у пациента с поликистозной дисплазией почек». Геномика. 38 (2): 141–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0609. PMID 8954795.
^ ^а ^б «Ген Entrez: фактор транскрипции 2 USF2, взаимодействующий с c-fos».
^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
^ Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Генрион А., Кан А., Раймонджан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и трансакционные свойства изоформ вышестоящих стимулирующих факторов». Журнал биологической химии. 271 (3): 1405–15. Дои:10.1074 / jbc.271.3.1405. PMID 8576131.
^ Мур М.Л., Парк Е.А., Макмиллин Дж. Б. (май 2003 г.). «Верхний стимулирующий фактор подавляет индукцию экспрессии карнитин-пальмитоилтрансферазы-Ibeta PGC-1». Журнал биологической химии. 278 (19): 17263–8. Дои:10.1074 / jbc.M210486200. PMID 12611894.
^ Cable PL, Wilson CA, Calzone FJ, Rauscher FJ, Scully R, Livingston DM, Li L, Blackwell CB, Futreal PA, Afshari CA (октябрь 2003 г.). «Новая консенсусная ДНК-связывающая последовательность для белковых комплексов BRCA1». Молекулярный канцерогенез. 38 (2): 85–96. Дои:10.1002 / mc.10148. PMID 14502648. S2CID 24956554.
^ Агирре X, Хименес-Веласко A, Сан-Хосе-Энеррис E, Гарате L, Бандрес E, Cordeu L, Aparicio O, Saez B, Navarro G, Vilas-Zornoza A, Pérez-Roger I, García-Foncillas J, Torres A, Heiniger A, Calasanz MJ, Fortes P, Román-Gómez J, Prósper F (декабрь 2008 г.). «Подавление hsa-miR-10a в клетках CD34 + хронического миелоидного лейкоза увеличивает USF2-опосредованный рост клеток». Молекулярные исследования рака. 6 (12): 1830–40. Дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-08-0167. PMID 19074828.

дальнейшее чтение

Corre S, Galibert MD (январь 2006 г.). «[USF как ключевой регулятор экспрессии генов]» (PDF). Médecine / Науки. 22 (1): 62–7. Дои:10.1051 / medsci / 200622162. PMID 16386222.
Сирито М., Уокер С., Лин К., Козловски М.Т., Кляйн В.Х., Савадого М. (1993). «Члены семейства USF белков спираль-петля-спираль связывают ДНК как гомо-, так и гетеродимеры». Экспрессия гена. 2 (3): 231–40. ЧВК 6057381. PMID 1450663.
Blanar MA, Rutter WJ (май 1992 г.). «Клонирование взаимодействия: идентификация белка застежки-молнии спираль-петля-спираль, который взаимодействует с c-Fos». Наука. 256 (5059): 1014–8. Bibcode:1992Научный ... 256.1014B. Дои:10.1126 / science.1589769. PMID 1589769.
Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Генрион А., Кан А., Раймонджан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и трансакционные свойства изоформ вышестоящих стимулирующих факторов». Журнал биологической химии. 271 (3): 1405–15. Дои:10.1074 / jbc.271.3.1405. PMID 8576131.
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Гош А.К., Датта П.К., Джейкоб С.Т. (февраль 1997 г.). "Двойная роль белка USF спираль-петля - спираль-застежка-молния в транскрипции гена рибосомной РНК in vivo". Онкоген. 14 (5): 589–94. Дои:10.1038 / sj.onc.1200866. PMID 9053857.
Куршнер С., Морган Д.И. (февраль 1997 г.). «USF2 / FIP связывается с фактором транскрипции b-Zip, c-Maf, через его домен bHLH и ингибирует активность связывания ДНК c-Maf». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 231 (2): 333–9. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6097. PMID 9070273.
Breen GA, Jordan EM (апрель 1997 г.). «Регулирование ядерного гена, который кодирует альфа-субъединицу комплекса митохондриальной F0F1-АТФ-синтазы. Активация вышестоящим стимулирующим фактором 2». Журнал биологической химии. 272 (16): 10538–42. Дои:10.1074 / jbc.272.16.10538. PMID 9099698.
Нечуштан Х., Чжан З., Разин Э. (апрель 1997 г.). «Микрофтальмия (ми) в тучных клетках мышей: регуляция его экспрессии, опосредованной стимулами, на уровне трансляции». Кровь. 89 (8): 2999–3008. Дои:10.1182 / blood.V89.8.2999. PMID 9108421.
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК 139146. PMID 9110174.
Брин Г.А., Джордан Э.М. (август 1999 г.). «Активация транскрипции элемента инициатора альфа-субъединицы F (1) F (0) АТФ-синтазы с помощью USF2 опосредуется p300». Biochimica et Biophysica Acta. 1428 (2–3): 169–76. Дои:10.1016 / с0304-4165 (99) 00061-6. PMID 10434034.
Кумари Д., Усдин К. (февраль 2001 г.). «Взаимодействие факторов транскрипции USF1, USF2 и альфа -Pal / Nrf-1 с промотором FMR1. Последствия для синдрома умственной отсталости ломкой Х-хромосомы». Журнал биологической химии. 276 (6): 4357–64. Дои:10.1074 / jbc.M009629200. PMID 11058604.
Kolonics A, Apáti A, Nahajevszky S, Gáti R, Brózik A, Magócsi M (2002). «Нерегулируемая активация STAT-5, ERK1 / 2 и c-Fos может способствовать фенотипической трансформации от миелодиспластического синдрома к острому лейкозу». Гематология. 31 (2): 125–38. Дои:10.1163/15685590152492936. PMID 11583024.
Bengtsson SH, Madeyski-Bengtson K, Nilsson J, Bjursell G (июль 2002 г.). «Регуляция транскрипции гена липазы карбоксилового эфира человека в моноцитах THP-1: E-box, необходимый для активации, связывает вышестоящие стимулирующие факторы 1 и 2». Биохимический журнал. 365 (Pt 2): 481–8. Дои:10.1042 / BJ20020223. ЧВК 1222691. PMID 11945176.
Вильявисенсио Э. Х., Юн Дж. У., Франк Д. Д., Фюхтбауэр Е. М., Вальтерхаус Д. О., Яннакконе П. М. (апрель 2002 г.). «Совместное регулирование E-box человеческого GLI1 с помощью TWIST и USF». Бытие. 32 (4): 247–58. Дои:10.1002 / gene.10078. PMID 11948912. S2CID 12132097.
Мур М.Л., Парк Е.А., Макмиллин Дж. Б. (май 2003 г.). «Верхний стимулирующий фактор подавляет индукцию экспрессии карнитин-пальмитоилтрансферазы-Ibeta PGC-1». Журнал биологической химии. 278 (19): 17263–8. Дои:10.1074 / jbc.M210486200. PMID 12611894.
Пиквелл Г.В., Ши Х., Quattrochi LC (апрель 2003 г.). «Взаимодействие вышележащих белков стимулирующих факторов с E-боксом, расположенным в 5'-фланкирующем гене CYP1A2 человека, способствует активации базального транскрипционного гена». Биохимическая фармакология. 65 (7): 1087–96. Дои:10.1016 / S0006-2952 (03) 00037-6. PMID 12663044.
Чжу Дж., Джаннола Д.М., Чжан Й., Ривера А.Дж., Эмерсон С.Г. (октябрь 2003 г.). «NF-Y взаимодействует с USF1 / 2, чтобы индуцировать гематопоэтическую экспрессию HOXB4». Кровь. 102 (7): 2420–7. Дои:10.1182 / кровь-2003-01-0251. PMID 12791656.

внешние ссылки

FactorBook USF2

Эта статья о ген на хромосома человека 19 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105698 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058239 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8954795-5] Groenen PM, Garcia E, Debeer P, Devriendt K, Fryns JP, Van de Ven WJ (декабрь 1996 г.). «Структура, последовательность и локализация хромосомы 19 человеческого USF2 и его перестройка у пациента с поликистозной дисплазией почек». Геномика. 38 (2): 141–8. Дои:10.1006 / geno.1996.0609. PMID 8954795.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: фактор транскрипции 2 USF2, взаимодействующий с c-fos».

[pmid17353931-7] Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

[pmid8576131-8] Виолле Б., Лефрансуа-Мартинес А.М., Генрион А., Кан А., Раймонджан М., Мартинес А. (январь 1996 г.). «Иммунохимическая характеристика и трансакционные свойства изоформ вышестоящих стимулирующих факторов». Журнал биологической химии. 271 (3): 1405–15. Дои:10.1074 / jbc.271.3.1405. PMID 8576131.

[pmid12611894-9] Мур М.Л., Парк Е.А., Макмиллин Дж. Б. (май 2003 г.). «Верхний стимулирующий фактор подавляет индукцию экспрессии карнитин-пальмитоилтрансферазы-Ibeta PGC-1». Журнал биологической химии. 278 (19): 17263–8. Дои:10.1074 / jbc.M210486200. PMID 12611894.

[pmid14502648-10] Cable PL, Wilson CA, Calzone FJ, Rauscher FJ, Scully R, Livingston DM, Li L, Blackwell CB, Futreal PA, Afshari CA (октябрь 2003 г.). «Новая консенсусная ДНК-связывающая последовательность для белковых комплексов BRCA1». Молекулярный канцерогенез. 38 (2): 85–96. Дои:10.1002 / mc.10148. PMID 14502648. S2CID 24956554.

[pmid19074828-11] Агирре X, Хименес-Веласко A, Сан-Хосе-Энеррис E, Гарате L, Бандрес E, Cordeu L, Aparicio O, Saez B, Navarro G, Vilas-Zornoza A, Pérez-Roger I, García-Foncillas J, Torres A, Heiniger A, Calasanz MJ, Fortes P, Román-Gómez J, Prósper F (декабрь 2008 г.). «Подавление hsa-miR-10a в клетках CD34 + хронического миелоидного лейкоза увеличивает USF2-опосредованный рост клеток». Молекулярные исследования рака. 6 (12): 1830–40. Дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-08-0167. PMID 19074828.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]