GCM1 - GCM1

GCM1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1ODH
Идентификаторы
Псевдонимы	GCM1, GCMA, hGCMa, в глиальных клетках отсутствует гомолог 1, в глиальных клетках отсутствует фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603715 MGI: 108045 ГомолоГен: 2702 Генные карты: GCM1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 6 (человек)
Конец	53,148,841 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	78,065,624 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • связывание ионов цинка; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции; • связывание гистондеацетилазы; • связывание ионов металлов; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• комплекс регуляторов транскрипции; • ядро клетки;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • морфогенез анатомической структуры; • положительная регуляция образования синцития путем слияния плазматической мембраны; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • развитие многоклеточного организма; • ветвление участвует в морфогенезе лабиринтного слоя; • преданность судьбе астроцита; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • глиогенез; • регуляция дифференцировки клеток, участвующих в развитии эмбриональной плаценты; • дифференцировка клеток, участвующих в развитии эмбриональной плаценты;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8521
	14531
	ENSG00000137270
	ENSMUSG00000023333
	Q9NP62
	P70348
	NM_003643
	NM_008103
	NP_003634
	NP_032129
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Хорион-специфический фактор транскрипции GCMa это белок что в люди, кодируется GCM1 ген.^[5]^[6]

Этот ген кодирует ДНК-связывающий белок с мотивом gcm (отсутствующий мотив глиальной клетки ). Кодируемый белок является гомологом Дрозофила в глиальных клетках отсутствует ген (gcm). Этот белок связывается с GCM-мотивом (A / G) CCCGCAT, новой последовательностью среди известных мишеней ДНК-связывающих белков. N-концевой ДНК-связывающий домен придает уникальную ДНК-связывающую активность этого белка.^[6]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137270 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023333 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Акияма Ю., Хосоя Т., Пул А.М., Хотта Ю. (январь 1997 г.). «Мотив gcm: новый ДНК-связывающий мотив, консервативный у дрозофилы и млекопитающих». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (25): 14912–6. Дои:10.1073 / пнас.93.25.14912. ЧВК 26236. PMID 8962155.
^ ^а ^б «Ген Entrez: глиальные клетки GCM1, у которых отсутствует гомолог 1 (Drosophila)».

дальнейшее чтение

Ямада К., Огава Х., Хонда С. и др. (1999). «Белок-мотив GCM участвует в специфической для плаценты экспрессии гена ароматазы человека». J. Biol. Chem. 274 (45): 32279–86. Дои:10.1074 / jbc.274.45.32279. PMID 10542267.
Nait-Oumesmar B, Copperman AB, Lazzarini RA (2000). «Плацентарная экспрессия и хромосомная локализация гена Gcm 1 человека». J. Histochem. Cytochem. 48 (7): 915–22. Дои:10.1177/002215540004800704. PMID 10858268.
Ямада К., Огава Х., Тамия Г. и др. (2001). «Геномная организация, хромосомная локализация и полная последовательность ДНК в 22 т.п.н. человеческого GCMa / GCM1, гена плацентоспецифического фактора транскрипции». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 278 (1): 134–9. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3775. PMID 11071865.
Ю Ц., Шен К., Лин М. и др. (2003). «GCMa регулирует опосредованное синцитином слияние трофобластов». J. Biol. Chem. 277 (51): 50062–8. Дои:10.1074 / jbc.M209316200. PMID 12397062.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID 14574404.
Chen CP, Chen CY, Yang YC и др. (2005). «Снижение экспрессии гена GCM1 плаценты (отсутствие глиальных клеток) при преэклампсии». Плацента. 25 (5): 413–21. Дои:10.1016 / j.placenta.2003.10.014. PMID 15081636.
Бачик Д., Саткунаратнам А., Наит-Оумесмар Б. и др. (2004). «Сложные образцы мРНК и белка GCM1 в ворсинчатых и вневорсинчатых клетках трофобласта плаценты человека». Плацента. 25 (6): 553–9. Дои:10.1016 / j.placenta.2003.12.004. PMID 15135239.
Шуберт С.В., Кардаш Э., Хан М.А. и др. (2005). «Взаимодействие, кооперативная модуляция промотора и почечная колокализация GCMa и Pitx2». J. Biol. Chem. 279 (48): 50358–65. Дои:10.1074 / jbc.M404587200. PMID 15385555.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Ян Ч.С., Ю Ц., Чуанг Х.С. и др. (2005). «FBW2 нацеливает GCMa на систему деградации убиквитин-протеасома». J. Biol. Chem. 280 (11): 10083–90. Дои:10.1074 / jbc.M413986200. PMID 15640526.
Knerr I, Schubert SW, Wich C, et al. (2005). «Стимуляция GCMa и синцитина с помощью цАМФ-опосредованной передачи сигналов PKA в человеческих трофобластических клетках в нормоксических и гипоксических условиях». FEBS Lett. 579 (18): 3991–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.06.029. PMID 16004993. S2CID 46648257.
Чанг Ч.В., Чуанг Х.С., Ю Ц. и др. (2005). «Стимуляция транскрипционной активности GCMa с помощью передачи сигналов циклическим AMP / протеинкиназой А приписывается CBP-опосредованному ацетилированию GCMa». Мол. Cell. Биол. 25 (19): 8401–14. Дои:10.1128 / MCB.25.19.8401-8414.2005. ЧВК 1265739. PMID 16166624.
Чуанг ХК, Чанг Ч.В., Чанг Г.Д. и др. (2006). «Гистоновая деацетилаза 3 связывается с фактором транскрипции GCMa и регулирует его». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (5): 1459–69. Дои:10.1093 / nar / gkl048. ЧВК 1401512. PMID 16528103.
Фудзито Н., Самура О, Михару Н. и др. (2007). «Увеличение количества мРНК плаценты 1 (PLAC1) и отсутствующих глиальных клеток 1 (GCM1) у матерей с преэклампсией». Hiroshima J. Med. Наука. 55 (1): 9–15. PMID 16594548.
Чжоу С.К., Чанг С., Лю Дж. Х. и др. (2007). «Небольшая модификация убиквитин-подобного модификатора регулирует активность связывания ДНК глиальной клетки, у которой отсутствует гомолог a Drosophila». J. Biol. Chem. 282 (37): 27239–49. Дои:10.1074 / jbc.M700351200. PMID 17646165.

Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137270 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023333 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8962155-5] Акияма Ю., Хосоя Т., Пул А.М., Хотта Ю. (январь 1997 г.). «Мотив gcm: новый ДНК-связывающий мотив, консервативный у дрозофилы и млекопитающих». Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (25): 14912–6. Дои:10.1073 / пнас.93.25.14912. ЧВК 26236. PMID 8962155.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: глиальные клетки GCM1, у которых отсутствует гомолог 1 (Drosophila)».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]