Гистон H3 - Histone H3
| Гистон H3, семейство 3A (H3.3A) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Символ | H3F3A | ||||||
| Альт. символы | H3F3 | ||||||
| Ген NCBI | 3020 | ||||||
| HGNC | 4764 | ||||||
| OMIM | 601128 | ||||||
| RefSeq | NM_002107 | ||||||
| UniProt | Q66I33 | ||||||
| Прочие данные | |||||||
| Locus | Chr. 1 q41 | ||||||
| |||||||
| Гистон H3, семейство 3B (H3.3B) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||
| Символ | H3F3B | ||||||
| Ген NCBI | 3021 | ||||||
| HGNC | 4765 | ||||||
| OMIM | 601058 | ||||||
| RefSeq | NM_005324 | ||||||
| UniProt | P84243 | ||||||
| Прочие данные | |||||||
| Locus | Chr. 17 q25 | ||||||
| |||||||
Гистон H3 один из пяти основных гистоны участвует в структуре хроматин в эукариотические клетки.[1][2] Имея главный глобулярный домен и длинный N-концевой хвост, H3 участвует в структуре нуклеосомы конструкции "бусины на нитке". Гистоновые белки сильно посттрансляционно модифицированы, однако гистон H3 является наиболее сильно модифицированным из пяти гистонов. Сам по себе термин «гистон H3» намеренно неоднозначен, поскольку он не делает различий между вариантами последовательности или состоянием модификации. Гистон H3 - важный белок в развивающейся области эпигенетика, где его варианты последовательности и состояния вариабельной модификации, как полагают, играют роль в динамической и долгосрочной регуляции генов.
Эпигенетика и посттрансляционные модификации
N-конец H3 выступает из шаровидного нуклеосома core и подвержен посттрансляционным модификациям, влияющим на клеточные процессы. Эти модификации включают ковалентное присоединение метильных или ацетильных групп к лизин и аргинин аминокислоты и фосфорилирование серин или же треонин. Ди- и три-метилирование лизина 9 связано с репрессией и гетерохроматин (видеть H3K9me2 и H3K9me3 ), тогда как монометилирование K4 (K4 соответствует остатку лизина в 4-м положении) (см. H3K4me1 ), связан с активными генами.[3][4] Ацетилирование гистона H3 в нескольких положениях лизина в гистоновом хвосте осуществляется с помощью гистонацетилтрансфераза ферменты (HAT). Ацетилирование лизина14 обычно наблюдается в генах, которые активно транскрибируются в РНК (видеть H3K14ac ).
Варианты последовательности
Клетки млекопитающих имеют семь известных вариантов последовательности гистона H3. Они обозначаются как гистон H3.1, гистон H3.2, гистон H3.3, гистон H3.4 (H3T), гистон H3.5, гистон H3.X и гистон H3.Y, но имеют высококонсервативные последовательности, различающиеся только мало аминокислот.[5][6] Было обнаружено, что гистон H3.3 играет важную роль в поддержании целостности генома во время развития млекопитающих.[7] Варианты гистонов от разных организмов, их классификацию и особенности вариантов можно найти в "HistoneDB - с вариантами" база данных.
Генетика
Гистоны H3 кодируются несколькими генами в геноме человека, включая:
- H3.1: HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J
- H3.2: HIST2H3A, HIST2H3C, HIST2H3D
- H3.3: H3F3A, H3F3B
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Бхасин М, Райнхерц Э.Л., Реч ПА (2006). «Распознавание и классификация гистонов с помощью машины опорных векторов» (PDF). Журнал вычислительной биологии. 13 (1): 102–12. Дои:10.1089 / cmb.2006.13.102. PMID 16472024.
- ^ Хартл Д.Л., Фрайфельдер Д., Снайдер Л.А. (1988). Базовая генетика. Бостон: Джонс и Бартлетт Издательство. ISBN 978-0-86720-090-4.
- ^ Розенфельд Дж. А., Ван З., Шонес Д. Е., Чжао К., ДеСалле Р., Чжан М.К. (март 2009 г.). «Определение модификаций обогащенных гистонов в негенных частях генома человека». BMC Genomics. 10: 143. Дои:10.1186/1471-2164-10-143. ЧВК 2667539. PMID 19335899.
- ^ Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С., Мехтлер К., Йенувейн Т. (март 2001 г.). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Натур.410..116л. Дои:10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
- ^ Марзлафф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
- ^ Хак С.Б., Гарсия Б.А., Дункан Э.М., Кауэр М., Деллер Дж., Шабановиц Дж., Базетт-Джонс Д.П., Allis CD, Hunt DF (январь 2006 г.). «Паттерны экспрессии и посттрансляционные модификации, связанные с вариантами гистона H3 млекопитающих». Журнал биологической химии. 281 (1): 559–68. Дои:10.1074 / jbc.M509266200. PMID 16267050.
- ^ Jang CW, Shibata Y, Starmer J, Yee D, Magnuson T (июль 2015 г.). «Гистон H3.3 поддерживает целостность генома во время развития млекопитающих». Гены и развитие. 29 (13): 1377–92. Дои:10.1101 / gad.264150.115. ЧВК 4511213. PMID 26159997.