Спидроин - Википедия - Spidroin

Спидроин, N-концевой
Идентификаторы
СимволSpidroin_N
PfamPF16763
ИнтерПроIPR031913
CATH2lpj
Спидроин, С-конец
Идентификаторы
СимволSpidroin_MaSp
PfamPF11260
ИнтерПроIPR021001
CATH2 мин.
Спидроин-1
Идентификаторы
ОрганизмНефила клавипес
Символ?
UniProtP19837
Спидроин-2
Идентификаторы
ОрганизмНефила клавипес
Символ?
UniProtP46804
Схема строения спидроина

Спидроины основные белки в паучий шелк. Различные типы паучьего шелка содержат разные спидроины, все из которых являются членами одного белковая семья.[1] Наиболее изученным типом спидроинов являются основные протеины ампульного шелка (MaSp), используемые при создании шелка драглайна, самого прочного типа шелка паука. Шелковое волокно драглайна состоит из двух типов спидроинов: спидроина-1 (MaSp1) и спидроина-2 (MaSp2).[2][3]

Спидроин является частью большой группы белков, называемых склеропротеины. В эту группу входят другие нерастворимые структурные белки, такие как коллаген и кератин.

Волокно спидроина драглайна такое же толстое и прочное, как волокно из стали, но более гибкое. Его можно растянуть примерно на 135% от исходной длины без разрушения. Его свойства делают его отличным кандидатом для использования в различных областях науки.[4]

Структура

Основные спидроины в форме ампул представляют собой большие белки с расширением 250–350 кДа, содержащие в среднем 3500 аминокислот. Они представляют собой полимерную организацию, в основном основанную на высокогомогенизированных тандем повторяет. Существует 100 тандемных копий от 30 до 40 аминокислот, которые повторяют последовательность, и они составляют более 90% белковой последовательности.[5] Остатки аланина и глицина наиболее распространены. Аланин появляется в блоках от шести до четырнадцати единиц, которые образуют β-листы. Эти блоки аланина могут складываться друг с другом, создавая кристаллические структуры в волокне, связывая вместе различные белковые молекулы. Глицин присутствует в различных мотивах, таких как GGX и GPGXX (где X = A, L, Q или Y), которые также имеют специфические вторичные структуры (3 10 спиралей и β-спираль соответственно). Богатые глицином области более аморфны и способствуют растяжимости и гибкости. Некоторые из различий, наблюдаемых между спидроином 1 и спидроином 2 (наиболее важными спидроинами основных ампул), заключаются в содержании пролина, которое очень низкое в первом, но значимо во втором, и мотивы. Мотив (GGX) n характерен для спидроина 1, тогда как GPG и QQ типичны для спидроина 2.

С другой стороны, спидроины имеют неповторяющиеся амино (N) и карбоксильные (C) концевые домены примерно из 150 и 100 аминокислот соответственно. N- и C-концевые домены имеют мало общего, за исключением того, что они оба богаты серином и оба в значительной степени являются амфипатическими α-спиральными вторичными структурами. Эти домены законсервированы не только между спидроинами 1 и 2, но и среди многих типов шелка и видов пауков. Экспериментальные данные показывают, что N- и C-концевые домены вносят вклад в сборку волокна.[6] В С-концевой домен участвует в организованном переходе от растворимого раствора спидроина к нерастворимому волокну при прядении.[7] в N-концевой домен, существуют сигнальные пептиды, которые регулируют секрецию спидроина клетками шелковой железы.[8][9]

Биологическая функция

Отдельный паук прядет множество типов шелка, каждый из которых образуется из собственного отличительного набора брюшного шелка. железы. Этот сложный шелковый механизм позволяет паукам использовать шелк для решения конкретных задач (например, для сборки паутины, изготовления яиц, упаковки добычи и т. Д.).[9] Различные типы шелка (основной ампулярный шелк, второстепенный амплитудный шелк, жгутикообразный шелк, игольчатый шелк, трубчатый шелк, грушевидный шелк и совокупный шелк)[10] состоят из разных типов белков.

Шелк драглайна в основном состоит из белков спидроина. Это разновидность большого ампульного шелка, вырабатываемого большой ампульной железой. Шелк драглайна используется не только для создания внешнего каркаса и радиусов паутины в форме шара, но и как висячий спасательный трос, который позволяет пауку уклоняться и / или убегать от хищников.[11] Основная ампульная железа, производящая этот шелк, состоит из трех основных частей: центральной сумки (зона B), обрамленной хвостом (зона A), и протока, ведущего к выходу. Хвост выделяет большую часть «прядильной смеси», раствора, который содержит молекулы белка, из которых состоит шелковое волокно. Мешок - это основное хранилище.

В эпителий Зона А состоит из высоких столбов секреторных клеток одного типа, заполненных секреторными гранулами. Основным компонентом этих клеток, которые секретируют раствор фиброина, является белок 275 кДа, содержащий полипептиды спидроин I и спидроин II. Выход этих клеток представляет собой водный и высоковязкий раствор примерно 50% белка (в основном спидроина). Выделяемый продукт составляет основную структуру драглайна - шелк.

Эта высоковязкая белковая эмульсия течет в зону B, где она покрывается гликопротеины. После выхода из этого мешка жидкость переливается в узкий канал. По мере продвижения гелеобразного белкового раствора в проток спидроины и гликопротеины постепенно деформируются в длинные, тонкие, выровненные фигуры с направлением потока. Затем они растягиваются и выстраиваются таким образом, что в конечном итоге позволяет им создавать прочные межмолекулярные связи. После различных процессов шелк вытягивается в прядильном канале, образуя чрезвычайно прочный нить.

Промышленные и биомедицинские приложения

В последнее десятилетие было проведено много исследований спидроинового протеина и паучьего шелка с целью использования некоторых его свойств, таких как эластичность и прочность. Паучий шелк используется в различных отраслях промышленности, и спектр его применения в биомедицине увеличивается с каждым днем. Например, в военной и оборонной промышленности используются бронежилеты из этих волокон.

Рекомбинантный спидроин был успешно получен как в эукариотических, так и в прокариотических клетках, хотя при этом возникли некоторые трудности из-за длины последовательности гена. Благодаря работе по экспрессии и клонированию можно получить крупномасштабное производство спидроина, что открывает новые возможности для производства новых биоматериалов.[12] Были попытки создать трансгенные растения табака и картофеля, которые экспрессируют значительные количества рекомбинантных белков драглайнов Nephila clavipes.[13]

Кроме того, волокна, полученные из спидроина, допустимы. in vitro, в культура клеток, и in vivo, у животных, таких как свиньи, без признаков воспалительная реакция на эти волокна не было обнаружено реакции организма. Эти результаты предполагают, что они могут быть использованы в медицине без риска проблем с биосовместимостью и, таким образом, потенциально открывают множество новых возможностей в тканевой инженерии и регенеративной медицине.

То, как пауки производят спидроин в мицеллах, вдохновило на создание метода массового производства рекомбинантных белков. Путем слияния нечувствительного к pH мутанта N-концевого домена спидроида с обратным зарядом с белками для получения гораздо больше растворимых белков можно получить в Кишечная палочка.[14]

Другие виды шелка

Трубчатый (яичный футляр) структурный домен шелковых нитей
Идентификаторы
СимволRP1-2
PfamPF12042
ИнтерПроIPR021915
CATH2мкг
Смотрите также: паучий шелк § Виды

Белки шелка, присутствующие в других типах шелка пауков, также иногда называют спидроином. К ним относятся тубулиформный слизистый белок (TuSP), белок жгутикового шелка (Flag; O44358-Q9NHW4-O44359), минорные ампулярные белки шелка (MiSp; K4MTL7), ациниформный белок шелка (AcSP), грушевидный белок шелка (PySp) и совокупный шелковый клей (ASG2 / AgSp). Эти различные белки шелка вместе с MaSP демонстрируют некоторый уровень гомологии друг с другом в белковых доменах, повторах и промоторах, но также имеют свои собственные уникальные особенности и вариации в этих частях для выполнения их различных функций.[15][16][17] Эти общие черты указывают на общее происхождение белков, обнаруженных во всех этих различных типах шелка.[1][9]

Искусственное производство

Масштабное производство и экструзия волокна MaSp1- (6-mer) искусственного spidroin.webp

В июле 2020 года команда RIKΞN исследователи сообщают, что им удалось использовать генетически измененный вариант из Р. сульфидофилум производить спидроины.[18][19]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Аюб Н.А., Гарб Дж. Э., Куэлбс А., Хаяши С. Ю. (март 2013 г.). «Древние свойства паучьего шелка, раскрытые полной последовательностью генов белка шелка, оборачивающего добычу (AcSp1)». Молекулярная биология и эволюция. 30 (3): 589–601. Дои:10.1093 / молбев / mss254. ЧВК  3563967. PMID  23155003.
  2. ^ Мотрюк-Смит Д., Смит А., Хаяши К. Ю., Льюис Р. В. (2005). «Анализ консервативных N-концевых доменов в белках шелка пауков основных ампул». Биомакромолекулы. 6 (6): 3152–9. Дои:10.1021 / bm050472b. PMID  16283740.
  3. ^ Мойсенович М.М., Пустовалова О., Шакелфорд Дж., Васильева Т.В., Дружинина Т.В., Каменчук Ю.А., Гузеев В.В., Соколова О.С., Богуш В.Г., Дебабов В.Г., Кирпичников М.П., ​​Агапов И.И. (май 2012 г.). «Регенерация ткани in vivo внутри рекомбинантных каркасов спидроина 1». Биоматериалы. 33 (15): 3887–98. Дои:10.1016 / j.biomaterials.2012.02.013. PMID  22364702.
  4. ^ Аскари Г., Хедхаммар М., Нордлинг К., Саенс А., Казальс К., Восход А., Йоханссон Дж., Найт С.Д. (май 2010 г.). «Самосборка белков паучьего шелка контролируется pH-чувствительным реле». Природа. 465 (7295): 236–8. Bibcode:2010Натура.465..236А. Дои:10.1038 / природа08962. PMID  20463740. S2CID  4366005.
  5. ^ Сюй М., Льюис Р.В. (сентябрь 1990 г.). «Состав протеинового суперволокна: шелк драглайна паука». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (18): 7120–4. Bibcode:1990PNAS ... 87.7120X. Дои:10.1073 / пнас.87.18.7120. ЧВК  54695. PMID  2402494.
  6. ^ Huemmerich D, Helsen CW, Quedzuweit S, Oschmann J, Rudolph R, Scheibel T (октябрь 2004 г.). «Элементы первичной структуры шелка драглайнов пауков и их вклад в растворимость белков». Биохимия. 43 (42): 13604–12. Дои:10.1021 / bi048983q. PMID  15491167.
  7. ^ Sponner A, Vater W, Rommerskirch W, Vollrath F, Unger E, Grosse F, Weisshart K (декабрь 2005 г.). «Консервативные С-концы вносят вклад в свойства фиброинов шелка паука». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 338 (2): 897–902. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.10.048. PMID  16253207.
  8. ^ Старк М., Грип С., Восходящий А., Хедхаммар М., Энгстрём В., Хьяльм Г., Йоханссон Дж. (Май 2007 г.). «Макроскопические волокна, самоорганизующиеся из рекомбинантных белков шелка миниатюрного паука». Биомакромолекулы. 8 (5): 1695–701. Дои:10.1021 / bm070049y. PMID  17402782.
  9. ^ а б c Гарб Дж. Э., Аюб Н. А., Хаяши С. Ю. (август 2010 г.). "Распутанная эволюция паучьего шелка с концевыми доменами спидроина". BMC Эволюционная биология. 10: 243. Дои:10.1186/1471-2148-10-243. ЧВК  2928236. PMID  20696068.
  10. ^ Ховорка С, изд. (2011). Прогресс в молекулярной биологии и переводческой науке. 103. Лондон: Elsevier Science.
  11. ^ Гейнс WA, Маркотт WR (сентябрь 2008 г.). «Идентификация и характеристика множества генов спидроина 1, кодирующих основные белки ампулярного шелка у Nephila clavipes». Молекулярная биология насекомых. 17 (5): 465–74. Дои:10.1111 / j.1365-2583.2008.00828.x. ЧВК  2831225. PMID  18828837.
  12. ^ Райзинг А., Видхе М., Йоханссон Дж., Хедхаммар М. Белки шелка паука: последние достижения в области рекомбинантного производства, взаимосвязи между структурой и функцией и биомедицинских приложений. Клетка. Мол. Life Sci. (2011) 68: 169–184
  13. ^ Scheller J, Gührs KH, Grosse F, Conrad U (июнь 2001 г.). «Производство белков паучьего шелка в табаке и картофеле». Природа Биотехнологии. 19 (6): 573–7. Дои:10.1038/89335. PMID  11385464. S2CID  517678.
  14. ^ Кронквист, Нина; Сарр, Медун; Линдквист, Антон; Нордлинг, Керстин; Отиковы, Мартиньши; Вентури, Лука; Пиоселли, Барбара; Пурхонен, Паси; Ландре, Майкл; Биверстол, Хенрик; Толейкис, Зигмантас; Сьёберг, Лиза; Робинсон, Кэрол В .; Пелицци, Никола; Йорнвалль, Ганс; Хеберт, Ганс; Яудземс, Кристапс; Курстедт, Тор; Восход, Анна; Йоханссон, янв (23 мая 2017 г.). «Эффективное производство белка, вдохновленное тем, как пауки производят шелк». Nature Communications. 8 (1): 15504. Bibcode:2017НатКо ... 815504K. Дои:10.1038 / ncomms15504. ЧВК  5457526. PMID  28534479.
  15. ^ Вэнь Р., Лю X, Мэн Цюй (декабрь 2017 г.). «Характеристика гена спидроина канальцевидной формы полной длины из Araneus ventricosus». Международный журнал биологических макромолекул. 105 (Pt 1): 702–710. Дои:10.1016 / j.ijbiomac.2017.07.086. PMID  28735001.
  16. ^ Дос Сантос-Пинто-младший, Аркури HA, Esteves FG, Palma MS, Lubec G (октябрь 2018 г.). «Протеом паучьего шелка дает представление о структурных характеристиках жгутикового спидроина Nephila clavipes». Научные отчеты. 8 (1): 14674. Bibcode:2018НатСР ... 814674D. Дои:10.1038 / s41598-018-33068-9. ЧВК  6168590. PMID  30279551.
  17. ^ Коллин М.А., Кларк Т.Х., Аюб Н.А., Хаяши С.Ю. (февраль 2016 г.). «Доказательства, полученные от множества видов, что компонент клея из паучьего шелка ASG2 является спидроином». Научные отчеты. 6 (1): 21589. Bibcode:2016НатСР ... 621589C. Дои:10.1038 / srep21589. ЧВК  4753498. PMID  26875681.
  18. ^ «Паучий шелк, созданный фотосинтетическими бактериями». Phys.org. Получено 16 августа 2020.
  19. ^ Foong CP, Higuchi-Takeuchi M, Малайский AD, Oktaviani NA, Thagun C, Numata K (июль 2020 г.). «Фабрика морских фотосинтетических микробных клеток как платформа для производства паучьего шелка». Биология коммуникации. ООО "Спрингер Сайенс энд Бизнес Медиа". 3 (1): 357. Дои:10.1038 / с42003-020-1099-6. ЧВК  7343832. PMID  32641733. CC-BY icon.svg Текст и изображения доступны под Международная лицензия Creative Commons Attribution 4.0.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q05H60 (Большая ампульная спидроин 1) в PDBe-KB.