T4 холин - T4 holin
В T4 Семья Холин (ТК № 1.Е.8 ) представляет собой группу предполагаемых порообразующих белков, которая не принадлежит ни к одному из семи суперсемейств холинов. Т-четный фаг, такой как Т4, использует систему холин-эндолизин для хозяина. лизис клеток. Хотя эндолизин фаг Т4, кодируемый геном е (лизоцим Е), был идентифицирован в 1961 году, холин (продукт гена t и называемый Т-холином) не был охарактеризован до 2001 года.[1] Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству холинов Т4, можно найти в База данных классификации транспортеров.[2]
Структура
Холин Т4 довольно большой, около 218 аминоацильных остатков (а.с.) в длину. Белок является высокогидрофильным с 49 кислотными и основными остатками, распределенными по его длине, и единственным предполагаемым трансмембранным сегментом (TMS) рядом с ним. N-конец, оставляя большую часть белка в периплазма.[3]
Функция
Большой периплазматический домен является основным детерминантом временного механизма и участвует в ингибировании лизиса (LIN).[4] LIN включает антихолиновый белок rI Т4 (см. ТК № 1.Е.8.1.1 ).[5] Ингибирование лизиса является эффективной стратегией для координации времени лизиса с созреванием фаговых частиц и исключения других фагов.[6] С-концевой периплазматический домен холина Т4 связывает периплазматический домен антихолина Т4 (RI; 97 аминокислотных остатков), который, как и холин, охватывает мембрану один раз.[3] Т-холин фага Т4 образует комплекс 1: 1 с ингибитором RI, который блокирует агрегацию и образование пор.[7]
Гомология
Фаг Т4 Т-холин (лизисный белок ) идентичен холин из фага K3 и почти идентичен таковому из фага ARI. Остатки 35-96 на 28% идентичны остаткам 436-495 K+ поглощать белок Lactococcus lactis (gbAAK04721; TC № 2.A.72; KUP), предполагая эволюционные отношения между холином и переносчиком. У Холинов от 1 до 4 ТМС и короткое C-терминал домен, богатый основными остатками.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Раманкулов, Э .; Янг, Р. (2001-04-01). «Функциональный анализ холина фага Т4 в лямбда-контексте». Молекулярная генетика и геномика: MGG. 265 (2): 345–353. Дои:10.1007 / s004380000422. ISSN 1617-4615. PMID 11361346. S2CID 40455691.
- ^ "1.E.8 Семья T4 Holin (T4 Holin)". База данных классификации транспортеров. Получено 2016-03-26.
- ^ а б Тран, трамвай Ань Т .; Ударил, Дуглас К .; Янг, Ry (01.10.2005). «Периплазматические домены определяют взаимодействия холин-антихолин при ингибировании лизиса t4». Журнал бактериологии. 187 (19): 6631–6640. Дои:10.1128 / JB.187.19.6631-6640.2005. ISSN 0021-9193. ЧВК 1251592. PMID 16166524.
- ^ Раманкулов, Э .; Янг, Р. (2001-03-07). «Генетический анализ холина Т4: сроки и топология». Ген. 265 (1–2): 25–36. Дои:10.1016 / s0378-1119 (01) 00365-1. ISSN 0378-1119. PMID 11255004.
- ^ Раманкулов, Э .; Янг, Р. (2001-08-01). «Древний игрок разоблачен: T4 rI кодирует t-специфический антихолин». Молекулярная микробиология. 41 (3): 575–583. Дои:10.1046 / j.1365-2958.2001.02491.x. ISSN 0950-382X. PMID 11532126. S2CID 25273199.
- ^ Миллер, Эрик С .; Каттер, Элизабет; Мосиг, Гизела; Арисака, Фумио; Кунисава, Такаши; Рюгер, Вольфганг (2003-03-01). «Геном бактериофага Т4». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 67 (1): 86–156, содержание. Дои:10.1128 / mmbr.67.1.86-156.2003. ISSN 1092-2172. ЧВК 150520. PMID 12626685.
- ^ Moussa, Samir H .; Кузнецов, Владимир; Тран, трамвай Ань Т .; Саккеттини, Джеймс С.; Янг, Ry (2012-04-01). «Белковые детерминанты ингибирования лизиса фага Т4». Белковая наука. 21 (4): 571–582. Дои:10.1002 / pro.2042. ISSN 1469-896X. ЧВК 3375757. PMID 22389108.
дальнейшее чтение
- Каталао MJ, Gil F, Moniz-Pereira J, São-José C, Pimentel M (2013). «Разнообразие систем бактериального лизиса: бактериофаги указывают путь». Обзор микробиологии FEMS. 37 (4): 554–571. Дои:10.1111/1574-6976.12006. PMID 23043507.
- Мусса С.Х., Лоулер Дж. Л., Янг Р. (2014). «Генетическое рассечение лизиса Т4». Журнал бактериологии. 196 (12): 2201–2209. Дои:10.1128 / JB.01548-14. ЧВК 4054191. PMID 24706740.
- Сайер М. Х., Редди Б. Л., Марголин В. (2015). «Холины в бактериях, эукариотах и архее: многофункциональные ксенологи с потенциальным биотехнологическим и биомедицинским применением». Журнал бактериологии. 197 (1): 7–17. Дои:10.1128 / JB.02046-14. ЧВК 4288690. PMID 25157079.
- Тран Т.А., Струк Д.К., Янг Р. (2005). «Периплазматические домены определяют взаимодействия холин-антихолин при ингибировании лизиса Т4». Журнал бактериологии. 187 (19): 6631–6640. Дои:10.1128 / JB.187.19.6631-6640.2005. ЧВК 1251592. PMID 16166524.
- Тран Т.А., Струк Д.К., Янг Р. (2007). «Антихолин RI T4 имеет N-концевой домен высвобождения якоря сигнала, который нацелен на его деградацию под действием DegP». Журнал бактериологии. 189 (21): 7618–7625. Дои:10.1128 / JB.00854-07. ЧВК 2168732. PMID 17693511.
- Ван И., Смит Д.Л., Янг Р. (2000). "Холины: Белковые часы бактериофаговых инфекций". Ежегодный обзор микробиологии. 54 (1): 799–825. Дои:10.1146 / annurev.micro.54.1.799. PMID 11018145.
По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из "1.E.8 Семья T4 Holin (T4 Holin)", который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.