Top7 - Top7

Top7 искусственный 93-остаток белок, классифицируемый как de novo белок так как это было разработан Брайан Кульман и Гаутам Дантас в Дэвид Бейкер лаборатория в Вашингтонский университет иметь уникальную складку, не встречающуюся в природе.[1] Белок был разработан ab initio на компьютере с помощью предсказание структуры белка алгоритмы. Определение высокого разрешения Рентгеновская структура экспериментально экспрессированного и очищенного белка выявили, что структура (PDB ID: 1QYS ) действительно был очень похож (1.2 Å RMSD ) к компьютерной модели. Структура состоит из двух альфа спирали упакован на пятижильный антипараллельный бета-лист.

Top7 был отмечен как «Молекула месяца» по версии RCSB Protein Data Bank в октябре 2005 г.[2] и суперпозиция соответствующих ядер (остатки 60-79) его предсказанной и рентгеновской кристаллических структур представлены в Rosetta @ home логотип.

Рекомендации

  1. ^ Кульман Б., Дантас Г., Иретон Г. К., Варани Г., Стоддард Б. Л., Бейкер Д. (21 ноября 2003 г.). «Дизайн новой глобулярной белковой складки с точностью до атомного уровня». Наука. 302 (5649): 1364–1368. Bibcode:2003Научный ... 302.1364K. Дои:10.1126 / science.1089427. PMID  14631033.
  2. ^ «Молекула месяца за октябрь 2005 года: дизайнерские белки». Банк данных белков RCSB. Дои:10.2210 / rcsb_pdb / mom_2005_10. Получено 2017-01-15.