Трансплайсинг - Trans-splicing

Транс-сращивание особая форма Обработка РНК куда экзоны из двух разных первичных Транскрипты РНК соединены встык и перевязанный. Обычно встречается в эукариоты и при посредничестве сплайсосома, хотя некоторые бактерии и археи также имеют "полугены" тРНК.[1]

Genic транс-сращивание

Тогда как "нормальный" (СНГ-) сращивание обрабатывает одну молекулу, транс-сплайсинг генерирует один транскрипт РНК из нескольких отдельных пре-мРНК. Этот феномен можно использовать в молекулярной терапии для лечения продуктов мутировавших генов.[2]

Онкогенез

Хотя некоторые транскрипты слияния происходят через транс-сплайсинг в нормальных клетках человека,[1] транс-сплайсинг также может быть механизмом определенных онкогенных стенограммы слияния.[3][4]

SL транс-сращивание

Сращенный лидер (SL) транс-сплайсинг используется некоторыми микроорганизмами, особенно простейшими Kinetoplastae класс экспрессировать гены. У этих организмов транскрибируется лидерная РНК с кэпом сплайсинга, и одновременно гены транскрибируются в длинные полицистроны.[5] Лидер склейки с крышкой транс-сплайсинг на каждый ген для создания моноцистронных кэпированных и полиаденилированных транскриптов.[6] Эти рано расходящиеся эукариоты используют мало интроны, и сплайсосомы, которыми они обладают, демонстрируют некоторые необычные вариации в сборке их структур.[6][7] Они также обладают множеством eIF4E изоформы со специализированными ролями в укупорке.[8]

Некоторые другие эукариоты, особенно среди динофлагелляты, губки, нематоды, книдарийцы, гребневики, плоские черви, ракообразные, хетогнаты, коловратки, и оболочки также более или менее часто используйте SL транс-сращивание.[1][9] В оболочке Циона кишечника, протяженность SL транс-сращивание лучше описывается количественным представлением, распознающим часто и редко транс-сращенные гены, а не бинарная и обычная категоризация транс-сращенные по сравнению с не-транс-сращенные гены.[10]

Одна функция SL транс-сращивание - это разрешение полицистронный стенограммы опероны в отдельные 5'-кэпированные мРНК. Эта обработка достигается, когда Outrons находятся транс-сплайсинг на неспаренные, расположенные ниже акцепторные сайты, прилегающие к цистрону открытые рамки для чтения.[11][12]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c Лей Ц., Ли Ц., Цзо Цз., Хуанг Ц., Ченг Х., Чжоу Р. (март 2016 г.). «Эволюционное понимание транс-сплайсинга РНК у позвоночных». Геномная биология и эволюция. 8 (3): 562–77. Дои:10.1093 / gbe / evw025. ЧВК  4824033. PMID  26966239.
  2. ^ Ивасаки Р., Киучи Х., Ихара М., Мори Т., Каваками М., Уэда Х. (июль 2009 г.). «Транс-сплайсинг как новый метод быстрого получения слитых белков антител». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 384 (3): 316–21. Дои:10.1016 / j.bbrc.2009.04.122. PMID  19409879.
  3. ^ Ли Х, Ван Дж, Мор Дж, Склар Дж (сентябрь 2008 г.). «Слияние неопластических генов имитирует транс-сплайсинг РНК в нормальных клетках человека». Наука. 321 (5894): 1357–61. Bibcode:2008Sci ... 321.1357L. Дои:10.1126 / science.1156725. PMID  18772439.
  4. ^ Рикман Д.С., Пфлюгер Д., Мосс Б., ВанДорен В.Е., Чен С.Х., де ла Тайл А. и др. (Апрель 2009 г.). «SLC45A3-ELK4 представляет собой новый и часто встречающийся слитный транскрипт, специфичный для трансформации эритробластов, при раке простаты». Исследования рака. 69 (7): 2734–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-4926. ЧВК  4063441. PMID  19293179.
  5. ^ Кэмпбелл Д.А., Штурм Н.Р., Ю. М.К. (февраль 2000 г.). "Транскрипция гена лидерной РНК сплайсированной кинетопластиды". Паразитология сегодня. 16 (2): 78–82. Дои:10.1016 / s0169-4758 (99) 01545-8. PMID  10652494.
  6. ^ а б Лян XH, Харитан А., Улиел С., Михаэли С. (октябрь 2003 г.). «транс- и цис-сплайсинг у трипаносоматид: механизм, факторы и регуляция». Эукариотическая клетка. 2 (5): 830–40. Дои:10.1128 / EC.2.5.830-840.2003. ЧВК  219355. PMID  14555465.
  7. ^ Гюнцль А. (август 2010 г.). «Механизм сплайсинга пре-мРНК трипаносом: сложный или упрощенный?». Эукариотическая клетка. 9 (8): 1159–70. Дои:10.1128 / EC.00113-10. ЧВК  2918933. PMID  20581293.
  8. ^ Freire ER, Sturm NR, Campbell DA, de Melo Neto OP (октябрь 2017 г.). «Роль цитоплазматических мРНК Cap-связывающих белковых комплексов в Trypanosoma brucei и других трипаносоматидах». Патогены. 6 (4): 55. Дои:10.3390 / pathogens6040055. ЧВК  5750579. PMID  29077018.
  9. ^ Ласда Э.Л., Блюменталь Т. (01.05.2011). «Транс-сращивание». Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК. 2 (3): 417–34. Дои:10.1002 / wrna.71. PMID  21957027.
  10. ^ Мацумото Дж., Дьюар К., Вассершайд Дж., Уайли Г.Б., Макмил С.Л., Роу Б.А. и др. (Май 2010 г.). «Высокопроизводительный анализ последовательности мРНК, подвергнутых транс-сплайсингу Ciona Кишечник SL: альтернативные способы экспрессии и коррелирует функция гена». Геномные исследования. 20 (5): 636–45. Дои:10.1101 / гр.100271.109. ЧВК  2860165. PMID  20212022.
  11. ^ Клейтон, Кристин Э. (15 апреля 2002 г.). «Жизнь без контроля транскрипции? От мухи к человеку и обратно». Журнал EMBO. 21 (8): 1881–1888. Дои:10.1093 / emboj / 21.8.1881. ISSN  1460-2075. ЧВК  125970. PMID  11953307.
  12. ^ Блюменталь, Томас; Глисон, Кэти Сеггерсон (февраль 2003 г.). "Caenorhabditis elegans опероны: форма и функции ». Природа Обзоры Генетика. 4 (2): 110–118. Дои:10.1038 / nrg995. ISSN  1471-0056. PMID  12560808.

дальнейшее чтение