APPL1 - APPL1

APPL1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2EJ8, 2ELA, 2ELB, 2К12, 2К13, 2Z0N, 2Z0O, 5C5B
Идентификаторы
Псевдонимы	APPL1, APPL, DIP13alpha, MODY14, адаптерный белок, фосфотирозин, взаимодействующий с доменом PH и лейциновой застежкой-молнией 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604299 MGI: 1920243 ГомолоГен: 32143 Генные карты: APPL1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 3 (человек)
Конец	57,278,105 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 14 (мышь)
Конец	26,971,232 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание протеинкиназы B; • GO: 0001948 связывание с белками; • идентичное связывание с белками; • связывание фосфатидилсерина; • связывание фосфатидилинозита; • активность гомодимеризации белков; • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса; • связывание бета-тубулина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • NuRD комплекс; • цитозоль; • эндосома; • мембрана ранней эндосомы; • мембрана; • мембрана везикул; • эндосомная мембрана; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • ранняя эндосома; • взъерошить; • клеточная мембрана; • цитоплазматический пузырек; • ранняя фагосома; • макропиносома; • внутриклеточный пузырек; • проекция клетки; • фагоцитарный пузырек;
Биологический процесс	• регулирование импорта глюкозы; • внешний апоптотический сигнальный путь в отсутствие лиганда; • клеточный цикл; • клеточная пролиферация; • преобразование сигнала; • сигнальный путь рецептора инсулина; • регулирование локализации белка на плазматической мембране; • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста; • регуляция миграции фибробластов; • сигнализация; • сигнальный путь, активируемый адипонектином; • регуляция сигнального пути толл-подобного рецептора 4; • клеточный ответ на стимул фактора роста гепатоцитов; • регуляция врожденного иммунного ответа; • положительное регулирование импорта глюкозы; • положительная регуляция процесса биосинтеза меланина; • положительное регулирование выработки цитокинов, участвующих в воспалительной реакции; • положительная регуляция макропиноцитоза; • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора Fc-гамма, вовлеченного в фагоцитоз; • импорт белка в ядро;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	26060
	72993
	ENSG00000157500
	ENSMUSG00000040760
	Q9UKG1
	Q8K3H0
	NM_012096
	NM_145221
	NP_036228
	NP_660256
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Адаптерный белок, фосфотирозин, взаимодействующий с доменом PH и лейциновой застежкой-молнией 1 (APPL1), или DCC-взаимодействующий белок 13-альфа (DIP13alpha), представляет собой белок что у людей кодируется APPL1 ген.^[5]^[6]^[7] APPL1 содержит несколько ключевых доменов взаимодействия: домен гомологии плекстрина (PH), фосфотирозин-связывающий (PTB) домен и Бин – Амфифизин – Рвс (BAR) домен.^[8]

Функция

APPL1 - это адаптерный белок локализован для подмножества Rab5 -положительный («ранний») эндосомы, где он привлекает других связывающих партнеров и регулирует торговля пузырьками и эндосомный сигнализация. APPL1 обогащен в очень ранних эндосомах, которые отрицательны по EEA1, указывая на то, что APPL1 влияет на самые ранние стадии эндосомного трафика до того, как EEA1 вступает во владение. Это согласуется с наблюдениями, что APPL1 и EEA1 конкурируют за связывание Rab5. APPL1 влияет на скорость интернализации ключевого эндосомального груза (например, Рецептор EGF ), который зависит от активации Rab5.^[8]

Домен PTB APPL1 регулирует многие события передачи сигналов клетками в определенных эндосомных компартментах, иногда называемых «сигнальными эндосомами». Это включает в себя лизофосфатидная кислота (LPA) -индуцированная передача сигналов (вместе с взаимодействующим белком GIPC1 ). Дополнительные роли для APPL1 были определены в ядро где APPL1 может локализоваться после диссоциации от эндосом.^[8]

Мутантные исследования

Мутантные аллели мыши для Appl1
Символ-маркер для гена мыши. Этот символ присваивается геномному локусу MGI	Appl1
Клоны эмбриональных стволовых клеток мутантных мышей. Это известные целевые мутации этого гена у мыши.	Appl1^{tm1a (КОМП) Wtsi}
Пример структуры целевого условного мутантного аллеля для этого гена

Эти мутантные ES-клетки можно изучать напрямую или использовать для получения мышей с отключенным геном. Изучение этих мышей может пролить свет на функцию Appl1: видеть Нокаутирующая мышь

Взаимодействия

APPL1 был показан взаимодействовать с Удалено при колоректальном раке,^[9] AKT2,^[5] но также Rab5, Rab21, OCRL и почти 30 других белков.^[8]

дальнейшее чтение

Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК исследования. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.
Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О. (февраль 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID 10718198.
Лю Дж, Яо Ф, Ву Р., Морган М., Торберн А., Финли Р.Л., Чен Ю.К. (июль 2002 г.). «Посредничество апоптотического сигнала DCC посредством DIP13 альфа». Журнал биологической химии. 277 (29): 26281–5. Дои:10.1074 / jbc.M204679200. PMID 12011067.
Ян Л., Линь Х. К., Алтувайджри С., Се С., Ван Л., Чанг С. (май 2003 г.). «APPL подавляет трансактивацию рецепторов андрогенов за счет усиления активности Akt». Журнал биологической химии. 278 (19): 16820–7. Дои:10.1074 / jbc.M213163200. PMID 12621049.
Мячинская М., Христофоридис С., Гинер А., Шевченко А., Уттенвейлер-Йозеф С., Хаберманн Б., Вильм М., Партон Р. Г., Зериал М. (февраль 2004 г.). «Белки APPL связывают Rab5 с передачей ядерного сигнала через эндосомный компартмент». Клетка. 116 (3): 445–56. Дои:10.1016 / S0092-8674 (04) 00117-5. PMID 15016378. S2CID 18281503.
Nechamen CA, Thomas RM, Cohen BD, Acevedo G, Poulikakos PI, Testa JR, Dias JA (август 2004 г.). «Рецептор человеческого фолликулостимулирующего гормона (ФСГ) взаимодействует с адаптерным белком APPL1 в клетках HEK 293: потенциальное участие пути PI3K в передаче сигналов ФСГ». Биология размножения. 71 (2): 629–36. Дои:10.1095 / биолрепрод.103.025833. PMID 15070827.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А., Шварц Д., Гиги С.П. (ноябрь 2004 г.). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Молекулярная и клеточная протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Мао X, Кикани С.К., Риохас Р.А., Ланглейс П., Ван Л., Рамос Ф.Дж., Фанг К., Крист-Робертс С.Й., Хонг Дж.Й., Ким Р.Й., Лю Ф., Донг Л.К. (май 2006 г.) «APPL1 связывается с рецепторами адипонектина и опосредует передачу сигналов и функцию адипонектина». Природа клеточной биологии. 8 (5): 516–23. Дои:10.1038 / ncb1404. PMID 16622416. S2CID 21273764.
Cheng KK, Lam KS, Wang Y, Huang Y, Carling D, Wu D, Wong C, Xu A (май 2007 г.). «Адипонектин-индуцированная активация эндотелиальной синтазы оксида азота и выработка оксида азота опосредуются APPL1 в эндотелиальных клетках». Сахарный диабет. 56 (5): 1387–94. Дои:10.2337 / db06-1580. PMID 17287464.
Ли Дж, Мао Х, Донг Л.К., Лю Ф., Тонг Л. (май 2007 г.). «Кристаллические структуры доменов BAR-PH и PTB человеческого APPL1». Структура. 15 (5): 525–33. Дои:10.1016 / j.str.2007.03.011. PMID 17502098.
Zhu G, Chen J, Liu J, Brunzelle JS, Huang B, Wakeham N, Terzyan S, Li X, Rao Z, Li G, Zhang XC (июль 2007 г.). «Структура BAR-PH домена APPL1 и характеристика его взаимодействия с Rab5». Журнал EMBO. 26 (14): 3484–93. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601771. ЧВК 1933402. PMID 17581628.
Сайто Т., Джонс С.К., Хуанг С., член парламента Чехии, Пилч П.Ф. (ноябрь 2007 г.). «Взаимодействие Akt с APPL1 необходимо для инсулино-стимулированной транслокации Glut4». Журнал биологической химии. 282 (44): 32280–7. Дои:10.1074 / jbc.M704150200. PMID 17848569.

внешняя ссылка

Человек APPL1 расположение генома и APPL1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 3 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157500 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040760 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10490823-5] а ^б Мицуучи Ю., Джонсон С.В., Сонода Г., Танно С., Големис Е.А., Теста Дж. Р. (сентябрь 1999 г.). «Идентификация гена хромосомы 3p14.3-21.1, APPL, кодирующего адаптерную молекулу, которая взаимодействует с онкопротеин-серин / треонинкиназой AKT2». Онкоген. 18 (35): 4891–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1203080. PMID 10490823.

[pmid17030088-6] Nechamen CA, Thomas RM, Dias JA (январь 2007 г.). «APPL1, APPL2, Akt2 и FOXO1a взаимодействуют с FSHR в потенциальном сигнальном комплексе». Молекулярная и клеточная эндокринология. 260-262: 93–9. Дои:10.1016 / j.mce.2006.08.014. ЧВК 1782224. PMID 17030088.

[entrez-7] «Ген Entrez: адаптерный белок APPL1, взаимодействие фосфотирозина, домен PH и лейциновая молния, содержащая 1».

[Diggins_2017-8] а ^б ^c ^d Diggins NL, Webb DJ (июнь 2017 г.). «APPL1 - это многофункциональный эндосомный сигнальный адаптерный белок». Сделки Биохимического Общества. 45 (3): 771–779. Дои:10.1042 / bst20160191. ЧВК 5844352. PMID 28620038.

[pmid12011067-9] Лю Дж, Яо Ф, Ву Р., Морган М., Торберн А., Финли Р.Л., Чен Ю.К. (июль 2002 г.). «Посредничество апоптотического сигнала DCC посредством DIP13 альфа». Журнал биологической химии. 277 (29): 26281–5. Дои:10.1074 / jbc.M204679200. PMID 12011067.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]