ARHGAP5 - ARHGAP5

ARHGAP5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2EE4, 2EE5
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP5, GFI2, RhoGAP5, p190-B, p190BRhoGAP, Rho GTPase, активирующий белок 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602680 MGI: 1332637 ГомолоГен: 907 Генные карты: ARHGAP5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 14 (человек)
Конец	32,159,728 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 12 (мышь)
Конец	52,571,975 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание GTP; • Привязка домена SH2; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase; • ГТФазная активность;
Сотовый компонент	• эндоплазматический ретикулум; • мембрана; • цитоплазма; • цитозоль; • клеточная мембрана;
Биологический процесс	• клеточная адгезия; • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase; • Передача сигнала белка Rho; • преобразование сигнала; • развитие молочной железы; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	394
	11855
	ENSG00000100852
	ENSMUSG00000035133
	Q13017
	P97393
	NM_001030055; NM_001173
	NM_009706
	NP_001025226; NP_001164
	NP_033836
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Rho GTPase-активирующий белок 5 является фермент что у людей кодируется ARHGAP5 ген.^[5]^[6]

Функция

Белок 5, активирующий RHO GTPase, негативно регулирует RHO GTPases, семейство, которое может опосредовать изменения цитоскелета, стимулируя гидролиз связанного GTP. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

ARHGAP5 показал взаимодействовать с участием Rnd1,^[7] Rnd2,^[7] Rnd3^[7] и RHOA.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100852 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035133 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Бурбело П.Д., Миямото С., Утани А., Брилл С., Ямада К.М., Холл А, Ямада Y (1995). «p190-B, новый член семейства Rho GAP, и Rho индуцируются для кластеризации после перекрестного связывания интегрина». J. Biol. Chem. 270 (52): 30919–26. Дои:10.1074 / jbc.270.52.30919. PMID 8537347.
^ ^а ^б «Ген Entrez: белок 5, активирующий ГТФазу ARHGAP5 Rho».
^ ^а ^б ^c ^d Веннерберг К., Забудьте М.А., Эллербрук С.М., Артур В.Т., Берридж К., Сеттлман Дж., Дер Си-Джей, Хансен С.Х. (июль 2003 г.). «Белки Rnd действуют как антагонисты RhoA, активируя p190 RhoGAP». Curr. Биол. 13 (13): 1106–15. Дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. ЧВК 6918695. PMID 12842009.

внешние ссылки

Человек ARHGAP5 расположение генома и ARHGAP5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Эллис С., Моран М., Маккормик Ф, Поусон Т. (1990). «Фосфорилирование GAP и GAP-ассоциированных белков трансформирующими и митогенными тирозинкиназами». Природа. 343 (6256): 377–81. Дои:10.1038 / 343377a0. HDL:1807/9436. PMID 1689011.
Фостер Р., Ху KQ, Шайвиц Д.А., Сеттлман Дж. (1994). «p190 RhoGAP, основной белок, ассоциированный с RasGAP, напрямую связывает GTP». Мол. Cell. Биол. 14 (11): 7173–81. Дои:10.1128 / mcb.14.11.7173. ЧВК 359251. PMID 7935432.
МакГлэйд Дж., Бранкхорст Б., Андерсон Д., Мбамалу Дж., Сеттлман Дж., Дедхар С., Розакис-Адкок М., Чен Л. Б., Поусон Т. (1993). «N-концевая область GAP регулирует структуру цитоскелета и клеточную адгезию». EMBO J. 12 (8): 3073–81. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05976.x. ЧВК 413572. PMID 8344248.
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Зрихан-Лихт С., Фу И., Сеттлман Дж., Шинкманн К., Шоу Л., Кейдар И., Авраам С., Авраам Х. (2000). «Тирозинкиназа RAFTK / Pyk2 опосредует ассоциацию p190 RhoGAP с RasGAP и участвует в инвазии клеток рака груди». Онкоген. 19 (10): 1318–28. Дои:10.1038 / sj.onc.1203422. PMID 10713673.
Кулькарни С.В., Гиш Г., ван дер Гир П., Хенкемейер М., Поусон Т. (2000). «Роль p120 Ras-GAP в направленном движении клеток». J. Cell Biol. 149 (2): 457–70. Дои:10.1083 / jcb.149.2.457. ЧВК 2175152. PMID 10769036.
Чакраварти Г., Рой Д., Гонсалес М., Гей Дж., Контрерас А., Розен Дж. М. (2000). «P190-B, белок, активирующий Rho-GTPase, по-разному экспрессируется в концевых зачатках и раке груди». Рост клеток отличается. 11 (7): 343–54. PMID 10939588.
Шиота М., Танихиро Т., Накагава И., Аоки Н., Исида Н., Миядзаки К., Ульрих А., Миядзаки Н. (2003). «Белковая тирозинфосфатаза PTP20 индуцирует реорганизацию актинового цитоскелета путем дефосфорилирования p190 RhoGAP в клетках гранулезы яичников крыс, стимулированных фолликулостимулирующим гормоном». Мол. Эндокринол. 17 (4): 534–49. Дои:10.1210 / me.2002-0187. PMID 12554790.
Веннерберг К., Забудьте М.А., Эллербрук С.М., Артур В.Т., Берридж К., Сеттлман Дж., Дер С.Дж., Хансен С.Х. (2003). «Белки Rnd действуют как антагонисты RhoA, активируя p190 RhoGAP». Curr. Биол. 13 (13): 1106–15. Дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. ЧВК 6918695. PMID 12842009.
Су Л., Агати Дж. М., Парсонс С. Дж. (2003). «p190RhoGAP регулируется клеточным циклом и влияет на цитокинез». J. Cell Biol. 163 (3): 571–82. Дои:10.1083 / jcb.200308007. ЧВК 2173658. PMID 14610059.
Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК 442148. PMID 15231748.
Бланшето С., Шаньон М., Дюбе Н., Халле М., Трембле М.Л. (2005). «Методы захвата субстрата при идентификации клеточных мишеней PTP». Методы. 35 (1): 44–53. Дои:10.1016 / j.ymeth.2004.07.007. PMID 15588985.
Варго-Гогола Т., Хекман Б.М., Гюнтер Э.Дж., Ходош Л.А., Розен Дж.М. (2006). «Сверхэкспрессия белка, активирующего ГТФазу P190-B Rho, нарушает морфогенез протоков и вызывает гиперпластические поражения в развивающейся молочной железе». Мол. Эндокринол. 20 (6): 1391–405. Дои:10.1210 / me.2005-0426. PMID 16469769.
Жан X, Desiderio DM (2006). «Нитропротеины из ткани аденомы гипофиза человека обнаружены с помощью нитротирозиновой аффинной колонки и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Биохим. 354 (2): 279–89. Дои:10.1016 / j.ab.2006.05.024. PMID 16777052.

Эта статья о ген на хромосома человека 14 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100852 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035133 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8537347-5] Бурбело П.Д., Миямото С., Утани А., Брилл С., Ямада К.М., Холл А, Ямада Y (1995). «p190-B, новый член семейства Rho GAP, и Rho индуцируются для кластеризации после перекрестного связывания интегрина». J. Biol. Chem. 270 (52): 30919–26. Дои:10.1074 / jbc.270.52.30919. PMID 8537347.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: белок 5, активирующий ГТФазу ARHGAP5 Rho».

[pmid12842009-7] а ^б ^c ^d Веннерберг К., Забудьте М.А., Эллербрук С.М., Артур В.Т., Берридж К., Сеттлман Дж., Дер Си-Джей, Хансен С.Х. (июль 2003 г.). «Белки Rnd действуют как антагонисты RhoA, активируя p190 RhoGAP». Curr. Биол. 13 (13): 1106–15. Дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00418-4. ЧВК 6918695. PMID 12842009.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]