Актино-pnp РНК-мотив - Actino-pnp RNA motif

Актино-pnp РНК
Актино-пнп-РНК.svg
Консенсусная вторичная структура актино-pnp РНК
Идентификаторы
СимволАктино-пнп
РфамRF01688
Прочие данные
Домен (ы)Бактерии
ТАК0005836
PDB структурыPDBe

В Актино-pnp Мотив РНК консервативная структура, обнаруженная в актинобактерии это очевидно в 5 'непереведенные регионы из гены предсказано кодировать экзорибонуклеазы.[1] Функция элемента РНК, вероятно, аналогична структуре РНК, обнаруженной перед генами полинуклеотидфосфорилазы в Кишечная палочка и связанные энтеробактерии.[2] В этой последней системе ген полинуклеотидфосфорилазы регулирует свои собственные уровни экспрессии с помощью механизма обратной связи, который включает его активность в структуре РНК. Однако Кишечная палочка РНК, по-видимому, структурно не связана с актино-pnp мотив.

использованная литература

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж, Ян Дж., Корбино К., Мой Р. Х., Брейкер Р. Р. (2010). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геномная биология. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Джарридж А.С., Мэти Н., Портье С. (декабрь 2001 г.). «PNPase автоматически контролирует свою экспрессию, разрушая двухцепочечную структуру в лидере мРНК pnp». Журнал EMBO. 20 (23): 6845–6855. Дои:10.1093 / emboj / 20.23.6845. ЧВК  125756. PMID  11726520.

внешние ссылки