BTF3 - BTF3

BTF3
Белок NACA PDB 3LKX.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыBTF3, BETA-NAC, BTF3a, BTF3b, NACB, основной фактор транскрипции 3
Внешние идентификаторыOMIM: 602542 MGI: 1202875 ГомолоГен: 37453 Генные карты: BTF3
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение BTF3
Геномное расположение BTF3
Группа5q13.2Начинать73,498,408 бп[1]
Конец73,505,635 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001207
NM_001037637

NM_001170540
NM_145455

RefSeq (белок)

NP_001032726
NP_001198

NP_001164011
NP_663430

Расположение (UCSC)Chr 5: 73,5 - 73,51 МбChr 13: 98.31 - 98.32 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции BTF3 это белок что у людей кодируется BTF3 ген.[5][6][7][8]

Функция

Этот ген кодирует основной фактор транскрипции 3. Этот белок образует стабильный комплекс с РНК-полимеразой IIB и необходим для инициации транскрипции. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. Этот ген имеет несколько псевдогенов.[8]

Взаимодействия

BTF3 был показан взаимодействовать с CSNK2B.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145741 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021660 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Чжэн XM, Black D, Chambon P, Egly JM (май 1990 г.). «Секвенирование и экспрессия комплементарной ДНК для общего фактора транскрипции BTF3». Природа. 344 (6266): 556–9. Дои:10.1038 / 344556a0. PMID  2320128. S2CID  4227320.
  6. ^ Канно М., Чалут С., Эгли Дж. М. (сентябрь 1992 г.). «Геномная структура предполагаемого фактора транскрипции BTF3». Ген. 117 (2): 219–28. Дои:10.1016/0378-1119(92)90732-5. PMID  1386332.
  7. ^ Freire MA (апрель 2005 г.). «Фактор инициации трансляции (iso) 4E взаимодействует с BTF3, бета-субъединицей растущего комплекса, ассоциированного с полипептидом». Ген. 345 (2): 271–7. Дои:10.1016 / j.gene.2004.11.030. PMID  15716105.
  8. ^ а б «Ген Entrez: основной фактор транскрипции BTF3 3».
  9. ^ Grein S, Pyerin W (январь 1999 г.). «BTF3 - потенциальный новый субстрат протеинкиназы CK2». Мол. Клетка. Биохим. 191 (1–2): 121–8. Дои:10.1023 / А: 1006806226764. PMID  10094400. S2CID  1057554.

внешняя ссылка

  • Человек BTF3 расположение генома и BTF3 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого фактора транскрипции BTF3

дальнейшее чтение

  • Видманн Б., Сакаи Н., Дэвис Т.А., Видманн М. (1994). «Белковый комплекс, необходимый для сортировки и транслокации, специфичных для сигнальной последовательности». Природа. 370 (6489): 434–40. Дои:10.1038 / 370434a0. PMID  8047162. S2CID  4353902.
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Грейн С., Пирин В. (1999). «BTF3 - потенциальный новый субстрат протеинкиназы CK2». Мол. Клетка. Биохим. 191 (1–2): 121–8. Дои:10.1023 / А: 1006806226764. PMID  10094400. S2CID  1057554.
  • Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С., Джексон П. Д., Перри Р., Каин С., Левенталь К., Торнтон М., Рамачандран Р., Уиттингтон Дж., Лернер Л., Костанцо Д., Макэллиготт К., Бузер С., Мэйс Р., Смит Е., Велозо Н. , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Nat. Биотехнология. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
  • Kusumawidjaja G, Kayed H, Giese N, Bauer A, Erkan M, Giese T, Hoheise JD, Friess H, Kleeff J (2007). «Основной фактор транскрипции 3 (BTF3) регулирует транскрипцию связанных с опухолью генов в раковых клетках поджелудочной железы». Cancer Biol. Ther. 6 (3): 367–76. CiteSeerX  10.1.1.410.5257. Дои:10.4161 / cbt.6.3.3704. PMID  17312387. S2CID  9044882.
  • Саймс А.Дж., Эйлерцен М., Миллар М., Нарикулам Дж., Фриман А., Нотара М., Фенели М.Р., Пател Х.Р., Пател Х.Р., Мастерс Дж.Р., Ахмед А. (2013). «Количественный анализ избыточной экспрессии белков BTF3, HINT1, NDRG1 и ODC1 в ткани рака предстательной железы человека». PLOS ONE. 8 (12): e84295. Дои:10.1371 / journal.pone.0084295. ЧВК  3874000. PMID  24386364.