Bacteroides caccae - Bacteroides caccae

Bacteroides caccae
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Bacteroidetes
Учебный класс:
Бактероидии
Заказ:
Bacteroidales
Семья:
Бактероидные
Род:
Бактероиды
Разновидность:
B. caccae
Биномиальное имя
Bacteroides caccae

Bacteroides caccae сахаролитик грамотрицательная бактерия из рода Бактероиды.[1][2] Они обязательны анаэробы впервые изолирован от человеческие фекалии в 1980-е гг. До своего открытия они были известны как 3452A. Гомология ДНК группа. Типовой штамм теперь обозначен как ATCC 43185.[3]

Морфология и физиология клеток

Bacteroides caccae сахаролитические анаэробные неподвижные грамотрицательные бактерии. Содержание ДНК в них составляет 40-46 мол.%. Рост происходит при температуре человека (37 ° C) в анаэробных условиях. Рост отсутствует при 25 ° C или 45 ° C. Его клетки представляют собой стержни размером 1,4–1,6 на 2,5–12 мкм.[4] Палочки находятся в одиночных ячейках или парах. В бульонной культуре, смешанной с ферментируемым углеводом, клетки будут казаться вакуолизированными или зернистыми. Поверхностные колонии клеток, выращенных на чашках с кровяным агаром BHI после 48 часов инкубации, показывают круглые клетки диаметром 0,5–1 мм. Кроме того, колонии выпуклые, серые, полупрозрачные, блестящие и гладкие.[4] Рост крови кролика показывает небольшой гемолиз. В глюкозном бульоне культуры кажутся мутными с гладким осадком и конечным диапазоном pH 5-5,2.

Типовой штамм восстанавливает нейтральный красный цвет, но не производит сероводород. Рост на культурах пептон-дрожжевой экстракт-глюкозный бульон с 20% желчи дает большое количество ацетата и сукцината, но незначительные количества пропионата и изовалерата. Типовой штамм не использует лактат и треонин. B. caccae производит следовое количество (0,1%) водорода. Они гидролизуют эскулин, плохо усваивают желатин, чувствительны к хлорамфениколу и клиндамицину, но не чувствительны к пенициллину G и тетрациклину.

Патогенность

Для начала кишечный кишечник заболевания (ВЗК), такие как болезнь Крона (CD) или Язвенный колит (UC), в качестве патогенного фактора обычно требуются комменсальные кишечные бактерии. B. caccae содержит белок внешней мембраны, связанный с TonB, называемый OmpW, который был охарактеризован только в этом конкретном штамме.[5] Белок OmpW содержит свойства, аналогичные бактериальному TonB-связанному белку внешней мембраны, который позволяет бактериям увеличивать свою способность усваивать железо или витамины в среде, в которой отсутствуют эти переменные. TonB-связанный белок внешней мембраны содержит TonB-бокс, который является высококонсервативным и также присутствует в OmpW.[5] OmpW может играть роль в облегчении способности организма поглощать субстраты, которые важны для выживания комменсальных бактерий в кишечнике. Иммунологический результат OmpW заключается в повышении уровней IgA к OmpW у некоторых пациентов с болезнью Крона по сравнению с этими уровнями IgA у пациентов с язвенным колитом или здоровых субъектов.[5] Еще предстоит выяснить его потенциальную патогенность в отношении OmpW. Кроме того, B. caccae также был обнаружен в культурах от инфекций в аппендиксе и брюшной полости (брюшной полости). [6]

Метаболизм

Bacteroides caccae был определен как специалист по микробам, разлагающим клетчатку, в микробиомах западных людей.[7] В исследовании, направленном на определение ферментации пектина в B. caccae из слепой кишки кролика было определено, что культуры, выращенные с пектином, продуцировали больше ацетата, чем формиат, лактат, фумарат и сукцинат, в отличие от культур, выращенных на глюкозе, которые давали огромное количество лактата.[8] Это объясняет метаболизм растительного волокна комменсалом человека. Кроме того, B. caccae не показали роста на арабинане (пектин), арабиноксилане (пшеница), ксилане, ксилоглюкане, глюкоманнане, галактоманнане, B-глюкане, лихенине и ламинарине.[9] Они действительно растут на гликанах, происходящих от хозяина, таких как нейтральный O-гликаны муцина, хондроитинсульфат и гиалуроновая кислота. Моносахариды, индуцирующие рост, - это арабиноза, фруктоза, фукоза, галактоза, галактуроновая кислота, глюкоза, глюкуроновая кислота, глюкозамин, манноза, N-ацетилгалактозамин, N-ацетилглюкозамин, N-ацетилнейраминовая кислота, рамноза, рибоза и ксилоза.[9]

Рекомендации

  1. ^ "Bacteroides caccae". www.ncbi.nlm.nih.gov. Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США. Получено 2020-01-08.
  2. ^ Олдридж, Кеннет Э. (1 августа 1993 г.). «Чувствительность к противомикробным препаратам относительно редко встречающихся изолятов группы Bacteroides fragilis: Bacteroides uniformis, bacteroides caccae и Bacteroides eggerthii». Текущие терапевтические исследования. ScienceDirect. 54 (2): 208–213. Дои:10.1016 / S0011-393X (05) 80603-4.
  3. ^ "Bacteroides caccae Johnson et al. ATCC ® 43185 ™". www.atcc.org.
  4. ^ а б Джонсон, Джон Л .; Moore, W. E. C .; Мур, Лилиан В. Х. (1986). «Bacteroides caccae sp. Nov., Bacteroides merdae sp. Nov. И Bacteroides stercoris sp. Nov., Выделенные из фекалий человека» (PDF). Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 36 (4): 499–501. Дои:10.1099/00207713-36-4-499. ISSN  1466-5026.
  5. ^ а б c Вэй, Бо; Далвади, Харниша; Гордон, Линн К .; Ландерс, Кэрол; Брукнер, Дэвид; Targan, Stephan R .; Браун, Джонатан (октябрь 2001 г.). «Молекулярное клонирование белка внешней мембраны Bacteroides caccae, связанного с TonB, идентифицированного маркером-антителом к ​​воспалительному заболеванию кишечника». Инфекция и иммунитет. 69 (10): 6044–6054. Дои:10.1128 / IAI.69.10.6044-6054.2001. ISSN  0019-9567. ЧВК  98733. PMID  11553542.
  6. ^ Векслер, Ханна М. (октябрь 2007 г.). "Bacteroides: хорошее, плохое и непритязательное". Обзоры клинической микробиологии. 20 (4): 593–621. Дои:10.1128 / CMR.00008-07. ISSN  0893-8512. ЧВК  2176045. PMID  17934076.
  7. ^ Магнусдоттир, Стефания; Хейнкен, Альмут; Катт, Лаура; Равчеев Дмитрий А .; Бауэр, Ойген; Норонья, Альберто; Гринхал, Кейси; Егер, Кристиан; Багинская, Иоанна; Уилмс, Пол; Флеминг, Ронан М. Т .; Тиле, Инес (январь 2017 г.). «Создание метаболических реконструкций в масштабе генома для 773 членов кишечной микробиоты человека». Природа Биотехнологии. 35 (1): 81–89. Дои:10.1038 / nbt.3703. ISSN  1546-1696. PMID  27893703.
  8. ^ Сиротек, К .; Slováková, L .; Kopečný, J .; Марунек, М. (2004). «Ферментация пектина и глюкозы и активность пектин-разлагающих ферментов в бактерии слепой кишки кролика Bacteroides caccae». Письма по прикладной микробиологии. 38 (4): 327–332. Дои:10.1111 / j.1472-765X.2004.01492.x. ISSN  1472-765X. PMID  15214734.
  9. ^ а б Макналти, Натан П .; Ву, Мэн; Эриксон, Элисон Р .; Пан, Чонгл; Эриксон, Брайан К .; Мартенс, Эрик С .; Пудло, Николас А .; Muegge, Brian D .; Хенриссат, Бернар; Hettich, Robert L .; Гордон, Джеффри И. (20 августа 2013 г.). «Влияние диеты на использование ресурсов модельной кишечной микробиотой человека, содержащей Bacteroides cellulosilyticus WH2, симбионт с обширным гликобиомом». PLOS Биология. 11 (8): e1001637. Дои:10.1371 / journal.pbio.1001637. ISSN  1545-7885. ЧВК  3747994. PMID  23976882.