CPSF6 - CPSF6
Субъединица 6 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования это белок что у людей кодируется CPSF6 ген.[5][6][7]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу фактора расщепления, необходимого для расщепления 3'-РНК и процессинга полиаденилирования. Взаимодействие белка с РНК является одной из самых ранних стадий сборки 3'-концевого процессингового комплекса и способствует привлечению других факторов процессинга. Комплекс фактора расщепления состоит из четырех полипептидов. Этот ген кодирует субъединицу 68 кДа. Он имеет доменную организацию, напоминающую сплайсосомные белки.[7]
Взаимодействия
CPSF6 показал себя взаимодействовать с WWP1[8] и PLSCR1.[8]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111605 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055531 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Rüegsegger U, Blank D, Keller W (январь 1998 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК человека Im связан со сплайсосомными белками SR и может быть восстановлен in vitro из рекомбинантных субъединиц». Молекулярная клетка. 1 (2): 243–53. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80025-8. PMID 9659921.
- ^ Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (апрель 2007 г.). «Субъядерная локализация и динамика субъединицы 68 кДа фактора расщепления 3 'конца пре-мРНК фактора I расщепления фактора I». Молекулярная биология клетки. 18 (4): 1282–92. Дои:10.1091 / mbc.E06-09-0846. ЧВК 1838998. PMID 17267687.
- ^ а б «Ген Entrez: фактор, специфичный для расщепления CPSF6 и полиаденилирования 6, 68 кДа».
- ^ а б Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
внешняя ссылка
- Человек CPSF6 расположение генома и CPSF6 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (март 1996 г.). «Очистка и характеристика человеческого фактора расщепления Im, участвующего в процессинге 3'-конца предшественников матричной РНК». Журнал биологической химии. 271 (11): 6107–13. Дои:10.1074 / jbc.271.11.6107. PMID 8626397.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W., Friedlein A, Langen H, Keller W. (ноябрь 2000 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК человека II (m) содержит гомологи дрожжевых белков и связывает два других фактора расщепления». Журнал EMBO. 19 (21): 5895–904. Дои:10.1093 / emboj / 19.21.5895. ЧВК 305781. PMID 11060040.
- Awasthi S, Alwine JC (ноябрь 2003 г.). «Ассоциация фактора расщепления I полиаденилирования с U1 snRNP». РНК. 9 (11): 1400–9. Дои:10.1261 / rna.5104603. ЧВК 1287061. PMID 14561889.
- Браун К.М., Гилмартин GM (декабрь 2003 г.). «Механизм регуляции процессинга пре-мРНК 3 'фактором расщепления человека Im». Молекулярная клетка. 12 (6): 1467–76. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00453-2. PMID 14690600.
- Деттвайлер С., Арингиери С., Кардинале С., Келлер В., Барабино С.М. (август 2004 г.). «Отчетливые мотивы последовательности в субъединице 68 кДа фактора расщепления Im опосредуют связывание РНК, межбелковые взаимодействия и субклеточную локализацию» (PDF). Журнал биологической химии. 279 (34): 35788–97. Дои:10.1074 / jbc.M403927200. PMID 15169763. S2CID 39752996.
- Венкатараман К., Браун К.М., Гилмартин Г.М. (июнь 2005 г.). «Анализ неканонического поли (А) сайта показывает трехчастный механизм распознавания поли (А) сайта позвоночных». Гены и развитие. 19 (11): 1315–27. Дои:10.1101 / gad.1298605. ЧВК 1142555. PMID 15937220.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Миллевой С., Лулерг С., Деттвайлер С., Караа С.З., Келлер В., Антониу М., Вагнер С. (октябрь 2006 г.). «Взаимодействие между U2AF 65 и CF I (m) связывает оборудование для сварки и обработки концов 3 '». Журнал EMBO. 25 (20): 4854–64. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601331. ЧВК 1618107. PMID 17024186.
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 12 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |