CTTNBP2 - CTTNBP2

CTTNBP2
Идентификаторы
ПсевдонимыCTTNBP2, C7orf8, CORTBP2, Orf4, белок, связывающий кортактин 2
Внешние идентификаторыOMIM: 609772 MGI: 1353467 ГомолоГен: 14125 Генные карты: CTTNBP2
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение CTTNBP2
Геномное расположение CTTNBP2
Группа7q31.31Начинать117,710,651 бп[1]
Конец117,874,139 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CTTNBP2 gnf1h06054 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_033427
NM_001363349
NM_001363350
NM_001363351

NM_080285

RefSeq (белок)

NP_219499
NP_001350278
NP_001350279
NP_001350280

NP_525024

Расположение (UCSC)Chr 7: 117,71 - 117,87 МбChr 6: 18.37 - 18.51 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кортактин-связывающий белок 2 это белок что у людей кодируется CTTNBP2 ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок с шестью анкириновыми повторами и несколькими богатыми пролином участками. Подобный ген у крысы взаимодействует с центральным регулятором актинового цитоскелета.[6]

Взаимодействия

CTTNBP2 был показан взаимодействовать с:

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции CTTNBP2. Условный нокаутирующая мышь линия называется Cttnbp2tm1b (КОМП) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[8] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[9] для определения последствий удаления.[10][11][12][13] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[14]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077063 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000416 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Cheung J, Petek E, Nakabayashi K, Tsui LC, Vincent JB, Scherer SW (ноябрь 2001 г.). «Идентификация гена человеческого кортактин-связывающего белка-2 из области-кандидата аутизма на 7q31». Геномика. 78 (1–2): 7–11. Дои:10.1006 / geno.2001.6651. PMID  11707066.
  6. ^ а б «Ген Entrez: CTTNBP2 cortactin-связывающий белок 2».
  7. ^ а б c d е Гудро М., Д'Амброзио Л.М., Кин М.Дж., Маллин М.Дж., Ларсен Б.Г., Санчес А., Чаудри С., Чен Г.И., Сичери Ф., Несвижский А.И., Эберсолд Р., Рот Б., Гинграс А.С. (январь 2009 г.). «Сеть взаимодействия с высокой плотностью фосфатазы PP2A идентифицирует новый комплекс фосфатазы и киназы, взаимодействующий со стриатином, связанный с белком кавернозной мальформации 3 головного мозга (CCM3)». Мол. Клетка. Протеомика. 8 (1): 157–71. Дои:10.1074 / mcp.M800266-MCP200. ЧВК  2621004. PMID  18782753.
  8. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  10. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  11. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  12. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  13. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  14. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

внешняя ссылка

дальнейшее чтение