CUL5 - CUL5

CUL5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3DPL, 3DQV, 4JGH, 4Н9Ф
Идентификаторы
Псевдонимы	CUL5, VACM-1, VACM1, cullin 5, CUL-5
Внешние идентификаторы	OMIM: 601741 MGI: 1922967 ГомолоГен: 2597 Генные карты: CUL5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	108,107,761 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	53,670,014 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • связывание убиквитин-протеин-лигазы; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы; • активность кальциевых каналов; • активность убиквитин-протеинтрансферазы; • сигнальная активность рецептора;
Сотовый компонент	• cullin-RING убиквитинлигазный комплекс; • цитозоль; • Cul5-RING убиквитинлигазный комплекс; • Cul4-RING E3 убиквитин-лигазный комплекс; • SCF убиквитин-лигазный комплекс;
Биологический процесс	• внутренний апоптотический сигнальный путь; • клеточная пролиферация; • остановка клеточного цикла; • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • отрицательное регулирование пролиферации клеток; • убиквитинирование белков; • GO: 0022415 вирусный процесс; • Путь передачи сигналов ERBB2; • трансмембранный транспорт ионов кальция; • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК; • посттрансляционная модификация; • G1 / S переход митотического клеточного цикла; • SCF-зависимый протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс; • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8065
	75717
	ENSG00000166266
	ENSMUSG00000032030
	Q93034
	Q9D5V5
	NM_003478
	NM_001161618; NM_027807
	NP_003469
	NP_001155090; NP_082083
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Каллин-5 это белок что у людей кодируется CUL5 ген.^[5]^[6]^[7]

Открытие

Продукт гена млекопитающих был первоначально открыт клонирование выражения, благодаря способности белка мобилизовать внутриклеточный кальций в ответ на пептидный гормон аргинин вазопрессин. Сначала он был назван VACM-1, что означает активируемый вазопрессином кальций-мобилизующий рецептор.^[8] С тех пор было показано, что VACM-1 гомологичен Каллин семейство белков, впоследствии получившее название cul5.

Распределение тканей

Исследования показали, что белок cul5 экспрессируется на самом высоком уровне в сердечной и скелетной ткани и специфически экспрессируется в сосудистой системе. эндотелий и почечный собирающие канальцы.^[9]

Функция

Cul5 подавляет клеточную пролиферацию, потенциально за счет своего участия в SOCS / BC-box / eloBC / cul5 / RING E3 лигазный комплекс, который функционирует как часть убиквитин система деградации белков.^[10]

Одно исследование показало, что Cul5 играет роль в Reelin сигнальный каскад, участвующий в DAB1 деградация и, таким образом, обеспечение механизма отрицательной обратной связи передачи сигналов Reelin во время кортикогенеза.^[11]

Взаимодействия

CUL5 был показан взаимодействовать с участием RBX1.^[12]^[13]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166266 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032030 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Kipreos ET, Lander LE, Wing JP, He WW, Hedgecock EM (август 1996 г.). «cul-1 необходим для выхода из клеточного цикла C. elegans и определяет новое семейство генов». Ячейка. 85 (6): 829–39. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81267-2. PMID 8681378. S2CID 15805562.
^ Берд П.Дж., Станкович Т., МакКонвилл С.М., Смит А.Д., Купер П.Р., Тейлор А.М. (май 1997 г.). «Идентификация и анализ экспрессии человеческого VACM-1, члена семейства гена кулина, расположенного на хромосоме 11q22-23». Genome Res. 7 (1): 71–5. Дои:10.1101 / гр.7.1.71. PMID 9037604.
^ "Entrez Gene: CUL5 cullin 5".
^ Бурнатовска-Хледин М.А., Спилман В.С., Смит В.Л. и др. (1995). «Клонирование экспрессии AVP-активированного, мобилизующего кальций рецептора из мозгового вещества почки кролика». Am J Physiol. 268 (6): F1198–210. Дои:10.1152 / ajprenal.1995.268.6.F1198. PMID 7611460.
^ Burnatowska-Hledin M, Lazdins IB, Listenberger L, et al. (1999). «Рецептор VACM-1 специфически экспрессируется в эндотелии сосудов кролика и собирательных канальцах почек». Am J Physiol. 276 (2, часть 2): F199–209. Дои:10.1152 / ajprenal.1999.276.2.F199. PMID 9950950.
^ Петроски MD, Deshaies RJ (2005). «Функция и регуляция лигаз cullin-RING E3» (PDF). Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 6 (1): 9–21. Дои:10.1038 / nrm1547. PMID 15688063. S2CID 24159190.
^ Фэн Л., Аллен Н. С., Симо С., Купер Дж. А. (ноябрь 2007 г.). «Cullin 5 регулирует уровни белка Dab1 и положение нейронов во время кортикального развития». Genes Dev. 21 (21): 2717–30. Дои:10.1101 / gad.1604207. ЧВК 2045127. PMID 17974915.
^ Дуда, Дэвид М; Борг Лаура А; Скотт Дэниэл С; Охота на Гарольда W; Хаммель Михал; Шульман Бренда А (сентябрь 2008 г.). «Структурное понимание активации NEDD8 лигаз Cullin-RING: конформационный контроль конъюгации». Ячейка. Соединенные Штаты. 134 (6): 995–1006. Дои:10.1016 / j.cell.2008.07.022. ЧВК 2628631. PMID 18805092.
^ Охта, Т; Мишель Дж. Дж .; Schottelius A J; Xiong Y (апрель 1999 г.). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров кулина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Мол. Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 3 (4): 535–41. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. ISSN 1097-2765. PMID 10230407.

внешние ссылки

Человек CUL5 расположение генома и CUL5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Хиллер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Genome Res. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID 8889549.
Станкович Т., Берд П.Дж., Купер П.Р. и др. (1997). «Создание карты транскрипции вокруг гена атаксии телеангиэктазии: идентификация по крайней мере четырех новых генов». Геномика. 40 (2): 267–76. Дои:10.1006 / geno.1996.4595. PMID 9119394.
Норт РГ, Фэй М.Дж., Лонго К.А., Ду Дж. (1998). «Экспрессия всех известных подтипов рецепторов вазопрессина мелкоклеточными опухолями подразумевает многогранную роль этого нейропептида». Рак Res. 58 (9): 1866–71. PMID 9581826.
Burnatowska-Hledin M, Lazdins IB, Listenberger L, et al. (1999). «Рецептор VACM-1 специфически экспрессируется в эндотелии сосудов кролика и собирательных канальцах почек». Am. J. Physiol. 276 (2, часть 2): F199–209. PMID 9950950.
Wada H, Yeh ET, Kamitani T (1999). «Идентификация сайта конъюгации NEDD8 в человеческом cullin-2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 257 (1): 100–5. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0339. PMID 10092517.
Охта Т., Мишель Дж. Дж., Шоттелиус А. Дж., Сюн Й (1999). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров кулина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Мол. Ячейка. 3 (4): 535–41. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID 10230407.
Хори Т., Осака Ф., Чиба Т. и др. (2000). «Ковалентная модификация всех членов белков семейства кулинов человека с помощью NEDD8». Онкоген. 18 (48): 6829–34. Дои:10.1038 / sj.onc.1203093. PMID 10597293.
Burnatowska-Hledin M, Zhao P, Capps B и др. (2000). «VACM-1, член семейства генов кулина, регулирует клеточную передачу сигналов». Am. J. Physiol., Cell Physiol.. 279 (1): C266–73. Дои:10.1152 / ajpcell.2000.279.1.C266. PMID 10898738.
Камура Т., Буриан Д., Ян К. и др. (2001). «Muf1, новый белок с богатым лейцином повтора, взаимодействующий с элонгином BC, который может собираться с Cul5 и Rbx1 для восстановления убиквитинлигазы». J. Biol. Chem. 276 (32): 29748–53. Дои:10.1074 / jbc.M103093200. PMID 11384984.
Burnatowska-Hledin M, Zeneberg A, Roulo A, et al. (2001). «Экспрессия белка VACM-1 в культивируемых эндотелиальных клетках надпочечников крысы связана с клеточным циклом». Эндотелий. 8 (1): 49–63. Дои:10.3109/10623320109063157. PMID 11409851.
Харада Ю.Н., Шевченко А., Шевченко А. и др. (2002). «Анализ протеома, заякоренного аденовирусом E1B-55K, показывает его связь с механизмом убиквитинирования». Дж. Вирол. 76 (18): 9194–206. Дои:10.1128 / JVI.76.18.9194-9206.2002. ЧВК 136464. PMID 12186903.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Лю Дж, Фурукава М, Мацумото Т, Сюн Й (2003). «Модификация NEDD8 CUL1 диссоциирует p120 (CAND1), ингибитор связывания CUL1-SKP1 и лигаз SCF». Мол. Ячейка. 10 (6): 1511–8. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00783-9. PMID 12504025.
Ван Дорт С., Чжао П., Пармели К. и др. (2004). «VACM-1, ген cul-5, ингибирует рост клеток с помощью механизма, который включает пути передачи сигналов MAPK и p53». Am. J. Physiol., Cell Physiol.. 285 (6): C1386–96. Дои:10.1152 / ajpcell.00338.2002. PMID 12917106.
Yu X, Yu Y, Liu B и др. (2003). «Индукция убиквитинирования APOBEC3G и деградации комплексом ВИЧ-1 Vif-Cul5-SCF». Наука. 302 (5647): 1056–60. Дои:10.1126 / science.1089591. PMID 14564014. S2CID 29676466.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Burnatowska-Hledin MA, Kossoris JB, Van Dort CJ, et al. (2004). «Рост клеток рака молочной железы T47D ингибируется экспрессией VACM-1, гена cul-5». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 319 (3): 817–25. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.05.057. PMID 15184056.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.

Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166266 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032030 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8681378-5] Kipreos ET, Lander LE, Wing JP, He WW, Hedgecock EM (август 1996 г.). «cul-1 необходим для выхода из клеточного цикла C. elegans и определяет новое семейство генов». Ячейка. 85 (6): 829–39. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81267-2. PMID 8681378. S2CID 15805562.

[pmid9037604-6] Берд П.Дж., Станкович Т., МакКонвилл С.М., Смит А.Д., Купер П.Р., Тейлор А.М. (май 1997 г.). «Идентификация и анализ экспрессии человеческого VACM-1, члена семейства гена кулина, расположенного на хромосоме 11q22-23». Genome Res. 7 (1): 71–5. Дои:10.1101 / гр.7.1.71. PMID 9037604.

[entrez-7] "Entrez Gene: CUL5 cullin 5".

[8] Бурнатовска-Хледин М.А., Спилман В.С., Смит В.Л. и др. (1995). «Клонирование экспрессии AVP-активированного, мобилизующего кальций рецептора из мозгового вещества почки кролика». Am J Physiol. 268 (6): F1198–210. Дои:10.1152 / ajprenal.1995.268.6.F1198. PMID 7611460.

[9] Burnatowska-Hledin M, Lazdins IB, Listenberger L, et al. (1999). «Рецептор VACM-1 специфически экспрессируется в эндотелии сосудов кролика и собирательных канальцах почек». Am J Physiol. 276 (2, часть 2): F199–209. Дои:10.1152 / ajprenal.1999.276.2.F199. PMID 9950950.

[10] Петроски MD, Deshaies RJ (2005). «Функция и регуляция лигаз cullin-RING E3» (PDF). Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 6 (1): 9–21. Дои:10.1038 / nrm1547. PMID 15688063. S2CID 24159190.

[pmid17974915-11] Фэн Л., Аллен Н. С., Симо С., Купер Дж. А. (ноябрь 2007 г.). «Cullin 5 регулирует уровни белка Dab1 и положение нейронов во время кортикального развития». Genes Dev. 21 (21): 2717–30. Дои:10.1101 / gad.1604207. ЧВК 2045127. PMID 17974915.

[pmid18805092-12] Дуда, Дэвид М; Борг Лаура А; Скотт Дэниэл С; Охота на Гарольда W; Хаммель Михал; Шульман Бренда А (сентябрь 2008 г.). «Структурное понимание активации NEDD8 лигаз Cullin-RING: конформационный контроль конъюгации». Ячейка. Соединенные Штаты. 134 (6): 995–1006. Дои:10.1016 / j.cell.2008.07.022. ЧВК 2628631. PMID 18805092.

[pmid10230407-13] Охта, Т; Мишель Дж. Дж .; Schottelius A J; Xiong Y (апрель 1999 г.). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров кулина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Мол. Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 3 (4): 535–41. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. ISSN 1097-2765. PMID 10230407.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]