Крышка C - C cap

Термин C cap (C-cap, Ccap) описывает аминокислота в определенной позиции в белок или же полипептид. [1] [2] [3] [4] [5] [6] Остаток C cap альфа спираль последний аминокислота остаток на Конечная точка C спирали. Точнее, он определяется как последний остаток (i), группа NH которого является водородная связь к группе CO остатка i-4 (или иногда остатка i-3). Из-за этого его иногда также называют остатком по спирали.

Определенные мотивы обычно встречаются на крышке C или вокруг нее, особенно Петля Шельмана и ниша (структурный мотив белка).

В N крышка соответствующий аминокислотный остаток на другом конце спирали


Рекомендации

  1. ^ Ричардсон, Дж. М.; Ричардсон, округ Колумбия (1988). «Предпочтения аминокислот в определенных местах на концах альфа-спиралей». Наука. 240 (4859): 1648–1652. Bibcode:1988Научный ... 240.1648R. Дои:10.1126 / science.3381086. PMID  3381086. S2CID  38467101.
  2. ^ Presta, LG; Роза Г.Д. (1988). «Крышки Helix». Наука. 240 (4859): 1632–1641. Bibcode:1988Научный ... 240.1632П. Дои:10.1126 / science.2837824. PMID  2837824.
  3. ^ Дойг, AJ; МакАртур М.В. (1997). «Структуры N-концов спиралей в белках». Белковая наука. 6 (1): 147–155. Дои:10.1002 / pro.5560060117. ЧВК  2143508. PMID  9007987.
  4. ^ Аврора, Р. Роза Г.Д. (1998). «Укупорка спирали». Белковая наука. 7 (1): 21–38. Дои:10.1002 / pro.5560070103. ЧВК  2143812. PMID  9514257.
  5. ^ Gunasekaran, K; Нагараджам HA (1998). «Стерохимические знаки препинания в структуре белка». Журнал молекулярной биологии. 275 (5): 917–932. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1505. PMID  9480777. S2CID  35919397.
  6. ^ Лидер, ДП; Милнер-Уайт EJ (2011). «Строение концов спиралей в глобулярных белках». Белки. 79 (3): 1010–1019. Дои:10.1002 / prot.22942. PMID  21287629.