N крышка - N cap

Период, термин N крышка (N-cap, Ncap) описывает аминокислота в определенной позиции в белок или же полипептид. [1] [2] [3] [4] [5] [6] Остаток N cap альфа спираль это первый аминокислота остаток на N конечная спирали. Более точно, он определяется как первый вычет (i), CO-группа которого водородная связь к группе NH остатка i + 4 (или иногда остатка i + 3). Из-за этого его иногда также называют остатком перед спиралью.

Мотивы кепки часто встречаются на кепке N. Asx поворачивает, ST повороты, asx мотивы и ST повороты часто встречаются в таких ситуациях, с asx или серин или же треонин остаток на N крышке.

В Крышка C соответствующий аминокислотный остаток на другом конце спирали

Рекомендации

  1. ^ Ричардсон, Дж. М.; Ричардсон, округ Колумбия (1988). «Предпочтения аминокислот в определенных местах на концах альфа-спиралей». Наука. 240 (4859): 1648–1652. Bibcode:1988Научный ... 240.1648R. Дои:10.1126 / science.3381086. PMID  3381086.
  2. ^ Presta, LG; Роза Г.Д. (1988). «Крышки Helix». Наука. 240 (4859): 1632–1641. Bibcode:1988Научный ... 240.1632П. Дои:10.1126 / science.2837824. PMID  2837824.
  3. ^ Дойг, AJ; МакАртур М.В. (1997). «Структуры N-концов спиралей в белках». Белковая наука. 6 (1): 147–155. Дои:10.1002 / pro.5560060117. ЧВК  2143508. PMID  9007987.
  4. ^ Аврора, Р. Роза Г.Д. (1998). «Укупорка спирали». Белковая наука. 7 (1): 21–38. Дои:10.1002 / pro.5560070103. ЧВК  2143812. PMID  9514257.
  5. ^ Gunasekaran, K; Нагараджам HA (1998). «Стерохимические знаки препинания в структуре белка» (PDF). Журнал молекулярной биологии. 275 (5): 917–932. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1505. PMID  9480777.
  6. ^ Лидер, ДП; Милнер-Уайт EJ (2011). «Строение концов спиралей в глобулярных белках». Белки. 79 (3): 1010–1019. Дои:10.1002 / prot.22942. PMID  21287629.