Candidatus Carsonella ruddii - Candidatus Carsonella ruddii

Candidatus Карсонелла руддии
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Гамма-протеобактерии
Заказ:
несекретный
Род:
Candidatus Carsonella
Разновидность:
Ca. C. ruddii
Биномиальное имя
Candidatus Карсонелла руддии
Thao et al. 2000 г.

Candidatus Карсонелла руддии является обязать эндосимбиотический Гамма-протеобактерии[1] с одним из самых маленьких геномы любых охарактеризованных бактерий.[2]

Эндосимбиоз

Вид является эндосимбионт что присутствует во всех видах флоэма насекомые, питающиеся соком, известные как псиллиды.[3][4] Эндосимбионты находятся в специальной структуре, известной как бактериом.

C. ruddii не является полностью паразитическим в отношениях со своим насекомым-хозяином; он снабжает хозяина некоторыми незаменимыми аминокислотами. Следовательно, он, вероятно, находится в эволюционном процессе становления органелла, аналогично митохондрии эукариотических клеток, которые также произошли от эндосимбионта.[5]

Геном

В 2006 г. геном Ca. Штамм C. ruddii Pv (Carsonella-Pv) из каркас черешок желчного псиллида, Пахипсилла венуста, была секвенирована в RIKEN в Японии и Университет Аризоны. Было показано, что геном состоит из кольцевой хромосомы из 159 662 пар оснований и что он имеет высокую плотность кодирования (97%) со многими перекрывающиеся гены и уменьшенная длина гена. Количество прогнозируемых гены было 182, что также является самым низким показателем за всю историю (NCBI-Геном ). В сравнении, Mycoplasma genitalium, который имеет самый маленький геном среди свободноживущих организмов, имеет геном из 521 гена. Похоже, что отсутствуют многочисленные гены, которые считаются необходимыми для жизни, что позволяет предположить, что вид, возможно, достиг органелла -подобный статус.[2]

Во время секвенирования считалось, что C. ruddii имеет самый маленький геном среди всех охарактеризованных видов бактерий.[6] Nasuia deltocephalinicola в настоящее время считается, что он имеет самый маленький из известных геномов бактерий (112 килобайт).[7]

C. ruddii и родственные виды, по-видимому, активно подвергаются потеря гена.[8]

Рекомендации

  1. ^ Сполдинг, А. В .; фон Долен, К. Д. (1998). «Филогенетическая характеристика и молекулярная эволюция бактериальных эндосимбионтов у псиллид (Hemiptera: Sternorrhyncha)». Молекулярная биология и эволюция. 15 (11): 1506–1513. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025878. PMID  12572614.
  2. ^ а б Накабачи А., Ямасита А., Тох Х, Исикава Х, Данбар Х, Моран Н., Хаттори М. (2006). "160-килобазный геном бактериального эндосимбионта Carsonella". Наука. 314 (5797): 267. Дои:10.1126 / science.1134196. PMID  17038615.
  3. ^ Тао, М. (2000). «Косоведиация псиллид и их первичных прокариотических эндосимбионтов». Прикладная и экологическая микробиология. 66 (7): 2898–2905. Дои:10.1128 / aem.66.7.2898-2905.2000. ЧВК  92089. PMID  10877784.
  4. ^ Тао, М. (2001). «Филогенетический анализ вертикально передающихся эндосимбионтов псиллид (Candidatus Carsonella ruddii) на основе atpAGD и rpoC: сравнение с филогенезом, происходящим от 16S-23S рДНК». Современная микробиология. 42 (6): 419–21. Дои:10.1007 / s002840010240. PMID  11381334.
  5. ^ Tortora (1), Funke (2), Case (3), Gerard J (1), Berdell R (2), Christine L (3) (2016). Микробиология: Введение (12-е издание). США: Пирсон. п. 315. ISBN  978-0321929150.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
  6. ^ Moran, Nancy A .; Беннетт, Гордон М. (8 сентября 2014 г.). «Крошечные геномы». Ежегодный обзор микробиологии. 68 (1): 195–215. Дои:10.1146 / annurev-micro-091213-112901. PMID  24995872.
  7. ^ Bennett, G.M .; Моран, Н. А. (5 августа 2013 г.). "Маленький, маленький, самый маленький: происхождение и эволюция древних двойных симбиозов у ​​насекомых, питающихся флоэмой". Геномная биология и эволюция. 5 (9): 1675–1688. Дои:10.1093 / gbe / evt118. ЧВК  3787670. PMID  23918810.
  8. ^ Sloan, D. B .; Моран, Н. А. (19 июля 2012 г.). «Сокращение генома и коэволюция между первичными и вторичными бактериальными симбионтами псиллид». Молекулярная биология и эволюция. 29 (12): 3781–3792. Дои:10.1093 / молбев / mss180. ЧВК  3494270. PMID  22821013.

внешняя ссылка

  • Scientific American - Крошечный геном может отражать органеллы в процессе создания