Центаврин, альфа 1 - Centaurin, alpha 1
Arf-GAP с белком, содержащим двойной домен PH 1 это белок что у людей кодируется ADAP1 ген.[5][6]
Взаимодействия
Центаврин, альфа 1, как было показано взаимодействовать с участием:
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы при изучении функции ADAP1. Условный нокаутирующая мышь линия называется Adap1tm1a (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[11] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[12] для определения последствий удаления.[13][14][15][16] Выполнены дополнительные экраны:
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Все данные доступны на сайте.[12][17][18] | |
| Инсулин | Нормальный |
| Гомозиготная жизнеспособность на P14 | Нормальный |
| Гомозиготная фертильность | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология 16 недель | Нормальный |
| Лейкоциты периферической крови 16 недель | Нормальный |
| Сальмонелла инфекция | Нормальный |
| Состав эпидермального иммунитета | Нормальный |
| Проблема гриппа | Аномальный |
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105963 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056413 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Венкатесварлу К., Оати ПБ, Таваре Дж. М., Джексон Т. Р., Каллен П. Дж. (Июнь 1999 г.). «Идентификация центаурина-альфа1 как потенциального in vivo фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-связывающего белка, который функционально гомологичен белку, активирующему GTPase фактора ADP-рибозилирования дрожжей (ARF), Gcs1». Биохимический журнал. 340 (2): 359–63. Дои:10.1042/0264-6021:3400359. ЧВК 1220257. PMID 10333475.
- ^ «Энтрез Ген: Центаурин CENTA1, альфа 1».
- ^ Dubois T, Howell S, Zemlickova E, Aitken A (апрель 2002 г.). «Идентификация белков-партнеров, взаимодействующих с казеинкиназой Ialpha». Письма FEBS. 517 (1–3): 167–71. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 02614-5. PMID 12062430. S2CID 84792445.
- ^ Дюбуа Т., Кераи П., Земличкова Е., Хауэлл С., Джексон Т.Р., Венкатесварлу К., Каллен П.Дж., Тайберт А.Б., Лароз Л., Роуч П.Дж., Эйткен А. (июнь 2001 г.). «Казеинкиназа I связывается с членами семейства центаурина-альфа фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-связывающих белков». Журнал биологической химии. 276 (22): 18757–64. Дои:10.1074 / jbc.M010005200. PMID 11278595.
- ^ Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 связывает in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 03010-3. PMID 12565890.
- ^ а б c d Земликова Е., Дюбуа Т., Кераи П., Клоки С., Кроншоу А.Д., Уэйкфилд Р.И., Йоханнес Ф.Дж., Эйткен А. (август 2003 г.). «Центаурин-альфа (1) связывается с изоформами протеинкиназы C и фосфорилируется ими». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 307 (3): 459–65. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 01187-2. PMID 12893243.
- ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Ячейка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК 3717207. PMID 23870131.
- ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
- ^ а б «Консорциум OBCD».
дальнейшее чтение
- Венкатесварлу К., Каллен П.Дж. (август 1999 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика человеческого гомолога центаврина-альфа». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 262 (1): 237–44. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1065. PMID 10448098.
- Дюбуа Т., Кераи П., Земличкова Е., Хауэлл С., Джексон Т.Р., Венкатесварлу К., Каллен П.Дж., Тайберт А.Б., Лароз Л., Роуч П.Дж., Эйткен А. (июнь 2001 г.). «Казеинкиназа I связывается с членами семейства центаурина-альфа фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-связывающих белков». Журнал биологической химии. 276 (22): 18757–64. Дои:10.1074 / jbc.M010005200. PMID 11278595.
- Седехизаде Ф., Ханк Т., Стрикер Р., Хорстмайер А., Бернштейн Х. Г., Райзер Г. (февраль 2002 г.). «Клеточная экспрессия и субклеточная локализация человеческого Ins (1,3,4,5) P (4) -связывающего белка, p42 (IP4), в человеческом мозге и в нейрональных клетках». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 99 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0169-328X (01) 00335-7. PMID 11869802.
- Уитли П., Гиббард А. М., Куманов Ф., Олдфилд С., Килгур Э. Э., Прествич Г. Д., Холман Г. Д. (апрель 2002 г.). «Идентификация центаврина-альфа2: фосфатидилинозитид-связывающего белка, присутствующего в жире, сердце и скелетных мышцах». Европейский журнал клеточной биологии. 81 (4): 222–30. Дои:10.1078/0171-9335-00242. PMID 12018390.
- Райзер Г., Бернштейн Г. Г. (декабрь 2002 г.). «Нейроны и бляшки пациентов с болезнью Альцгеймера высоко экспрессируют стыковочный белок нейрональной мембраны p42IP4 / центаурин альфа». NeuroReport. 13 (18): 2417–9. Дои:10.1097/00001756-200212200-00008. PMID 12499840. S2CID 24499944.
- Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 связывает in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03010-3. PMID 12565890.
- Мацуда А., Сузуки Ю., Хонда Дж., Мурамацу С., Мацузаки О, Нагано И., Дои Т., Шимотохно К., Харада Т., Нисида Е., Хаяси Х, Сугано С. (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID 12761501.
- Земликова Е., Дюбуа Т., Кераи П., Клоки С., Кроншоу А.Д., Уэйкфилд Р.И., Йоханнес Ф.Дж., Эйткен А. (август 2003 г.). «Центаурин-альфа (1) связывается с изоформами протеинкиназы C и фосфорилируется ими». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 307 (3): 459–65. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01187-2. PMID 12893243.
- Венкатесварлу К., Брандом К.Г., Лоуренс Дж.Л. (февраль 2004 г.). «Центаурин-альфа1 представляет собой in vivo фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфат-зависимый GTPase-активирующий белок для ARF6, который участвует в организации актинового цитоскелета» (PDF). Журнал биологической химии. 279 (8): 6205–8. Дои:10.1074 / jbc.C300482200. PMID 14625293. S2CID 34971745.
- Ханк Т., Стрикер Р., Седехизаде Ф, Райзер Г. (январь 2004 г.). «Идентификация структуры гена и субклеточной локализации человеческого центаврина альфа 2 и p42IP4, семейства двух высокогомологичных, Ins 1,3,4,5-P4- / PtdIns 3,4,5-P3-связывающих адаптерных белков» . Журнал нейрохимии. 88 (2): 326–36. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2003.02143.x. PMID 14690521.
- Райзер G, Бернштейн HG (январь 2004 г.). «Измененная экспрессия белка p42IP4 / центаурин-альфа 1 в мозге при болезни Альцгеймера и возможное взаимодействие p42IP4 с нуклеолином». NeuroReport. 15 (1): 147–8. Дои:10.1097/00001756-200401190-00028. PMID 15106847. S2CID 23980496.
- Такер Е., Кернс Б., Чепмен С., Хаммонд Дж., Хауэлл А., Тайберт А. (октябрь 2004 г.). «Центаурин альфа-1 arf6 GAP представляет собой нейрональный актин-связывающий белок, который также функционирует посредством GAP-независимой активности, регулируя актиновый цитоскелет». Европейский журнал клеточной биологии. 83 (10): 541–54. Дои:10.1078/0171-9335-00416. PMID 15679100.
- Лоуренс Дж., Манделл С.Дж., Юн Х., Келли Э., Венкатесварлу К. (июнь 2005 г.). «Центаурин-альфа 1, белок, активирующий ГТФазу фактора АДФ-рибозилирования 6, ингибирует интернализацию бета 2-адренорецепторов». Молекулярная фармакология. 67 (6): 1822–8. Дои:10.1124 / моль.105.011338. PMID 15778454. S2CID 85844075.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Хаяси Х., Мацудзаки О, Мурамацу С., Цучия Й., Харада Т., Сузуки Ю., Сугано С., Мацуда А., Нисида Е. (январь 2006 г.). «Центаурин-альфа1 является фосфатидилинозитол-3-киназозависимым активатором митоген-активируемых протеинкиназ ERK1 / 2». Журнал биологической химии. 281 (3): 1332–7. Дои:10.1074 / jbc.M505905200. PMID 16287813.
- Седехизаде Ф, фон Клот С., Ханк Т., Райзер Г. (октябрь 2005 г.). «p42 (IP4) / кентаурин альфа1, специфический для мозга PtdIns (3,4,5) P3 / Ins (1,3,4,5) P4-связывающий белок: перенос через мембрану, индуцированный эпидермальным фактором роста, ингибируется стимуляцией рецептор тромбина, связанный с фосфолипазой C ". Нейрохимические исследования. 30 (10): 1319–30. Дои:10.1007 / s11064-005-8804-1. PMID 16341594. S2CID 12972048.