Контакты 2 - Contactin 2

CNTN2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2ОМ5
Идентификаторы
Псевдонимы	CNTN2, AXT, FAME5, TAG-1, TAX, TAX1, контактин 2, транзиторный аксональный гликопротеин-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 190197 MGI: 104518 ГомолоГен: 3720 Генные карты: CNTN2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	205,078,289 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	132,543,256 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• самоассоциация белков; • идентичное связывание с белками; • связывание углеводов; • связывание белков, участвующих в клеточной адгезии;
Сотовый компонент	• мембрана; • миелин; • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов; • клеточная мембрана; • узел Ранвье; • синапс; • неотъемлемый компонент плазматической мембраны; • поверхность клетки; • аксон; • тело нейрональной клетки; • закрепленный компонент мембраны; • проекция нейрона; • юкстапаранодная область аксона; • закрепленный компонент постсинаптической мембраны;
Биологический процесс	• кластеризация потенциалзависимых калиевых каналов; • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов; • миелинизация центральной нервной системы; • рецепторная интернализация; • миграция нейронов; • обучение; • пресинаптическая мембранная организация; • регуляция дифференцировки астроцитов; • регулирование диаметра аксона; • клеточная адгезия; • положительное регулирование переработки белка; • установление локализации белка в юкстапаранодной области аксона; • положительная регуляция сигнального пути аденозинового рецептора; • кора головного мозга ГАМКергическая миграция интернейронов; • регуляция нейрональной синаптической пластичности; • локализация белка в юкстапаранодной области аксона; • регуляция клеточного морфогенеза, участвующего в дифференцировке; • развитие проекции нейрона; • аксональная фасцикуляция; • организация цитоскелета микротрубочек; • поведение взрослых при ходьбе; • управление аксоном; • развитие нервной системы; • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны; • дендритное самопроизвольное избегание;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6900
	21367
	ENSG00000184144
	ENSMUSG00000053024
	Q02246
	Q61330
	NM_005076; NM_001346083
	NM_011531; NM_177129
	NP_001333012; NP_005067
	NP_796103
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Контакты-2 это белок что у людей кодируется CNTN2 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства иммуноглобулинов. Это заякоренный гликозилфосфатидилинозитол (GPI) белок нейрональной мембраны, который функционирует как молекула клеточной адгезии. Он может играть роль в формировании аксонных связей в развивающейся нервной системе. Он также может участвовать в онкогенезе глии и может служить потенциальной мишенью для терапевтического вмешательства.^[7]

Взаимодействия

CNTN2 был показан взаимодействовать с участием CNTNAP2^[8] и NFYB.^[9]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184144 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053024 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Tsiotra PC, Karagogeos D, Theodorakis K, Michaelidis TM, Modi WS, Furley AJ, Jessell TM, Papamatheakis J (декабрь 1993 г.). «Выделение кДНК и хромосомная локализация гена (TAX1), кодирующего человеческий аксональный гликопротеин TAG-1». Геномика. 18 (3): 562–7. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80357-X. PMID 8307567.
^ Йошихара Ю., Кавасаки М., Тамада А., Нагата С., Кагамияма Х., Мори К. (сентябрь 1995 г.). «Перекрывающаяся и дифференциальная экспрессия BIG-2, BIG-1, TAG-1 и F3: четырех членов подгруппы молекулы адгезии связанных с аксоном клеток суперсемейства иммуноглобулинов». Журнал нейробиологии. 28 (1): 51–69. Дои:10.1002 / neu.480280106. PMID 8586965.
^ ^а ^б «Энтрез Ген: CNTN2 контактин 2 (аксональный)».
^ Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A., Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация TAG-1 с Caspr2 важна для молекулярной организации юкстапаранодальных областей миелинизированных волокон». Журнал клеточной биологии. 162 (6): 1161–72. Дои:10.1083 / jcb.200305078. ЧВК 2172849. PMID 12975355.
^ Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y». Молекулярная и клеточная биология. 17 (3): 1236–43. Дои:10.1128 / mcb.17.3.1236. ЧВК 231848. PMID 9032250.

внешние ссылки

Человек CNTN2 расположение генома и CNTN2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Уолш Ф.С., Доэрти П. (ноябрь 1991 г.). «Гликозилфосфатидилинозитол заякоренные молекулы распознавания, которые функционируют в фасцикуляции аксонов, росте и управлении в нервной системе». Международные отчеты по клеточной биологии. 15 (11): 1151–66. Дои:10.1016 / 0309-1651 (91) 90061-М. PMID 1838307.
Kuhn TB, Stoeckli ET, Condrau MA, Rathjen FG, Sonderegger P (ноябрь 1991 г.). «Рост нейритов на иммобилизованном аксонине-1 опосредован гетерофильным взаимодействием с L1 (G4)». Журнал клеточной биологии. 115 (4): 1113–26. Дои:10.1083 / jcb.115.4.1113. ЧВК 2289947. PMID 1720120.
Додд Дж., Мортон С.Б., Карагогеос Д., Ямамото М., Джесселл Т.М. (апрель 1988 г.). «Пространственная регуляция экспрессии аксональных гликопротеинов на подмножествах эмбриональных спинномозговых нейронов». Нейрон. 1 (2): 105–16. Дои:10.1016/0896-6273(88)90194-8. PMID 3272160. S2CID 36629050.
Кенурик С., Леверша М., Рук Л., Хаслер Т., Сондереггер П. (сентябрь 1993 г.). «Локализация человеческого гена TAX-1 в 1q32.1: область, связанная с микроцефалией и синдромом Ван дер Вуд» (PDF). Молекулярная генетика человека. 2 (9): 1461–2. Дои:10.1093 / hmg / 2.9.1461. PMID 8242070.
Рейдер С., Стоекли Е.Т., Циглер Ю., Остервальдер Т., Кунц Б., Сондереггер П. (июль 1993 г.). «Межклеточная адгезия путем гомофильного взаимодействия нейрональной молекулы распознавания аксонина-1». Европейский журнал биохимии / FEBS. 215 (1): 133–41. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18015.x. PMID 8344273.
Hasler TH, Rader C, Stoeckli ET, Zuellig RA, Sonderegger P (январь 1993 г.). «Клонирование кДНК, структурные особенности и эукариотическая экспрессия человеческого ТАГ-1 / аксонина-1». Европейский журнал биохимии / FEBS. 211 (1–2): 329–39. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb19902.x. PMID 8425542.
Козлов С.В., Гигер Р.Дж., Хаслер Т., Корватска Э., Шордерет Д.Ф., Сондереггер П. (ноябрь 1995 г.). «Ген TAX1 человека, кодирующий молекулу адгезии ассоциированных с аксонами клеток TAG-1 / аксонин-1: геномная структура и основной промотор». Геномика. 30 (2): 141–8. Дои:10.1006 / geno.1995.9892. PMID 8586412.
Милев П., Маурел П., Херинг М., Марголис Р.К., Марголис РУ (июнь 1996 г.). «ТАГ-1 / аксонин-1 представляет собой высокоаффинный лиганд нейрокана, фосфакана / протеин-тирозинфосфатазы-дзета / бета и N-CAM». Журнал биологической химии. 271 (26): 15716–23. Дои:10.1074 / jbc.271.26.15716. PMID 8663515.
Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y». Молекулярная и клеточная биология. 17 (3): 1236–43. Дои:10.1128 / mcb.17.3.1236. ЧВК 231848. PMID 9032250.
Уильямс Х., Шахнер М., Ван Б., Кенврик С. (ноябрь 1997 г.). «Радиационное гибридное картирование генов тенасцина-R (TNR), фосдуцина (PDC), ламинина C1 (LAMC1) и TAX в 1q25-q32». Геномика. 46 (1): 165–6. Дои:10.1006 / geno.1997.4994. PMID 9403076.
Малхотра Дж. Д., Циотра П., Карагогеос Д., Хорч М. (декабрь 1998 г.). «Цис-активация L1-опосредованного рекрутирования анкирина за счет адгезии гомофильных клеток TAG-1». Журнал биологической химии. 273 (50): 33354–9. Дои:10.1074 / jbc.273.50.33354. PMID 9837910.
Freigang J, Proba K, Leder L, Diederichs K, Sonderegger P, Welte W. (май 2000 г.). «Кристаллическая структура модуля связывания лиганда аксонина-1 / TAG-1 предполагает механизм« застежки-молнии »для адгезии нервных клеток» (PDF). Ячейка. 101 (4): 425–33. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80852-1. PMID 10830169. S2CID 15440572.
Рикман Д.С., Тьяги Р., Чжу XX, Бобек М.П., Сонг С., Блайвас М., Мисек Д.Е., Израиль М.А., Курнит Д.М., Росс Д.А., Киш ЧП, Ханаш С.М. (март 2001 г.). «Ген молекулы адгезии аксональных клеток TAX-1 амплифицируется и аберрантно экспрессируется в злокачественных глиомах». Исследования рака. 61 (5): 2162–8. PMID 11280781.
Павлу О., Теодоракис К., Фальк Дж., Кутше М., Шахнер М., Фейвр-Сарраилх К., Карагогеос Д. (июль 2002 г.). «Анализ взаимодействий молекулы адгезии TAG-1 и ее доменов с другими членами суперсемейства иммуноглобулинов». Молекулярная и клеточная нейронауки. 20 (3): 367–81. Дои:10.1006 / mcne.2002.1105. PMID 12139915. S2CID 714233.
Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация TAG-1 с Caspr2 важна для молекулярной организации юкстапаранодальных областей миелинизированных волокон». Журнал клеточной биологии. 162 (6): 1161–72. Дои:10.1083 / jcb.200305078. ЧВК 2172849. PMID 12975355.
Нагараджа GM, Кандпал Р.П. (январь 2004 г.). «Кодируемый хромосомой 13q12 белок, активирующий Rho GTPase, подавляет рост клеток карциномы молочной железы, и двухгибридный дрожжевой скрининг показывает его взаимодействие с несколькими белками». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 313 (3): 654–65. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.001. PMID 14697242.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184144 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053024 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8307567-5] Tsiotra PC, Karagogeos D, Theodorakis K, Michaelidis TM, Modi WS, Furley AJ, Jessell TM, Papamatheakis J (декабрь 1993 г.). «Выделение кДНК и хромосомная локализация гена (TAX1), кодирующего человеческий аксональный гликопротеин TAG-1». Геномика. 18 (3): 562–7. Дои:10.1016 / S0888-7543 (05) 80357-X. PMID 8307567.

[pmid8586965-6] Йошихара Ю., Кавасаки М., Тамада А., Нагата С., Кагамияма Х., Мори К. (сентябрь 1995 г.). «Перекрывающаяся и дифференциальная экспрессия BIG-2, BIG-1, TAG-1 и F3: четырех членов подгруппы молекулы адгезии связанных с аксоном клеток суперсемейства иммуноглобулинов». Журнал нейробиологии. 28 (1): 51–69. Дои:10.1002 / neu.480280106. PMID 8586965.

[entrez-7] а ^б «Энтрез Ген: CNTN2 контактин 2 (аксональный)».

[pmid12975355-8] Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A., Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация TAG-1 с Caspr2 важна для молекулярной организации юкстапаранодальных областей миелинизированных волокон». Журнал клеточной биологии. 162 (6): 1161–72. Дои:10.1083 / jcb.200305078. ЧВК 2172849. PMID 12975355.

[pmid9032250-9] Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y». Молекулярная и клеточная биология. 17 (3): 1236–43. Дои:10.1128 / mcb.17.3.1236. ЧВК 231848. PMID 9032250.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]