Псевдоузел Coronavirus 3 ′ UTR - Coronavirus 3′ UTR pseudoknot

Псевдоузел Coronavirus 3 ′ UTR
RF00165-rscape.svg
Идентификаторы
СимволCorona_pk3
РфамRF00165
Прочие данные
РНК типСнг
Домен (ы)Вирусы
ТАКТАК: 0000205
PDB структурыPDBe

В Псевдоузел Coronavirus 3 ′ UTR является РНК структура найдена в коронавирус геном. Коронавирусы содержат одноцепочечную позитивно-смысловую РНК размером 30 т.п.н. геномы. В 3 ′ UTR область геномов этих коронавирусов содержит консервативные ~ 55 нуклеотидов псевдоузел структура, необходимая для репликации вирусного генома.[1] Механизм цис-регулирование неясно, но постулируется, что этот элемент функционирует в плюсовой цепи.

Другие семейства РНК, идентифицированные в коронавирусе, включают цис-действующий элемент репликации коронавируса SL-III (CRE), то Элемент стимуляции сдвига рамки коронавируса, то коронавирусный 3 'мотив, похожий на стебель-петлю II (s2m) и сигнал упаковки коронавируса.

Рекомендации

  1. ^ Уильямс Г. Д., Чанг Р. Ю., Брайан Д. А. (октябрь 1999 г.). «Филогенетически консервативный псевдоузел 3'-нетранслируемой области шпилечного типа участвует в репликации РНК коронавируса». Журнал вирусологии. 73 (10): 8349–8355. ЧВК  112852. PMID  10482585.

внешняя ссылка