Критическая оценка предсказания взаимодействий - Critical Assessment of Prediction of Interactions
Критическая оценка предсказания взаимодействий (CAPRI) - это общественный эксперимент по моделированию молекулярная структура из белковые комплексы, иначе известный как белок-белковая стыковка.
КАПРИ[1] представляет собой непрерывную серию событий, в ходе которых исследователи всего сообщества пытаются стыковать одни и те же белки, как было предоставлено экспертами. Раунды проводятся примерно каждые шесть месяцев. Каждый раунд содержит от одного до шести целевых белок-белковых комплексов, структура которых недавно была определена экспериментально. Координаты и принадлежат оценщикам в частном порядке при сотрудничестве структурные биологи кто их определил. Эксперимент CAPRI двойной слепой в том смысле, что заявители не знают решенную структуру, а эксперты не знают соответствия между заявкой и личностью ее создателя.
Смотрите также
- Критическая оценка методов прогнозирования структуры белка (CASP) - аналогичное упражнение в области предсказания структуры белков
- Критическая оценка функциональной аннотации (CAFA)
Рекомендации
- ^ Джанин Дж, Хенрик К., Моулт Дж., Эйк Л.Т., Штернберг М.Дж., Вайда С., Ваксер И., Водак С.Дж. (2003). «CAPRI: критическая оценка предполагаемых взаимодействий». Белки. 52 (1): 2–9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355. Дои:10.1002 / prot.10381. PMID 12784359.
внешняя ссылка
Список серверов прогнозов, участвующих в CAPRI
- ClusPro
- ГРАММ-X
- FireDock
- ХЭДДОК - белок-белковый докинг, обусловленный высокой неоднозначностью
- pyDockWEB - Структурное предсказание белок-белковых взаимодействий
- ПатчДок
- SmoothDock
- 3D-сад - Глобальная и ограниченная связь для исследования стыковки
- SwarmDock
- ДОК / ПИРОГ
Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |