Структурная биология - Википедия - Structural biology

Часть серии по
Биохимия
Myoglobin.png
Ключевые компоненты
История биохимии
Глоссарии
Порталы: Биохимия

Структурная биология это филиал молекулярная биология, биохимия, и биофизика озабочены молекулярной структурой биологических макромолекулы (особенно белки, состоящий из аминокислоты, РНК или же ДНК, состоящий из нуклеотиды, и мембраны, состоящий из липиды ), как они приобретают структуры, которые у них есть, и как изменения в их структурах влияют на их функции.[1] Эта тема представляет большой интерес для биологов, поскольку макромолекулы выполняют большую часть функций клетки, и только свертываясь в определенные трехмерные формы, они могут выполнять эти функции. Эта архитектура, "третичная структура "молекул, сложным образом зависит от основного состава каждой молекулы, или"первичная структура."

Гемоглобин белок, переносящий кислород, обнаруженный в красных кровяных тельцах

Биомолекулы слишком малы, чтобы рассмотреть детали даже при самом передовом освещении микроскопы. Методы, которые структурные биологи используют для определения своей структуры, обычно включают измерения огромного количества идентичных молекул одновременно. Эти методы включают:

Чаще всего исследователи используют их для изучения "родные государства "макромолекул. Но вариации этих методов также используются для наблюдения за зарождающимися или денатурированный молекулы принимают или повторно принимают свои естественные состояния. Видеть сворачивание белка.

Третий подход, который используют структурные биологи к пониманию структуры: биоинформатика искать закономерности среди разнообразных последовательности дающие начало определенным формам. Исследователи часто могут вывести аспекты структуры интегральные мембранные белки на основе топология мембраны предсказано анализ гидрофобности. Видеть предсказание структуры белка.

Примеры белковых структур из Банк данных белков (PDB)

За последние несколько лет стало возможным высокоточное физическое молекулярные модели чтобы дополнить in silico изучение биологических структур. Примеры этих моделей можно найти в Банк данных белков.

Вычислительные методы, такие как Молекулярная динамика моделирование можно использовать в сочетании со стратегиями определения эмпирической структуры для расширения и изучения структуры, конформации и функции белка.[2]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Банасзак, Леонард Дж. (2000). Основы структурной биологии. Берлингтон: Эльзевир. ISBN  9780080521848.
  2. ^ Карплюс, Мартин; Маккаммон, Дж. Эндрю (1 сентября 2002 г.). «Молекулярно-динамическое моделирование биомолекул». Структурная биология природы. 9 (9): 646–652. Дои:10.1038 / nsb0902-646. PMID  12198485.

внешняя ссылка