Cronobacter sakazakii - Cronobacter sakazakii

Cronobacter sakazakii
Cronobacter sakazakii
Cronobacter sakazakii
Научная классификация редактировать
Домен:Бактерии
Тип:Протеобактерии
Учебный класс:Гаммапротеобактерии
Заказ:Enterobacterales
Семья:Энтеробактерии
Род:Cronobacter
Разновидность:
C. sakazakii
Биномиальное имя
Cronobacter sakazakii
(Фермер и другие. 1980)[1]

Cronobacter sakazakii, который до 2007 года назывался Enterobacter sakazakii,[2][3] оппортунистический Грамотрицательный, стержневидный, патогенный бактерия которые могут жить в очень засушливых местах. Большая часть чего-либо Cronobacter sakazakii случаи взрослые, но низкий вес при рождении недоношенный неонатальный и старше младенцы подвержены наибольшему риску. Заболевание связано с редкой причиной инвазивной инфекции у младенцев с исторически высоким уровнем летальности (40–80%).[4][5][6][7]

У младенцев это может вызвать бактериемия, менингит и некротический энтероколит. Самый неонатальный C. sakazakii случаи инфекции были связаны с использованием порошка детская смесь[5][7] при этом некоторые штаммы способны выжить в высушенном состоянии более двух лет.[8] Однако не все случаи были связаны с зараженной детской смесью. В ноябре 2011 г. несколько партий Котекс тампоны были отозваны из-за Cronobacter (E. sakazakii) загрязнения. Также было проведено исследование, в ходе которого были обнаружены патогенные микроорганизмы в 12% полевых овощей и 13% гидропонных овощей.[9][10]

Все Cronobacter виды, кроме C. condimenti, были ретроспективно связаны с клиническими случаями инфекции у взрослых или младенцев. тем не мение мультилокусная последовательность [11] показал, что большинство неонатальных менингит случаи за последние 30 лет в 6 странах были связаны только с одной генетической линией вида. Cronobacter sakazakii называется «Тип последовательности 4» или «ST4»,[12] и поэтому этот клон, по-видимому, вызывает наибольшее беспокойство при детских инфекциях.

Бактерия распространена повсеместно, будучи изолированной от целого ряда сред и продуктов питания, и большинство Cronobacter случаи у взрослого населения. Однако основное внимание привлекла связь с порошкообразной формулой с внутренним или внешним загрязнением. В соответствии с анализ мультилокусной последовательности (MLSA) род возник ~ 40 MYA, и наиболее клинически значимые виды, C. sakazakii, было различимо ~ 15-23 млн лет.[13]

Таксономия

E. sakazakii был определен как вид в 1980 году JJ Farmer III. и другие.[1] ДНК-ДНК гибридизация показало, что E. sakazakii 53–54% относились к видам двух разных родов, Энтеробактер и Citrobacter. Однако различные биогруппы внутри E. sakazakii были описаны и Фермер и другие предположили, что это могут быть разные виды, и потребовали дополнительных исследований для уточнения.[1]

Таксономическая связь между E. sakazakii штаммы были изучены с использованием полноразмерных 16S рРНК секвенирование генов, гибридизация ДНК-ДНК, мультилокусная последовательность (MLST), е-AFLP, автоматизированный риботипирование. Это привело к классификации E. sakazakii как новый род, Cronobacter в пределах Энтеробактерии, первоначально включавшая четыре названных вида в 2007 году. Таксономия была расширена до пяти названных видов в 2008 году, а недавно (2011 год) - до семи названных видов.[2][3][14]

Первые четыре названных вида в 2007 г. Cronobacter sakazakii (состоит из двух подвидов), C. turicensis, C. muytjensii и С. dublinensis (состоящий из трех подвидов) плюс безымянный вид, называемый Cronobacter геномовиды I. Таксономия была пересмотрена в 2008 году и теперь включает пятый названный вид C. malonaticus, которые в 2007 году рассматривались как подвид C. sakazakii. В 2012, Cronobacter геномовиды меня формально переименовали Cronobacter universalis, и описан седьмой вид, названный Cronobacter condimenti.

Этимология

Первая задокументированная изоляция того, что стало известно как Cronobacter sakazakii был из банки сухого молока в 1950 году, хотя эти организмы, вероятно, существовали миллионы лет. В 1980 году Джон Дж. Фармер III предложил название Enterobacter sakazakii для так называемой "желто-пигментированной E. cloacae" в честь японского бактериолога Риичи Саказаки. В следующие десятилетия E. sakazakii был причастен к множеству случаев менингита и сепсиса среди младенцев, часто в сочетании с порошковой детской смесью. В 2007 году род Cronobacter был создан для размещения биогрупп E. sakazakii, с C. sakazakii как типовой вид. Род был назван в честь Cronos, титан из греческих мифов, пожирающий своих детей, когда они родились.[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c Фермер Дж. Дж. III, Эсбери М. А., Хикман Ф. В., Бреннер Д. Д. (1980). Исследовательская группа Enterobacteriaceae (США). "Enterobacter sakazakii: новый вид «Enterobacteriaceae», выделенный из клинических образцов ». Int J Syst Bacteriol. 30 (3): 569–84. Дои:10.1099/00207713-30-3-569.
  2. ^ а б Иверсен С; Mullane N; Барбара Маккарделл; и другие. (2008). «Cronobacter gen. Nov., Новый род, соответствующий биогруппам Enterobacter sakazakii, и предложение Cronobacter sakazakii gen. Nov. Comb. Nov., C. malonaticus sp. Nov., C. turicensis sp. Nov., C. muytjensii sp. nov., C. dublinensis sp. nov., Cronobacter genomospecies 1 и трех подвидов: C. dublinensis sp. nov. subsp. dublinensis subsp. nov., C. dublinensis sp. nov. subsp. lausannensis subsp. nov. и C. dublinensis sp. nov. subsp. lactaridi subsp. nov " (PDF). Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 58 (6): 1442–7. Дои:10.1099 / ijs.0.65577-0. PMID  18523192.
  3. ^ а б Джозеф; и другие. (2011). "Cronobacter condimenti sp. nov., выделенный из приправленного мяса и Cronobacter universalis sp. nov., новое обозначение вида для Cronobacter sp. геномовид 1, восстановленный после инфекции ноги, вода и пищевые ингредиенты ". Int J Syst Evol Microbiol. 62 (Pt 6): 1277–83. Дои:10.1099 / ijs.0.032292-0. PMID  22661070. Архивировано из оригинал на 2012-12-07. Получено 2011-12-27.
  4. ^ Хантер, Кэтрин Дж .; Петросян, Микаэл; Ford, Henri R .; Прасадарао, Немани В. (28 апреля 2017 г.). «Enterobacter sakazakii: новый патоген у младенцев и новорожденных». Хирургические инфекции. 9 (5): 533–539. Дои:10.1089 / за 2008.006. ISSN  1096-2964. ЧВК  2579942. PMID  18687047.
  5. ^ а б Центры по профилактике заболеваний (CDC) (апрель 2002 г.). «Инфекции Enterobacter sakazakii, связанные с использованием сухой детской смеси - Теннесси, 2001». MMWR. Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности. 51 (14): 297–300. PMID  12002167. Бесплатный полный текст
  6. ^ Лай К.К. (март 2001 г.). «Инфекции Enterobacter sakazakii среди новорожденных, младенцев, детей и взрослых. Отчеты о случаях заболевания и обзор литературы». Лекарство. 80 (2): 113–22. Дои:10.1097/00005792-200103000-00004. PMID  11307587.
  7. ^ а б Bowen AB, Braden CR (август 2006 г.). «Инвазивная болезнь Enterobacter sakazakii у младенцев». Возникающие инфекционные заболевания. 12 (8): 1185–9. Дои:10.3201 / eid1208.051509. ЧВК  3291213. PMID  16965695.
  8. ^ Caubilla-Barron J, Форсайт S (2007). «Сухой стресс и время выживания Enterobacter sakazakii и другие Энтеробактерии в обезвоженной детской смеси ». Журнал Food Protection. 13: 467–472.
  9. ^ Уэда, Шигеко (01.01.2017). «Встречаемость Cronobacter spp. В сушеных продуктах, свежих овощах и почве». Биоконтроль науки. 22 (1): 55–59. Дои:10.4265 / био.22.55. ISSN  1884-0205. PMID  28367871.
  10. ^ «Отзыв FDA тампонов Kotex». ТОО «Сигер Вайс». 2011-11-16. Архивировано из оригинал на 2014-09-05. Получено 2012-02-29.
  11. ^ Болдуин; и другие. (2009). "Мультилокусное последовательное типирование Cronobacter sakazakii и Cronobacter malonaticus выявляет стабильные клональные структуры с клиническим значением, не коррелирующие с биотипами ». BMC Microbiology. 9: 223. Дои:10.1186/1471-2180-9-223. ЧВК  2770063. PMID  19852808.
  12. ^ Джозеф и Форсайт (2011). "Ассоциация Cronobacter sakazakii ST4 при неонатальных инфекциях ». Возникающие инфекционные заболевания. 17 (9): 1713–5. Дои:10.3201 / eid1709.110260. ЧВК  3322087. PMID  21888801.
  13. ^ Джозеф С., Сонбол Х., Харири С., Десаи П., Макклелланд М., Форсайт С.Дж. (сентябрь 2012 г.). «Разнообразие рода Cronobacter, выявленное с помощью мультилокусного типирования последовательностей». Журнал клинической микробиологии. 50 (9): 3031–9. Дои:10.1128 / JCM.00905-12. ЧВК  3421776. PMID  22785185.
  14. ^ Иверсен К., Ленер А., Муллан Н., Бидлас Э, Клинверк И., Маругг Дж., Фаннинг С., Стефан Р., Йостен Х (2007). "Таксономия Enterobacter sakazakii: предложение нового рода Cronobacter gen. Nov. И описания Cronobacter sakazakii comb. Nov. Cronobacter sakazakii subsp. Sakazakii, comb. Nov., Cronobacter sakazakii subsp. Noonvaticus. Subsp. Malonvaticus. Subsp. . nov., Cronobacter muytjensii sp. nov., Cronobacter dublinensis sp. nov. и Cronobacter genomospecies 1 ". BMC Эволюционная биология. 7: 64. Дои:10.1186/1471-2148-7-64. ЧВК  1868726. PMID  17439656. Бесплатный полный текст
  15. ^ Генри, Ронни (ноябрь 2018 г.). «Этимология: Cronobacter sakazakii». Emerg Infect Dis. 24 (11). Дои:10.3201 / eid2411.et2411.

внешняя ссылка