Цитохром f - Cytochrome f

Apocytochr_F_C
PDB 1ci3 EBI.jpg
цитохром f из комплекса b6f Phormidium ламиносум
Идентификаторы
СимволApocytochr_F_C
PfamPF01333
Pfam кланCL0105
ИнтерПроIPR002325
PROSITEPDOC00169
SCOP21ctm / Объем / СУПФАМ
TCDB3.D.3
OPM суперсемейство92
Белок OPM3ч1дж

Цитохром ж является крупнейшим подразделением цитохром б6ж сложный (пластохинол - пластоцианинредуктаза; EC 1.10.99.1 ). По своей структуре и функциям комплекс цитохрома b6f имеет обширную аналогию с цитохромом b6f. комплекс цитохрома bc1 из митохондрии и фотосинтезирующие пурпурные бактерии. Цитохром f (cyt f) играет роль, аналогичную роли цитохрома c1, несмотря на их разные структуры.[1]

Трехмерная структура Brassica rapa (Репа ) cyt f.[2] Сегмент cyt f со стороны просвета включает два структурный домены: маленький над большим, который, в свою очередь, находится над прикреплением к мембранному домену. Большой домен состоит из антипараллельного бета-сэндвича и короткого гем-связывающего пептида, которые образуют трехслойный структура. Малый домен вставлен между бета-цепями F и G большого домена и является полностью бета-доменом. Гем гнездится между двумя короткими спирали на N конце cyt f. В течение второго спираль это мотив последовательности для цитохромов c-типа CxxCH (остатки 21-25), ковалентно прикреплен к гему через тиоэфир облигации к Cys-21 и Cys-24. His-25 - пятый гем утюг лиганд. Шестое гемовое железо лиганд представляет собой альфа-аминогруппу Tyr-1 в первой спирали.[2] Cyt f имеет внутреннюю сеть воды молекулы, которые могут функционировать как протонная проволока.[2] Вода цепь кажется консервированный особенность cyt f.

Рекомендации

  1. ^ Принц Р. К., Джордж Г. Н. (июнь 1995 г.). «Цитохром f выявлен». Trends Biochem. Наука. 20 (6): 217–8. Дои:10.1016 / S0968-0004 (00) 89018-0. PMID  7631417.
  2. ^ а б c Мартинес С.Е., Хуанг Д., Пономарев М., Крамер В.А., Смит Дж.Л. (июнь 1996 г.). «Гемовый окислительно-восстановительный центр цитохрома f хлоропласта связан с скрытой пятиводной цепью». Белковая наука. 5 (6): 1081–92. Дои:10.1002 / pro.5560050610. ЧВК  2143431. PMID  8762139.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR002325