DDX17 - DDX17

DDX17
Идентификаторы
ПсевдонимыDDX17, P72, RH70, DEAD-box геликаза 17
Внешние идентификаторыOMIM: 608469 MGI: 1914290 ГомолоГен: 101101 Генные карты: DDX17
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение DDX17
Геномное расположение DDX17
Группа22q13.1Начните38,483,438 бп[1]
Конец38,507,660 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDX17 208151 x at fs.png

PBB GE DDX17 208718 в формате fs.png

PBB GE DDX17 208719 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_030881
NM_001098504
NM_001098505
NM_006386

NM_001040187
NM_152806
NM_199079
NM_199080

RefSeq (белок)

NP_001091974
NP_006377

NP_001035277
NP_690019
NP_951061
NP_951062

Расположение (UCSC)Chr 22: 38,48 - 38,51 МбChr 15: 79,53 - 79,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX17 (p72) является фермент что у людей кодируется DDX17 ген.[5][6]

Функция

Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также рибосома и сплайсосома сборка. Основываясь на паттернах их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, который является АТФазой, активируемой различными видами РНК, но не дцДНК. Этот белок и белок, кодируемый геном DDX5, более тесно связаны друг с другом, чем с любым другим членом семейства DEAD-боксов. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует 2 варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, причем более длинный транскрипт, как сообщается, также инициирует трансляцию в стартовом сайте, отличном от AUG (CUG).[6]

Взаимодействия

DDX17 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100201 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055065 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ламм Г.М., Николь С.М., Фуллер-Пейс Ф.В., Ламонд А.И. (декабрь 1996 г.). «p72: ядерный белок DEAD-бокса человека, очень связанный с p68». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (19): 3739–47. Дои:10.1093 / nar / 24.19.3739. ЧВК  146168. PMID  8871553.
  6. ^ а б "Ген Entrez: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) полипептид 17".
  7. ^ Огилви В.К., Уилсон Б.Дж., Николь С.М., Моррис Н.А., Сондерс Л.Р., Барбер Г.Н., Фуллер-Пейс Ф.В. (2003). «Родственные DEAD-бокс-РНК-геликазы p68 и p72 существуют в клетках как гетеродимеры». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (5): 1470–80. Дои:10.1093 / нар / gkg236. ЧВК  149829. PMID  12595555.
  8. ^ Wilson BJ, Giguère V (ноябрь 2007 г.). «Идентификация новых партнеров пути геликаз РНК p68 и p72 с помощью метаанализа Oncomine». BMC Genomics. 8: 419. Дои:10.1186/1471-2164-8-419. ЧВК  3225811. PMID  18005418.
  9. ^ Уилсон Б.Дж., Бейтс Г.Дж., Никол С.М., Грегори Д.Д., Перкинс Н.Д., Фуллер-Пейс Ф.В. (август 2004 г.). «РНК-геликазы DEAD-бокса p68 и p72 взаимодействуют с HDAC1 и подавляют транскрипцию промотор-специфическим образом». BMC Mol. Биол. 5: 11. Дои:10.1186/1471-2199-5-11. ЧВК  514542. PMID  15298701.

дальнейшее чтение