DDX46 - DDX46

DDX46
Идентификаторы
ПсевдонимыDDX46, PRPF5, Prp5, DEAD-box геликаза 46
Внешние идентификаторыOMIM: 617848 MGI: 1920895 ГомолоГен: 5430 Генные карты: DDX46
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение DDX46
Геномное расположение DDX46
Группа5q31.1Начинать134,758,771 бп[1]
Конец134,855,133 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDX46 202462 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001300860
NM_014829

NM_001282055
NM_145975

RefSeq (белок)

NP_001287789
NP_055644

NP_001268984

Расположение (UCSC)Chr 5: 134,76 - 134,86 МбChr 13: 55.64 - 55.68 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX46 является фермент что у людей кодируется DDX46 ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков DEAD-бокса. Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом. На основании паттернов их распространения некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также росте и делении клеток. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом комплекса 17S U2 snRNP; он играет важную роль в сплайсинге пре-мРНК.[5]

Взаимодействия

DDX46 был показан взаимодействовать с SF3A2.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145833 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021500 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: DDX46 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) полипептид 46».
  6. ^ Will CL, Urlaub H, Achsel T., Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (сентябрь 2002 г.). «Характеристика новых белков snRNP SF3b и 17S U2, включая гомолог человеческого Prp5p и белок DEAD-бокса SF3b». EMBO J. 21 (18): 4978–88. Дои:10.1093 / emboj / cdf480. ЧВК  126279. PMID  12234937.

дальнейшее чтение