DHX38 - DHX38

DHX38
Идентификаторы
ПсевдонимыDHX38, DDX38, PRP16, PRPF16, DEAH-box геликаза 38, RP84
Внешние идентификаторыOMIM: 605584 MGI: 1927617 ГомолоГен: 8512 Генные карты: DHX38
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение DHX38
Геномное расположение DHX38
Группа16q22.2Начните72,093,613 бп[1]
Конец72,112,912 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DHX38 209178 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_014003

NM_178380

RefSeq (белок)

NP_054722

NP_848467

Расположение (UCSC)Chr 16: 72.09 - 72.11 МбChr 8: 109,55 - 109,57 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пре-мРНК-фактор сплайсинга АТФ-зависимая РНК-геликаза PRP16 является фермент что у людей кодируется DHX38 ген.[5][6][7]

МЕРТВАЯ коробка белки, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), предположительно РНК геликасы. Они вовлечены в ряд клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерная и митохондриальный сращивание, и рибосома и сборка сплайсосом. Судя по структуре распространения, некоторые члены этой семьи участвуют в эмбриогенез, сперматогенез, а также рост и деление клеток. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства факторов сплайсинга DEAD / H box. Этот белок больше похож на дрожжевой Prp16, чем другие члены семейства DEAD / H. Это АТФаза, необходимая для каталитический шаг II в процессе сплайсинга пре-мРНК.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000140829 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037993 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Чжоу З., Рид Р. (июнь 1998 г.). «Человеческие гомологи дрожжевых prp16 и prp17 демонстрируют сохранение механизма каталитического этапа II сплайсинга пре-мРНК». EMBO J. 17 (7): 2095–106. Дои:10.1093 / emboj / 17.7.2095. ЧВК  1170554. PMID  9524131.
  6. ^ Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси И., Охара О, Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (май 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК Res. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
  7. ^ а б «Ген Entrez: полипептид 38 DHX38 DEAH (Asp-Glu-Ala-His)».

дальнейшее чтение