DMAP1 - DMAP1

DMAP1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3HM5, 4IEJ
Идентификаторы
Псевдонимы	DMAP1, DNMAP1, DNMTAP1, EAF2, MEAF2, SWC4, белок 1, связанный с ДНК-метилтрансферазой 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605077 MGI: 1913483 ГомолоГен: 41311 Генные карты: DMAP1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	44,220,681 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 4 (мышь)
Конец	117,682,273 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • РНК-полимераза II репрессирует связывание фактора транскрипции; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • Связывание ДНК;
Сотовый компонент	• вилка репликации; • цитоплазма; • Комплекс гистонацетилтрансферазы NuA4; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • цитозоль;
Биологический процесс	• ремоделирование хроматина; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • Метилирование ДНК; • регулирование роста; • реакция на этанол; • Ремонт ДНК; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • ацетилирование гистона H4; • ацетилирование гистона H2A; • организация хроматина; • положительная регуляция импорта белка в ядро;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55929
	66233
	ENSG00000178028
	ENSMUSG00000009640
	Q9NPF5; Q5TG37
	Q9JI44
	NM_001034023; NM_001034024; NM_019100
	NM_023178
	NP_001029195; NP_001029196; NP_061973
	NP_075667
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

ДНК-метилтрансфераза 1-ассоциированный белок 1 является фермент что у людей кодируется DMAP1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген кодирует субъединицу нескольких отдельных комплексов, участвующих в репрессии или активации транскрипции. Кодируемый белок может независимо репрессировать транскрипцию и нацелен на очаги репликации на протяжении S-фазы путем непосредственного взаимодействия с N-концом ДНК-метилтрансферазы 1. Во время поздней S-фазы к этому комплексу добавляется гистондеацетилаза 2, обеспечивая средство для деацетилирования гистонов в транскрипционно неактивный гетерохроматин после репликации. Кодируемый белок также является компонентом ацетилтрансферазы нуклеосомы комплекса H4 и взаимодействует, среди прочего, с геном 101 восприимчивости опухоли к корепрессору транскрипции и белком 6, ассоциированным с проапоптотической смертью. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие один и тот же белок.^[7]

Взаимодействия

DMAP1 продемонстрировал взаимодействовать с участием:

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178028 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009640 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Раунтри М.Р., Бахман К.Э., Бейлин С.Б. (август 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор, DMAP1, с образованием комплекса в фокусах репликации». Нат Жене. 25 (3): 269–77. Дои:10.1038/77023. PMID 10888872.
^ Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID 10718198.
^ ^а ^б «Ген Entrez: белок 1, связанный с ДНК-метилтрансферазой 1 DMAP1».
^ Делгермаа Л., Хаяси Н., Доржсурен Д., Номура Т., Туи ле Т.Т., Мураками С. (октябрь 2004 г.). «Субклеточная локализация белка, опосредующего RPB5, и его предполагаемого функционального партнера». Мол. Cell. Биол. 24 (19): 8556–66. Дои:10.1128 / MCB.24.19.8556-8566.2004. ЧВК 516735. PMID 15367675.
^ Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (июль 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор, DMAP1, с образованием комплекса в фокусах репликации». Nat. Genet. 25 (3): 269–77. Дои:10.1038/77023. PMID 10888872.
^ Синь Х, Юн Х. Г., Сингх ПБ, Вонг Дж., Цинь Дж. (Март 2004 г.). «Компоненты пути, поддерживающего модификацию гистонов и связывание гетерохроматинового белка 1 в перицентрическом гетерохроматине в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 279 (10): 9539–46. Дои:10.1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.
^ Лю З., Фишер Р.А. (апрель 2004 г.). «RGS6 взаимодействует с DMAP1 и DNMT1 и ингибирует активность репрессора транскрипции DMAP1». J. Biol. Chem. 279 (14): 14120–8. Дои:10.1074 / jbc.M309547200. PMID 14734556.

дальнейшее чтение

Дойон И, Коте Ж (2004). «Высококонсервативный и многофункциональный комплекс NuA4 HAT». Curr. Мнение. Genet. Dev. 14 (2): 147–54. Дои:10.1016 / j.gde.2004.02.009. PMID 15196461.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
Ян К.С., Вайнер Х (2002). «Двухгибридный скрининг дрожжей выявляет партнеров по связыванию Tom34 человека, которые обладают АТФазной активностью и образуют комплекс с Tom34 в цитозоле». Arch. Biochem. Биофизы. 400 (1): 105–10. Дои:10.1006 / abbi.2002.2778. PMID 11913976.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Цай Й, Джин Дж, Томомори-Сато С. и др. (2003). «Идентификация новых субъединиц мультибелкового TRRAP / TIP60-содержащего гистонацетилтрансферазного комплекса млекопитающих». J. Biol. Chem. 278 (44): 42733–6. Дои:10.1074 / jbc.C300389200. PMID 12963728.
Xin H, Yoon HG, Singh PB и др. (2004). «Компоненты пути, поддерживающего модификацию гистонов и связывание гетерохроматинового белка 1 в перицентрическом гетерохроматине в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 279 (10): 9539–46. Дои:10.1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Лю З., Фишер Р.А. (2004). «RGS6 взаимодействует с DMAP1 и DNMT1 и ингибирует активность репрессора транскрипции DMAP1». J. Biol. Chem. 279 (14): 14120–8. Дои:10.1074 / jbc.M309547200. PMID 14734556.
Дойон Ю., Селлек В., Лейн В.С. и др. (2004). «Структурная и функциональная консервация комплекса гистонацетилтрансферазы NuA4 от дрожжей до человека». Мол. Cell. Биол. 24 (5): 1884–96. Дои:10.1128 / MCB.24.5.1884-1896.2004. ЧВК 350560. PMID 14966270.
Муромото Р., Сугияма К., Такачи А. и др. (2004). «Физические и функциональные взаимодействия между Daxx и ДНК-метилтрансферазой 1-ассоциированным белком, DMAP1». J. Immunol. 172 (5): 2985–93. Дои:10.4049 / jimmunol.172.5.2985. PMID 14978102.
Муромото Р., Сугияма К., Ямамото Т. и др. (2004). «Физические и функциональные взаимодействия между Daxx и TSG101». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 316 (3): 827–33. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.02.126. HDL:2115/28120. PMID 15033475.
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Делгермаа Л., Хаяши Н., Доржсурен Д. и др. (2004). «Субклеточная локализация белка, опосредующего RPB5, и его предполагаемого функционального партнера». Мол. Cell. Биол. 24 (19): 8556–66. Дои:10.1128 / MCB.24.19.8556-8566.2004. ЧВК 516735. PMID 15367675.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК 528930. PMID 15489336.
Цай Й, Джин Дж, Флоренс Л. и др. (2005). «Белок YL1 млекопитающих является общей субъединицей гистонацетилтрансферазы TRRAP / TIP60 и комплексов SRCAP». J. Biol. Chem. 280 (14): 13665–70. Дои:10.1074 / jbc.M500001200. PMID 15647280.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178028 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009640 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10888872-5] Раунтри М.Р., Бахман К.Э., Бейлин С.Б. (август 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор, DMAP1, с образованием комплекса в фокусах репликации». Нат Жене. 25 (3): 269–77. Дои:10.1038/77023. PMID 10888872.

[pmid10718198-6] Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID 10718198.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: белок 1, связанный с ДНК-метилтрансферазой 1 DMAP1».

[pmid15367675-8] Делгермаа Л., Хаяси Н., Доржсурен Д., Номура Т., Туи ле Т.Т., Мураками С. (октябрь 2004 г.). «Субклеточная локализация белка, опосредующего RPB5, и его предполагаемого функционального партнера». Мол. Cell. Биол. 24 (19): 8556–66. Дои:10.1128 / MCB.24.19.8556-8566.2004. ЧВК 516735. PMID 15367675.

[autogenerated1-9] Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (июль 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор, DMAP1, с образованием комплекса в фокусах репликации». Nat. Genet. 25 (3): 269–77. Дои:10.1038/77023. PMID 10888872.

[pmid14665632-10] Синь Х, Юн Х. Г., Сингх ПБ, Вонг Дж., Цинь Дж. (Март 2004 г.). «Компоненты пути, поддерживающего модификацию гистонов и связывание гетерохроматинового белка 1 в перицентрическом гетерохроматине в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 279 (10): 9539–46. Дои:10.1074 / jbc.M311587200. PMID 14665632.

[pmid14734556-11] Лю З., Фишер Р.А. (апрель 2004 г.). «RGS6 взаимодействует с DMAP1 и DNMT1 и ингибирует активность репрессора транскрипции DMAP1». J. Biol. Chem. 279 (14): 14120–8. Дои:10.1074 / jbc.M309547200. PMID 14734556.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]