База данных конформационного разнообразия белков - Database of protein conformational diversity

PCDB
Database.png
Содержание
Описаниеконформационный белок разнообразие.
Контакт
Исследовательский центрUniversidad Nacional de Quilmes
ЛабораторияCentro de Estudios e Investigaciones
АвторыЭсекьель I Юриц
Основное цитированиеЮриц и др. (2011)[1]
Дата выхода2010
Доступ
Интернет сайтhttp://www.pcdb.unq.edu.ar

База данных конформационного разнообразия белков (PCDB) - это база данных разнообразия белковые третичные структуры в белковые домены как определено Рентгеновская кристаллография.[1][2] Белки по своей природе гибкий и эта база данных собирает информацию по этому вопросу для использования в молекулярных исследованиях. Он использует База данных CATH в качестве источника структур для каждого белка и сообщает о диапазоне различий в структурах на основе их суперпозиции и сообщает о максимальном RMSD. Интерфейс базы данных позволяет исследователям находить белки с различной конформационной гибкостью, позволяя, например, находить очень гибкие белки. База данных ведется и поддерживается группой исследователей из Universidad Nacional de Quilmes в Аргентине.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Юриц Э.И., Альберти С.Ф., Паризи Г.Д. (январь 2011 г.). «PCDB: база данных конформационного разнообразия белков». Нуклеиновые кислоты Res. 39 (Выпуск базы данных): D475–9. Дои:10.1093 / nar / gkq1181. ЧВК  3013735. PMID  21097895.
  2. ^ Гальперин М.Ю., Кокрановский Г.Р. (январь 2011 г.). "Выпуск базы данных исследований нуклеиновых кислот 2011 г. и онлайн-сборник базы данных по молекулярной биологии". Нуклеиновые кислоты Res. 39 (Проблема с базой данных): D1–6. Дои:10.1093 / nar / gkq1243. ЧВК  3013748. PMID  21177655.

внешняя ссылка

  • Юриц, Эсекьель Иван; Фернандес Альберти, Себастьян; Паризи, Густаво Дани. «Конформационная база данных белков». Группа структурной биоинформатики; Национальный университет Кильмеса. Архивировано из оригинал на 2012-03-30. Получено 2011-08-19.